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Merck

17-625

Sigma-Aldrich

ChIPAb+-Trimethyl-Histon H3 (Lys9) - durch ChIP validiertes Antikörper- und Primer-Set

from rabbit

Synonym(e):

H3K9me3, Histone H3 (tri methyl K9), Histone H3K9me3

Anmeldenzur Ansicht organisationsspezifischer und vertraglich vereinbarter Preise


About This Item

UNSPSC-Code:
12352203
eCl@ss:
32160702
NACRES:
NA.41

Biologische Quelle

rabbit

Qualitätsniveau

Klon

polyclonal

Speziesreaktivität

human, mouse, vertebrates

Hersteller/Markenname

ChIPAb+
Upstate®

Methode(n)

ChIP: suitable
dot blot: suitable
western blot: suitable

NCBI-Hinterlegungsnummer

UniProt-Hinterlegungsnummer

Versandbedingung

dry ice

Angaben zum Gen

human ... H3F3B(3021)

Verwandte Kategorien

Allgemeine Beschreibung

Alle ChIPAb+-Antikörper werden einzeln (jede Charge, jedes Mal) für die Chromatin-Immunpräzipitation validiert. Jedes ChIPAb+-Antikörper-Set enthält Kontrollprimer (jede Charge wurde durch qPCR geprüft), um Ihre IP-Ergebnisse im stellenspezifischen Kontext biologisch zu validieren. Das qPCR-Protokoll und die Primer-Sequenzen werden bereitgestellt, was es Forschenden ermöglicht, ChIP-Protokolle zu validieren, wenn sie unseren Antikörper in ihrem Chromatin-Kontext nutzen. Jedes Set enthält außerdem einen Negativkontrolle-Antikörper, um die Spezifizität der ChIP-Reaktion zu gewährleisten.
Das ChIPAb+-Trimethyl-Histon-H3(Lys9)-Set enthält den Anti-Trimethyl-Histon-H3(Lys9)-Antikörper, einen Negativkontrolle-Antikörper (aufgereinigtes Kaninchen-IgG) und qPCR-Primer, die eine 117-bp-Region innerhalb des 3’-Endes des humanen ZNF554-Gens amplifizieren. Das Trimethyl-Histon H3 (Lys9) und die Negativkontrolle-Antikörper werden in skalierbarer „je ChIP“-Reaktionsgröße geliefert und können verwendet werden, um die Ausfällung von Trimethyl-Histon-H3(Lys9)-assoziiertem Chromatin funktionell zu validieren.
Die Methylierung von Histonen kann an zwei verschiedenen Resten erfolgen: Arginin oder Lysin. Die Histon-Methylierung kann, abhängig vom methylierten Rest, mit einer Transkriptionsaktivierung oder -unterdrückung in Zusammenhang stehen. Lysin 9 von Histon H3 kann durch verschiedene Histon-Methyltransferasen (HMT) wie SuvH39H1 oder G9a mono-, di- oder trimethyliert werden. Dieses methylierte Lysin kann durch Histon-Demethylasen wie JMJD1A, LSD1 oder JMJD2C demethyliert werden. Die Methylierung dieses Rests ist primär mit der Transkriptionsunterdrückung assoziiert.

Spezifität

Die Immunogensequenz ist bei einem breiten Spektrum von Tier- und Pflanzenspezies identisch, weshalb eine weitreichende Kreuzreaktivität erwartet wird.
Erkennt Histon H3, Molekülmasse 17 kDa, an Lysin 9 trimethyliert.

Immunogen

Der aufgereinigte Trimethyl-Histon-H3(Lys9)-Antikörper wurde gegen an BSA konjugiertes, synthetisches Peptid, das die Sequenz …AR[me3K]S… enthält, wobei me3K dem Trimethyl-Lysin 9 von humanem Histon H3 entspricht, entwickelt.

Anwendung

Chromatin-Immunpräzipitation:
Beschalltes Chromatin, das aus 2 x 106 HeLa-Zellen hergestellt wurde, wurde einer Chromatin-Immunpräzipitation mit 4 μg aufgereinigtem Antikörper oder normalem Kaninchen-IgG und dem Magna ChIP A Kit (Katalognr. 17-610) unterzogen.
Die erfolgreiche Anreicherung von mit Trimethyl-Histon H3 (Lys9) assoziierten DNA-Fragmenten wurde durch qPCR mit ChIP-Primern für GAPDH, die den humanen GAPDH-Promotor flankieren, und Primern, die auf den Promotor von humanem MyoD abzielen, verifiziert.
Bitte beziehen Sie sich für experimentelle Details auf die Protokolle für das EZ-Magna ChIP A Kit (Katalognr. 17-408) oder EZ-ChIP Kit (Katalognr. 17-371).

Western-Blot-Analyse:
Rekombinantes Histon H3 (Bahn 1) und HeLa-Säureextrakte (Bahn 2) wurden durch Elektrophorese aufgelöst, auf Nitrocellulose übertragen und mit Anti-Trimethyl-Histon H3 (Lys9) (1 μg/ml) geprüft. Die Proteine wurden mit einem an HRP konjugierten Anti-Kaninchen-Sekundärantikörper der Ziege und einem Chemilumineszenz-Nachweissystem veranschaulicht (siehe Abbildungen).

Beadlyte Histon-Peptid-Spezifitätsassay:
0,5 μg/ml aufgereinigter Anti-Dimethy-Histon H3 (Lys9) wurde mit einem an Histon H3-Peptide mit folgenden Modifikationen konjugierten Mikrosphären-Cocktail inkubiert:
1. Trimethyl-Lysin 9
2. Dimethyl-Lysin 9
3. Monomethyl-Lysin 9
4. Nichtmodifiziertes H3
Der ungebundene Antikörper wurde anschließend durch Filtration entfernt. Peptid-Antikörper-Komplexe wurden mit einem an PE konjugierten Anti-Kaninchen-Sekundärantikörper inkubiert. Die Fluoreszenz wurde auf einem Luminex 100-Instrument gemessen. Die mittlere Fluoreszenzintensität (MFI) wird grafisch dargestellt.
Durch ChIP validiertes Trimethyl-Histon H3 (Lys9)-Antikörper- und Primer-Set, einschließlich Antikörper in ChIP-Qualität und spezifische Kontroll-PCR-Primer für die Chromatin-Immunpräzipitation von H3K9Me3.

Komponenten

Polyklonaler Anti-Trimethyl-Histon-H3(Lys9)-Antikörper, 1 Fläschchen

ZNF554-Primer-Set, 1 Fläschchen

Qualität

Chromatin-Immunpräzipitation:
Beschalltes Chromatin aus 3 x 106 NIH/3T3-L1-Zellen wurde einer Chromatin-Immunpräzipitation mit entweder 4 µg normalem Kaninchen-IgG oder Anti-Trimethyl-Histon-H3(Lys9)-Antikörper und dem Magna ChIP A Kit (Katalognr. 17-610) unterzogen. Die erfolgreiche Anreicherung von mit Acetyl-Histon-H3(Lys9) assoziierten DNA-Fragmenten wurde durch qPCR mit ChIP-Primern für ZNF554 verifiziert (siehe Abbildungen).
Bitte beziehen Sie sich für experimentelle Details auf das Protokoll für EZ-Magna A ChIP (Katalognr. 17-408) oder EZ-ChIP (Katalognr. 17-371).

Zielbeschreibung

17 kDa

Physikalische Form

Anti-Trimethyl-Histon H3 (Lys9) (polyklonales Kaninchen-IgG). Ein Fläschchen mit 100 μg mit Protein A aufgereinigtem IgG in 100 μl 0,02-mol/l-Phosphatpuffer, pH-Wert 7,4, 0,25 mol/l NaCl mit 0,05 % Natriumazid und 30 % Glycerin. Bei -20 °C aufbewahren.

Normales Kaninchen-IgG. Ein Fläschchen mit 125 μg normalem Kaninchen-IgG in 125 μl Lagerpuffer mit 0,1 % Natriumazid. Bei -20 °C aufbewahren.

ChIP-Primer, ZNF554. Ein Fläschchen mit 75 μl von 5 μmol/l jedes Primers, spezifisch für ZNF554. Bei -20 °C aufbewahren.
FÜR: CGG GGA AAA GCC CTA TAA AT
REV: TCC ACA TTC ACT GCA TTC GT
Format: Aufgereinigt

Hinweis zur Analyse

Kontrolle
Einschließlich Kaninchen-IgG-Antikörper als Negativkontrolle und für ZNF554 spezifische Kontrollprimer.

Rechtliche Hinweise

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Lagerklassenschlüssel

10 - Combustible liquids


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Dicer independent small RNAs associate with telomeric heterochromatin.
Cao, F; Li, X; Hiew, S; Brady, H; Liu, Y; Dou, Y
RNA null
The many faces of histone lysine methylation.
Lachner, Monika and Jenuwein, Thomas
Current Opinion in Cell Biology, 14, 286-298 (2002)
Alba Millanes-Romero et al.
Molecular cell, 52(5), 746-757 (2013-11-19)
Although heterochromatin is enriched with repressive traits, it is also actively transcribed, giving rise to large amounts of noncoding RNAs. Although these RNAs are responsible for the formation and maintenance of heterochromatin, little is known about how their transcription is
Chelsea Herdman et al.
PLoS genetics, 13(7), e1006899-e1006899 (2017-07-18)
Transcription of the several hundred of mouse and human Ribosomal RNA (rRNA) genes accounts for the majority of RNA synthesis in the cell nucleus and is the determinant of cytoplasmic ribosome abundance, a key factor in regulating gene expression. The
Long term transcriptional reactivation of epigenetically silenced genes in colorectal cancer cells requires DNA hypomethylation and histone acetylation.
Mossman, D; Scott, RJ
Testing null

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