ホームがん研究乳がん研究用Prestige Antibodies^®（Prestige抗体）

乳がん研究用Prestige Antibodies^®（Prestige抗体）

Human Protein Atlas
Atlas Antibodies社のPrestige Antibodies^®（Prestige抗体）
モノクローナル抗体の開発
臨床マーカー（ESR1、HER2、Ki67、PGR）
乳がん研究で使用されるPrestige抗体
MammaPrint、Oncotype、EndoPredictおよびuPA検査における遺伝子産物に対する抗体
Human Protein Atlasで同定されている抗体

乳がん研究用Prestige Antibodies^®（Prestige抗体）カタログ（PDF）のダウンロード

Human Protein Atlas

Human Protein Atlasではヒトプロテオームの特性評価を実施

Human Protein Atlas（HPA）プロジェクトは、2003年に、Knut and Alice Wallenberg Foundationから資金提供を受け、Mathias Uhlén教授を代表とするスウェーデンの研究者によって開始されました^1,2。抗体を使用してヒトプロテオームを系統的に探索する世界トップレベルのユニークな取り組みです。

HPAプロジェクトの目的は、完全なヒトプロテオームの発現マップを提示することです。この目的を達成するため、ヒト遺伝子がコードするすべてのタンパク質に対して特異性の高いポリクローナル抗体が開発され、組織アレイを用いて多数の組織および細胞についてタンパク質プロファイリングが確立されています。使用されているアプリケーションは、免疫組織染色（IHC）、ウェスタンブロッティング（WB）、タンパク質アレイ、および共焦点免疫蛍光顕微鏡法（ICC-IF）です。

2014年11月のHuman Protein Atlas

2014年11月に公開されたHuman Protein Atlasのバージョン13では、組織ベースの完全なヒトプロテオームのマップが示されています。広範なデータはTissue Atlas、Cancer Atlas、Subcell Atlas、Cell Line Atlasの4つの「サブアトラス」に分割されています。Tissue Atlasに示されたすべてのタンパク質の発現プロファイルは、多数のヒト組織について行ったIHC分析に基づいています。現在では、各遺伝子についてRNAシーケンシングデータと相関させたタンパク質発現データも掲載されています。Cancer Atlasでは、多数のがんの差次的発現遺伝子を検討することができ、Subcell Atlasでは、共焦点顕微鏡法により細胞内局在性が示されています。 Cell Line Atlasには、一般的な細胞株でのタンパク質発現に関する追加情報が含められており、それは、研究のための有用な情報源として高く評価されています。

本プロジェクトでは、48の正常なヒト組織、20のがん型、および44のヒト細胞株のサンプルが含まれる組織マイクロアレイが使用されています。48の正常組織データは各3試料で表示されており、82の細胞型が示されています。正常組織の画像データにはすべて、病理検査に基づく発現量のアノテーションが付与されており、そのデータは正常なTissue Atlas上に表示され、mRNAおよびタンパク質レベルでヒト遺伝子の発現プロファイルの情報を得ることができます。 mRNA発現データは27の正常な主要組織型のRNAディープシーケンシグ（RNA-Seq）から得られたものです。

Cancer Atlasには、多数のヒトがん標本のタンパク質発現パターンに基づいた遺伝子発現データが含まれています。もっともよくみられる20のヒトがん型に対応する、全体で216のがんサンプルが、含められた全遺伝子について分析されています。すべてのがん組織画像データは病理学者が手動でアノテーションを付与しており、標準Tissue Atlasに限っても、タンパク質データには、16,621個の遺伝子に対応するタンパク質発現量データが含まれており、それぞれについて適切な抗体が提供されています。

乳房組織サンプルおよび細胞株を用いたバリデーション

標準Tissue Atlasの各抗体について、3個体から得られた正常乳房サンプルのIHC画像データが提供されています。さらに、各抗体について、最高12例の患者から各2試料採取した乳がんサンプルのデータがCancer Atlasに提示されており、大半の抗体について、MCF-7およびSK-BR-3乳房細胞株から得られた画像データもCell Line Atlasに提示されています。

参考文献

Uhlen M, Oksvold P, Fagerberg L, Lundberg E, Jonasson K, Forsberg M, Zwahlen M, Kampf C, Wester K, Hober S, et al. 2010. Towards a knowledge-based Human Protein Atlas. Nat Biotechnol. 28(12):1248-1250. https://doi.org/10.1038/nbt1210-1248

Uhlen M, Ponten F, Lindskog C. 2015. Charting the human proteome: Understanding disease using a tissue-based atlas. Science. 347(6227):1274-1274. https://doi.org/10.1126/science.347.6227.1274-c

Atlas Antibodies社のPrestige Antibodies^®（Prestige抗体）

Prestige抗体 – HPAの構成要素

Prestigeポリクローナル抗体が他のタンパク質に対して独自性があり、交差反応性が低いのは、抗原領域の綿密な選択、リコンビナント抗原のアフィニティー精製、複数の方法と厳格な承認プロセスを使用したバリデーションを行っているためです。

製品開発

Prestige抗体は、約50～150個のアミノ酸からなるリコンビナントヒトタンパク質エピトープタグ（Protein Epitope Signature Tag：PrEST）に対して作製します。特異性の高い抗体の産生に適した、天然タンパク質に存在する独特のエピトープを含めるため、独自のソフトウェアを用いてこれらのタンパク質フラグメントを設計しています。他のヒトタンパク質に対する相同性が最も低いPrESTを確実に抗原として使用するため、完全ヒトゲノムスキャニングを行って、このような設計を行います。

認可

Prestige抗体は、IHC、WBまたはICC-IFの試験結果を組み合わせたバリデーション、RNAシーケンシング、ならびにバイオインフォマティクス予測法および文献から得られる情報に基づいて認可しています。文献は決定的な結論がない場合が多いため、HPAプロジェクトの重要な方針として、同じタンパク質ターゲットに対して重複しないエピトープを有するペアの抗体を作製し、1つの抗体の結果とバリデーションをもう1つの抗体のバリデーションに使用できるようにしています。

Prestige抗体のラインナップ

現在、17,000以上のPrestigeポリクローナル抗体がラインナップされており、毎年2,000の新たな抗体が追加されています。

Human Protein Atlasプロジェクトで開発され、特性評価された抗体は、Prestige抗体およびAtlas抗体として提供されています。

モノクローナル抗体の開発

Prestige抗体には、選ばれたマウスモノクローナル抗体も含まれています。モノクローナル抗体も、毎年新製品が追加され、随時拡大しています。

独自の特徴

独特で重複のないエピトープおよび／またはアイソタイプのみを認識するクローンを提供するために、特別な注意を払っています。モノクローナル抗体は、ポリクローナル抗体と同じ厳格なPrEST製造工程および特性評価手順を経ているため、認可されたアプリケーションで優れた性能を発揮するとともに、明確な特異性を有し、連続性が保証されており、安定供給が可能です。概して、モノクローナル抗体は高い希釈倍率でもワークし、標準化された測定法に有用です。

クローンの選択

選択したハイブリドーマのサブクローニングと増殖の前に、多数のELISA陽性の細胞上清について機能特性の評価を行って、各アプリケーションに最適なクローンを選択しています。

エピトープマッピング

オーバーラップする合成ペプチドを用いて、ビーズベースのアレイ形式でエピトープマッピングを行い、重複のないエピトープのみを有するクローンを選択しています。

アイソタイピング

アイソタイプ特異的二次抗体を用いたマルチプレックスを可能にするため、すべてのモノクローナル抗体に対してアイソタイピングを行っています。

ハイブリドーマ細胞の培養

Atlas抗体には、マウスを使用して腹水を産生させる方法に替えて、製造スケールアップ期にはin vitro法を使用します。

抗体の特性評価

Prestigeモノクローナル抗体の特性検討は広範な文献検索から開始し、IHCによる特性評価に最も妥当性があり臨床的に有意な組織を選択します。 IHC適用データには、しばしば各抗体について複数の組織型を表示しています。陽性を示す染色組織に加えて、ネガティブコントロールの染色も表示し、必要に応じて臨床がん組織の染色を表示しています。

ウェスタンブロッティング（WB）による特性評価には、内在性のヒト細胞または組織のタンパク質ライセートの結果、あるいは一部製品ではリコンビナント全長ヒトタンパク質のライセートの結果を含めています。

各モノクローナル抗体は、このように、その特異的ターゲットに関して最も関連性の高い特性評価データを添付して供給します。

Prestigeポリクローナル抗体の製品番号は、「HPA」から始まり、モノクローナル抗体は「AMAB」から始まります。

臨床マーカー（ESR1、HER2、Ki67、PGR）

確立された臨床乳がんマーカー

製品番号	ターゲットタンパク質	製品名	バリデートされたアプリケーション
HPA000449	エストロゲン受容体	抗ESR1	IHC、WB
HPA000450	エストロゲン受容体	抗ESR1	IHC、WB
HPA004751	プロゲステロン受容体	抗PGR¹	IHC、ICC-IF
HPA008428	プロゲステロン受容体	抗PGR	IHC
HPA017176	プロゲステロン受容体	抗PGR	IHC
HPA001383	HER2/ERBB2	抗ERBB2	IHC、WB
AMAb90627	HER2/ERBB2	抗HER2	IHC、WB
HPA000451	Ki67/MKI67	抗MKI67²	IHC、ICC-IF
HPA001164	Ki67/MKI67	抗MKI67³	IHC、ICC-IF
AMAb90870	Ki67/MKI67	抗MKI67	IHC

Pereira CBL, Leal MF, de Souza CRT, Montenegro RC, Rey JA, Carvalho AA, Assumpção PP, Khayat AS, Pinto GR, Demachki S, et al. Prognostic and Predictive Significance of MYC and KRAS Alterations in Breast Cancer from Women Treated with Neoadjuvant Chemotherapy. PLoS ONE. 8(3):e60576. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0060576

Camilleri M, Carlson P, Zinsmeister AR, McKinzie S, Busciglio I, Burton D, Zucchelli M, D'Amato M. 2010. Neuropeptide S Receptor Induces Neuropeptide Expression and Associates With Intermediate Phenotypes of Functional Gastrointestinal Disorders. Gastroenterology. 138(1):98-107.e4. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2009.08.051

Roca H, Craig MJ, Ying C, Varsos ZS, Czarnieski P, Alva AS, Hernandez J, Fuller D, Daignault S, Healy PN, et al. 2011. IL-4 induces proliferation in prostate cancer PC3?cells under nutrient-depletion stress through the activation of the JNK-pathway and survivin upregulation. J. Cell. Biochem..n/a-n/a. https://doi.org/10.1002/jcb.24025

抗HER2（AMAb90627）を用いた乳がんの免疫組織染色では、HER2陽性乳管がんの腫瘍細胞に（中等度の細胞質陽性とともに）強い膜陽性が認められますが、HER2陰性乳管がんに膜陽性は認められません。HER2はウェスタンブロッティングによって乳がん細胞株K-BR-3で検出されます。

プロゲステロン受容体

正常なヒトの子宮組織を用いた抗PGR抗体（HPA004751）によるIHC染色では、腺細胞に強い核陽性が認められます。表示されている乳がんサンプルの腫瘍細胞の染色箇所も核です。ICC-IFでは、U-251MG細胞で核染色が認められます。

エストロゲン受容体

抗ESR1抗体（HPA000449）は、IHCにより、ヒト乳房組織の腺細胞および乳がんサンプルの腫瘍細胞で明確な核陽性を示します。

抗ESR1抗体（HPA000450）を用いたIHC染色では、ヒトの子宮組織の腺細胞および間質細胞、ならびに乳がんの腫瘍細胞に強力な核陽性が認められます。

Ki67

抗MKI67抗体（HPA000451）は、IHCにより、ヒトリンパ節の反応中心のわずかな細胞で強力な核陽性を示します。乳がんの腫瘍細胞の染色箇所も核であり、ICC-IFによるヒト細胞株U-2OSの染色では、核での陽性が認められます。

抗MKI67抗体（HPA001164）を用いたヒト扁桃組織のIHC染色では、反応中心細胞に核染色が認められます。乳がんの腫瘍細胞では、染色箇所は主に核であり、U-2OS細胞では、ICC-IFによって強力な核陽性が認められます。

モノクローナル抗MKI67抗体（AMAb90870）を用いたヒト結腸のリンパ節のIHC染色では、反応中心細胞の核と核小体に強力な免疫反応が認められます。子宮では、一部の腺細胞に核陽性が認められます。

乳がん研究で使用されるPrestige抗体

以下では、対応するターゲットタンパク質に対する参考文献／論文、または乳がん関連度に基づいて抗体を選択しています。

BRCA1

抗BRCA1抗体（HPA034966）はIHCにより、正常ヒト乳房組織の腺細胞および乳がんサンプルの腫瘍細胞で陽性を示します。

抗BRCA2抗体（HPA026815）を用いた正常ヒト乳房組織のIHC染色では、腺細胞で陽性が認められます。乳がんでは、腫瘍細胞の核染色が認められます。

ACAT1

抗ACAT1抗体（HPA004428）を用いたヒト肝組織のIHC染色では肝細胞に強力な細胞質陽性が認められます。ウェスタンブロッティングによって、ACAT1は、ヒト細胞株RT-4およびU251-MGならびに肝および扁桃組織ライセート中で検出されます。ヒト細胞株A-431ではICC-IFによって、ミトコンドリアで陽性が認められます。

CD44

抗CD44抗体（HPA005785）を用いたヒト食道組織のIHC染色では、扁平上皮細胞に強力な細胞質陽性および膜陽性が認められます。ウェスタンブロッティングによって、CD44はヒト細胞株U-251MGで検出されます。ヒト細胞株U-251MGでは、ICC-IFによって細胞膜に陽性が認められます。

製品番号	ターゲットタンパク質	製品名	バリデートされたアプリケーション
HPA008788	53BP1	抗TP53BP1	IHC、ICC-IF
HPA022133	53BP1	抗TP53BP1	IHC、WB*、ICC-IF
HPA004428	ACAT1	抗ACAT1^1.2	IHC、WB*、ICC-IF
HPA007569	ACAT1	抗ACAT1^2-4	IHC、WB、ICC-IF
HPA007912	AGR2	抗AGR2⁵	IHC、WB
HPA024210	AIB1/NCOA3	抗NCOA3	IHC、ICC-IF
AMAb90660	Anillin/ANLN	抗ANLN	IHC、WB
AMAb90662	Anillin/ANLN	抗ANLN	IHC、WB
HPA005680	Anillin/ANLN	抗ANLN⁶	IHC、WB、ICC-IF
HPA024006	ARG1	抗ARG1⁷	IHC、WB
HPA005468	ASAH1	抗ASAH1^8,9	IHC、WB
HPA028264	ATR	抗ATR	IHC
HPA029455	BAAT1/BRAT1	抗BRAT1	IHC、WB
HPA003175	BACH1	抗BACH1¹⁰	IHC、WB、ICC-IF
HPA028814	BAP1	抗BAP1	IHC、WB、ICC-IF
HPA044864	BARD1	抗BARD1	IHC、ICC-IF
HPA029159	β-Catenin	抗CTNNB1	IHC、WB*、ICC-IF
HPA029160	β-Catenin	抗CTNNB1	IHC、IF
HPA002317	BIRC3/API2	抗BIRC311	IHC、WB、ICC-IF
HPA012897	BIT1/ PTRH2	抗PTRH2^12,13	IHC、WB、ICC-IF
HPA005689	Blooms Syndrome Prot	抗BLM	IHC、ICC-IF
HPA030472	Bmi1	抗BMI1	IHC、WB*、ICC-IF
HPA034966	BRCA1	抗BRCA1	IHC
HPA026815	BRCA2	抗BRCA2	IHC、ICC-IF
HPA005474	BRIP1/FANCJ	抗BRIP1	IHC、WB、ICC-IF
HPA036596	C11orf51/ANAPC15	抗ANAPC15	IHC、WB、ICC-IF
HPA051365	CAR/NR1I3	抗NR1I3	IHC、ICC-IF
HPA001302	CASP8	抗CASP8	IHC、WB、ICC-IF
HPA005688	CASP8	抗CASP8	IHC、WB、ICC-IF
HPA008773	CAXII/CA12	抗CA12^14-17	IHC、WB
HPA005785	CD44	抗CD44^18-22	IHC、WB、ICC-IF
HPA028900	CD82	抗CD82	IHC、WB
HPA004812	CDH1	抗CDH1	IHC、ICC-IF
HPA019758	CEA/CEACAM5	抗CEACAM5	IHC、WB
HPA001878	CHEK2	抗CHEK2	IHC、WB
HPA001254	CKB	抗CKB	IHC
HPA004135	CRABP2	抗CRABP2	IHC、WB、ICC-IF
HPA015955	CTNND1	抗CTNND1	IHC、WB*、ICC-IF
HPA010663	CX32/GJB1	抗GJB1²³	IHC、WB
HPA018169	Cyclin E1	抗CCNE1	IHC、WB、ICC-IF
HPA020626	Cyclin A2	抗CCNA2	IHC、WB
HPA023040	Cytokeratin 14/CK14	抗KRT14	IHC、WB*、ICC-IF
HPA000452	Cytokeratin 17/CK17	抗KRT17²⁴	IHC、WB
HPA000453	Cytokeratin 17/CK17	抗KRT17	IHC、WB、ICC-IF
HPA000258	DACH2	抗DACH2²⁵	IHC、ICC-IF
HPA019907	DBC1/KIAA1967	抗KIAA1967	IHC、WB*、ICC-IF
HPA019943	DBC1/KIAA1967	抗KIAA1967	IHC、ICC-IF
HPA022962	DCAF7	抗DCAF7²⁶	IHC、WB
HPA003315	Decorin/DCN	抗DCN^27,28	IHC、WB
HPA028483	DIRAS3	抗DIRAS3	IHC、WB
HPA028557	DIRAS3	抗DIRAS3	IHC、WB
HPA029384	DIRAS3	抗DIRAS3	IHC
AMAb90816	EGFR	抗EGFR	IHC、WB
AMAb90819	EGFR	抗EGFR	WB
HPA001200	EGFR	抗EGFR²⁹	IHC
HPA018530	EGFR	抗EGFR³⁰	IHC、WB、ICC-IF
HPA003901	Endoplasmin/HSP90B1	抗HSP90B1^27,31	IHC、WB、ICC-IF
HPA002025	ERLIN2	抗ERLIN2^32,33	IHC、WB*、ICC-IF
HPA026676	ERFF/C1orf64	抗C1orf64³⁴	IHC、WB、ICC-IF
HPA007425	FAAH	抗FAAH³⁵	IHC、ICC-IF
HPA035305	FGFR2	抗FGRF2	IHC、WB、ICC-IF
HPA029731	GATA3	抗GATA3	IHC、WB
HPA009177	GCDFP/PIP	抗PIP	IHC、WB
HPA017046	GEF-H1	抗ARHGEF2^36,37	IHC、WB
HPA025226	GGH	抗GGH35	IHC、WB
HPA008763	Granulin	抗GRN38	IHC、ICC-IF、WB
HPA028747	Granulin	抗GRN38	IHC、ICC-IF
HPA001275	HIF-1α/HIF1A	抗HIF1A^39-42	IHC、ICC-IF
HPA008436	HJURP	抗HJURP^43-45	IHC、WB、ICC-IF
HPA004727	HMGCL	抗HMGCL2	IHC、WB
HPA008338	HMGCR	抗HMGCR⁴⁶	IHC
HPA021467	HSD17B14	抗HSD17B14	IHC、WB、ICC-IF
HPA000764	KLK3/PSA	抗KLK3^47,48	IHC
HPA019693	LSP1	抗LSP1	IHC、WB、ICC-IF
HPA001939	MMP2	抗MMP2	IHC
HPA004179	MUC1/CA15-3	抗MUC1	IHC、WB
HPA007235	MUC1/CA15-3	抗MUC1	IHC
HPA008855	MUC1/CA15-3	抗MUC1	IHC、ICC-IF
HPA001429	NBN	抗NBN	IHC、WB、ICC-IF
HPA030278	NRP1	抗NRP1	IHC
HPA029814	Oncostatin M	抗OSM⁴⁹	IHC、WB
AMAb90956	P53	抗P53	IHC、WB
HPA021241	PHGDH	抗PHGDH^50-52	IHC、WB*、ICC-IF
HPA031314	PGD	抗PGD	IHC、WB*
HPA006563	PKCα/PKCA	抗PKCA	IHC、WB*、ICC-IF
HPA006564	PKCα/PKCA	抗PKCA	IHC、WB*、ICC-IF
HPA003412	PLAT	抗PLAT	IHC、WB、ICC-IF
HPA006366	POLRMT	抗POLRMT⁵³	IHC
HPA020376	PSPH	抗PSPH50	IHC、WB
HPA047183	PTMA	抗PTMA	IHC、ICC-IF
HPA008890	PTTG1	抗PTTG1	IHC、ICC-IF
HPA037503	RAP80/UIMC1	抗UIMC1	IHC、WB
HPA037504	RAP80/UIMC1	抗UIMC1	IHC、WB、ICC-IF
HPA006079	REST	抗REST^54,55	IHC、ICC-IF
HPA003624	RBM3	抗RBM3^56,57	IHC、WB*、ICC-IF
AMAb90655	RBM3	抗RBM3^58-65	IHC、WB
HPA009026	RRBP1	抗RRBP1⁶⁶	IHC、ICC-IF、WB
HPA035857	rs4973768/SLC4A7	抗SLC4A7	IHC
HPA001893	SIX1	抗SIX1^67-74	IHC、WB、ICC-IF
AMAb90544	SIX1	抗SIX1	IHC、WB
HPA014404	SNCG	抗SNCG	IHC、WB
HPA017254	STK11	抗STK11	IHC、WB、ICC-IF
HPA002830	SURVIvin/BIRC5	抗BIRC5	IHC、WB、ICC-IF
HPA000500	T-STAR/KHDRBS3	抗KHDRBS3^75,76	IHC、WB
HPA004823	Tenascin C/TNC	抗TNC^77-79	IHC、WB
HPA003425	TFF1	抗TFF1^80-82	IHC、WB
HPA002982	THBD	抗THBD	IHC、WB
HPA019881	THEM2/ACOT13	抗ACOT13	IHC、WB*、ICC-IF
HPA006458	TOP2A	抗TOP2A	IHC、WB、ICC-IF
HPA026773	TOP2A	抗TOP2A	IHC、ICC-IF
HPA014405	UGT8	抗UGT8⁸³	IHC、ICC-IF
HPA007547	ULBP1	抗ULBP1⁸⁴	IHC
HPA023930	ZNF703	抗ZNF703³²	IHC、ICC-IF

* ヒトとげっ歯類の両サンプルのWB

参考文献

Sanchez-Alvarez R, Martinez-Outschoorn UE, Lin Z, Lamb R, Hulit J, Howell A, Sotgia F, Rubin E, Lisanti MP. 2013. Ethanol exposure induces the cancer-associated fibroblast phenotype and lethal tumor metabolism. Cell Cycle. 12(2):289-301. https://doi.org/10.4161/cc.23109

Martinez-Outschoorn UE, Lin Z, Whitaker-Menezes D, Howell A, Lisanti MP, Sotgia F. 2012. Ketone bodies and two-compartment tumor metabolism: Stromal ketone production fuels mitochondrial biogenesis in epithelial cancer cells. Cell Cycle. 11(21):3956-3963. https://doi.org/10.4161/cc.22136

Martinez-Outschoorn UE, Lin Z, Whitaker-Menezes D, Howell A, Sotgia F, Lisanti MP. 2012. Ketone body utilization drives tumor growth and metastasis. Cell Cycle. 11(21):3964-3971. https://doi.org/10.4161/cc.22137

Chang HT, Olson L, Schwartz KA. 2013. Ketolytic and glycolytic enzymatic expression profiles in malignant gliomas: implication for ketogenic diet therapy. Nutrition & Metabolism. 10(1):47. https://doi.org/10.1186/1743-7075-10-47

Hrstka R, Brychtova V, Fabian P, Vojtesek B, Svoboda M. 2013. AGR2 Predicts Tamoxifen Resistance in Postmenopausal Breast Cancer Patients. Disease Markers. 35207-212. https://doi.org/10.1155/2013/761537

O´Leary PC, Penny SA, Dolan RT, Kelly CM, Madden SF, Rexhepaj E, Brennan DJ, McCann AH, Pontén F, Uhlén M, et al. 2013. Systematic antibody generation and validation via tissue microarray technology leading to identification of a novel protein prognostic panel in breast cancer. BMC Cancer. 13(1): https://doi.org/10.1186/1471-2407-13-175

de Boniface J, Mao Y, Schmidt-Mende J, Kiessling R, Poschke I. 2012. Expression patterns of the immunomodulatory enzyme arginase 1 in blood, lymph nodes and tumor tissue of early-stage breast cancer patients. OncoImmunology. 1(8):1305-1312. https://doi.org/10.4161/onci.21678

Lucki NC, Li D, Bandyopadhyay S, Wang E, Merrill AH, Sewer MB. 2012. Acid Ceramidase (ASAH1) Represses Steroidogenic Factor 1-Dependent Gene Transcription in H295R Human Adrenocortical Cells by Binding to the Receptor. Molecular and Cellular Biology. 32(21):4419-4431. https://doi.org/10.1128/mcb.00378-12

Liang Y, Wu H, Lei R, Chong RA, Wei Y, Lu X, Tagkopoulos I, Kung S, Yang Q, Hu G, et al. 2012. Transcriptional Network Analysis Identifies BACH1 as a Master Regulator of Breast Cancer Bone Metastasis. J. Biol. Chem.. 287(40):33533-33544. https://doi.org/10.1074/jbc.m112.392332

10.

Scheper M, Almubarak H, Jones A, Chaisuparat R, Zhang M, Meiller T. 2011. Zoledronic acid directly suppresses cell proliferation and induces apoptosis in highly tumorigenic prostate and breast cancers. J Carcinog. 10(1):2. https://doi.org/10.4103/1477-3163.75723

11.

Brunquell C, Biliran H, Jennings S, Ireland SK, Chen R, Ruoslahti E. 2012. TLE1 Is an Anoikis Regulator and Is Downregulated by Bit1 in Breast Cancer Cells. Molecular Cancer Research. 10(11):1482-1495. https://doi.org/10.1158/1541-7786.mcr-12-0144

12.

Karmali PP, Brunquell C, Tram H, Ireland SK, Ruoslahti E, Biliran H. Metastasis of Tumor Cells Is Enhanced by Downregulation of Bit1. PLoS ONE. 6(8):e23840. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0023840

13.

Vermeulen JF, van Brussel AS, van der Groep P, Morsink FH, Bult P, van der Wall E, van Diest PJ. 2012. Immunophenotyping invasive breast cancer: paving the road for molecular imaging. BMC Cancer. 12(1): https://doi.org/10.1186/1471-2407-12-240

14.

Davidson B, Stavnes HT, Holth A, Chen X, Yang Y, Shih I, Wang T. 2011. Gene expression signatures differentiate ovarian/peritoneal serous carcinoma from breast carcinoma in effusions. 15(3):535-544. https://doi.org/10.1111/j.1582-4934.2010.01019.x

15.

Vermeulen JF, Kornegoor R, van der Wall E, van der Groep P, van Diest PJ. Differential Expression of Growth Factor Receptors and Membrane-Bound Tumor Markers for Imaging in Male and Female Breast Cancer. PLoS ONE. 8(1):e53353. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0053353

16.

Tafreshi NK, Bui MM, Bishop K, Lloyd MC, Enkemann SA, Lopez AS, Abrahams D, Carter BW, Vagner J, Grobmyer SR, et al. 2012. Noninvasive Detection of Breast Cancer Lymph Node Metastasis Using Carbonic Anhydrases IX and XII Targeted Imaging Probes. Clinical Cancer Research. 18(1):207-219. https://doi.org/10.1158/1078-0432.ccr-11-0238

17.

Vazquez-Martin A, Oliveras-Ferraros C, Cufí S, Del Barco S, Martin-Castillo B, Menendez JA. 2010. Metformin regulates breast cancer stem cello ntogeny by transcriptional regulation of the epithelial-mesenchymal transition (EMT) status. Cell Cycle. 9(18):3831-3838. https://doi.org/10.4161/cc.9.18.13131

18.

Baccelli I, Schneeweiss A, Riethdorf S, Stenzinger A, Schillert A, Vogel V, Klein C, Saini M, Bäuerle T, Wallwiener M, et al. 2013. Identification of a population of blood circulating tumor cells from breast cancer patients that initiates metastasis in a xenograft assay. Nat Biotechnol. 31(6):539-544. https://doi.org/10.1038/nbt.2576

19.

Petit V, Massonnet G, Maciorowski Z, Touhami J, Thuleau A, Némati F, Laval J, Château-Joubert S, Servely J, Vallerand D, et al. 2013. Optimization of tumor xenograft dissociation for the profiling of cell surface markers and nutrient transporters. Lab Invest. 93(5):611-621. https://doi.org/10.1038/labinvest.2013.44

20.

Twarock S, Röck K, Sarbia M, Weber A, Jänicke R, Fischer J. Synthesis of hyaluronan in oesophageal cancer cells is uncoupled from the prostaglandin-cAMP pathway. 157(2):234-243. https://doi.org/10.1111/j.1476-5381.2009.00138.x

21.

Asplund A, Gry Björklund M, Sundquist C, Strömberg S, Edlund K, Östman A, Nilsson P, Pontén F, Lundeberg J. Expression profiling of microdissected cell populations selected from basal cells in normal epidermis and basal cell carcinoma. 158(3):527-538. https://doi.org/10.1111/j.1365-2133.2007.08418.x

22.

Teleki I, Krenacs T, Szasz MA, Kulka J, Wichmann B, Leo C, Papassotiropoulos B, Riemenschnitter C, Moch H, Varga Z. 2013. The potential prognostic value of connexin 26 and 46 expression in neoadjuvant-treated breast cancer. BMC Cancer. 13(1): https://doi.org/10.1186/1471-2407-13-50

23.

Kiflemariam S, Andersson S, Asplund A, Pontén F, Sjöblom T. Scalable In Situ Hybridization on Tissue Arrays for Validation of Novel Cancer and Tissue-Specific Biomarkers. PLoS ONE. 7(3):e32927. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0032927

24.

Nodin B, Fridberg M, Uhlén M, Jirström K. 2012. Discovery of dachshund 2 protein as a novel biomarker of poor prognosis in epithelial ovarian cancer. Journal of Ovarian Research. 5(1):6. https://doi.org/10.1186/1757-2215-5-6

25.

Sircoulomb F, Nicolas N, Ferrari A, Finetti P, Bekhouche I, Rousselet E, Lonigro A, Adélaïde J, Baudelet E, Esteyriès S, et al. 2011. ZNF703 gene amplification at 8p12 specifies luminal B breast cancer. EMBO Mol Med. 3(3):153-166. https://doi.org/10.1002/emmm.201100121

26.

Cawthorn TR, Moreno JC, Dharsee M, Tran-Thanh D, Ackloo S, Zhu PH, Sardana G, Chen J, Kupchak P, Jacks LM, et al. Proteomic Analyses Reveal High Expression of Decorin and Endoplasmin (HSP90B1) Are Associated with Breast Cancer Metastasis and Decreased Survival. PLoS ONE. 7(2):e30992. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0030992

27.

Henke A, Grace OC, Ashley GR, Stewart GD, Riddick ACP, Yeun H, O?Donnell M, Anderson RA, Thomson AA. Stromal Expression of Decorin, Semaphorin6D, SPARC, Sprouty1 and Tsukushi in Developing Prostate and Decreased Levels of Decorin in Prostate Cancer. PLoS ONE. 7(8):e42516. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0042516

28.

Hudson EP, Uhlen M, Rockberg J. 2012. Multiplex epitope mapping using bacterial surface display reveals both linear and conformational epitopes. Sci Rep. 2(1): https://doi.org/10.1038/srep00706

29.

Arabi A, Ullah K, Branca RM, Johansson J, Bandarra D, Haneklaus M, Fu J, Ariës I, Nilsson P, Den Boer ML, et al. 2012. Proteomic screen reveals Fbw7 as a modulator of the NF-?B pathway. Nat Commun. 3(1): https://doi.org/10.1038/ncomms1975

30.

Ito A, Mimae T, Yamamoto Y, Hagiyama M, Nakanishi J, Ito M, Hosokawa Y, Okada M, Murakami Y, Kondo T. 2012. Novel application for pseudopodia proteomics using excimer laser ablation and two-dimensional difference gel electrophoresis. Lab Invest. 92(9):1374-1385. https://doi.org/10.1038/labinvest.2012.98

31.

Holland DG, Burleigh A, Git A, Goldgraben MA, Perez?Mancera PA, Chin S, Hurtado A, Bruna A, Ali HR, Greenwood W, et al. 2011. ZNF703 is a common Luminal B breast cancer oncogene that differentially regulates luminal and basal progenitors in human mammary epithelium. EMBO Mol Med. 3(3):167-180. https://doi.org/10.1002/emmm.201100122

32.

Mulder J, Björling E, Jonasson K, Wernérus H, Hober S, Hökfelt T, Uhlén M. 2009. Tissue Profiling of the Mammalian Central Nervous System Using Human Antibody-based Proteomics. Mol Cell Proteomics. 8(7):1612-1622. https://doi.org/10.1074/mcp.m800539-mcp200

33.

Su D, Fu X, Fan S, Wu X, Wang X, Fu L, Dong X, Ni JJ, Fu L, Zhu Z, et al. 2012. Role of ERRF, a Novel ER-Related Nuclear Factor, in the Growth Control of ER-Positive Human Breast Cancer Cells. The American Journal of Pathology. 180(3):1189-1201. https://doi.org/10.1016/j.ajpath.2011.11.025

34.

Shubbar E, Helou K, Kovács A, Nemes S, Hajizadeh S, Enerbäck C, Einbeigi Z. 2013. High levels of ?-glutamyl hydrolase (GGH) are associated with poor prognosis and unfavorable clinical outcomes in invasive breast cancer. BMC Cancer. 13(1): https://doi.org/10.1186/1471-2407-13-47

35.

Liao YC, Ruan JW, Lua I, Li MH, Chen WL, Wang JRY, Kao RH, Chen JH. 2012. Overexpressed hPTTG1 promotes breast cancer cell invasion and metastasis by regulating GEF-H1/RhoA signalling. Oncogene. 31(25):3086-3097. https://doi.org/10.1038/onc.2011.476

36.

Cheng IK, Tsang BC, Lai KP, Ching AK, Chan AW, To K, Lai PB, Wong N. 2012. GEF-H1 over-expression in hepatocellular carcinoma promotes cell motility via activation of RhoA signalling. J. Pathol.. 228(4):575-585. https://doi.org/10.1002/path.4084

37.

Zibert JR, Wallbrecht K, Schön M, Mir LM, Jacobsen GK, Trochon-Joseph V, Bouquet C, Villadsen LS, Cadossi R, Skov L, et al. 2011. Halting angiogenesis by non-viral somatic gene therapy alleviates psoriasis and murine psoriasiform skin lesions. J. Clin. Invest.. 121(1):410-421. https://doi.org/10.1172/jci41295

38.

Smyth LG, O'Hurley G, O'Grady A, Fitzpatrick JM, Kay E, Watson RWG. 2010. Carbonic anhydrase IX expression in prostate cancer. Prostate Cancer Prostatic Dis. 13(2):178-181. https://doi.org/10.1038/pcan.2009.58

39.

Paatero I, Jokilammi A, Heikkinen PT, Iljin K, Kallioniemi O, Jones FE, Jaakkola PM, Elenius K. 2012. Interaction with ErbB4 Promotes Hypoxia-inducible Factor-1? Signaling. J. Biol. Chem.. 287(13):9659-9671. https://doi.org/10.1074/jbc.m111.299537

40.

Zbytek B, Peacock DL, Seagroves TN, Slominski A. 2013. Putative role of HIF transcriptional activity in melanocytes and melanoma biology. Dermato-Endocrinology. 5(2):239-251. https://doi.org/10.4161/derm.22678

41.

Hu Z, Huang G, Sadanandam A, Gu S, Lenburg ME, Pai M, Bayani N, Blakely EA, Gray JW, Mao J. 2010. The expression level of HJURP has an independent prognostic impact and predicts the sensitivity to radiotherapy in breast cancer. Breast Cancer Res. 12(2): https://doi.org/10.1186/bcr2487

42.

Shuaib M, Ouararhni K, Dimitrov S, Hamiche A. 2010. HJURP binds CENP-A via a highly conserved N-terminal domain and mediates its deposition at centromeres. Proceedings of the National Academy of Sciences. 107(4):1349-1354. https://doi.org/10.1073/pnas.0913709107

43.

de Tayrac M, Saikali S, Aubry M, Bellaud P, Boniface R, Quillien V, Mosser J. Prognostic Significance of EDN/RB, HJURP, p60/CAF-1 and PDLI4, Four New Markers in High-Grade Gliomas. PLoS ONE. 8(9):e73332. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0073332

44.

Bjarnadottir O, Romero Q, Bendahl P, Jirström K, Rydén L, Loman N, Uhlén M, Johannesson H, Rose C, Grabau D, et al. 2013. Targeting HMG-CoA reductase with statins in a window-of-opportunity breast cancer trial. Breast Cancer Res Treat. 138(2):499-508. https://doi.org/10.1007/s10549-013-2473-6

45.

Jaraj SJ, Augsten M, Häggarth L, Wester K, Pontén F, Östman A, Egevad L. 2011. GAD1 is a biomarker for benign and malignant prostatic tissue. Scandinavian Journal of Urology and Nephrology. 45(1):39-45. https://doi.org/10.3109/00365599.2010.521189

46.

Liu H, Zhang W, Jia Y, Yu Q, Grau GE, Peng L, Ran Y, Yang Z, Deng H, Lou J. 2013. Single-cell clones of liver cancer stem cells have the potential of differentiating into different types of tumor cells. Cell Death Dis. 4(10):e857-e857. https://doi.org/10.1038/cddis.2013.340

47.

Guo L, Chen C, Shi M, Wang F, Chen X, Diao D, Hu M, Yu M, Qian L, Guo N. 2013. Stat3-coordinated Lin-28?let-7?HMGA2 and miR-200?ZEB1 circuits initiate and maintain oncostatin M-driven epithelial?mesenchymal transition. Oncogene. 32(45):5272-5282. https://doi.org/10.1038/onc.2012.573

48.

Possemato R, Marks KM, Shaul YD, Pacold ME, Kim D, Birsoy K, Sethumadhavan S, Woo H, Jang HG, Jha AK, et al. 2011. Functional genomics reveal that the serine synthesis pathway is essential in breast cancer. Nature. 476(7360):346-350. https://doi.org/10.1038/nature10350

49.

Maddocks ODK, Berkers CR, Mason SM, Zheng L, Blyth K, Gottlieb E, Vousden KH. 2013. Serine starvation induces stress and p53-dependent metabolic remodelling in cancer cells. Nature. 493(7433):542-546. https://doi.org/10.1038/nature11743

50.

Nilsson LM, Plym Forshell TZ, Rimpi S, Kreutzer C, Pretsch W, Bornkamm GW, Nilsson JA. Mouse Genetics Suggests Cell-Context Dependency for Myc-Regulated Metabolic Enzymes during Tumorigenesis. PLoS Genet. 8(3):e1002573. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002573

51.

Salem AF, Whitaker-Menezes D, Howell A, Sotgia F, Lisanti MP. 2012. Mitochondrial biogenesis in epithelial cancer cells promotes breast cancer tumor growth and confers autophagy resistance. Cell Cycle. 11(22):4174-4180. https://doi.org/10.4161/cc.22376

52.

Wagoner MP, Gunsalus KTW, Schoenike B, Richardson AL, Friedl A, Roopra A. The Transcription Factor REST Is Lost in Aggressive Breast Cancer. PLoS Genet. 6(6):e1000979. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000979

53.

Prada I, Marchaland J, Podini P, Magrassi L, D'Alessandro R, Bezzi P, Meldolesi J. 2011. REST/NRSF governs the expression of dense-core vesicle gliosecretion in astrocytes. 193(3):537-549. https://doi.org/10.1083/jcb.201010126

54.

Jögi A, Brennan DJ, Rydén L, Magnusson K, Fernö M, Stål O, Borgquist S, Uhlen M, Landberg G, Påhlman S, et al. 2009. Nuclear expression of the RNA-binding protein RBM3 is associated with an improved clinical outcome in breast cancer. Mod Pathol. 22(12):1564-1574. https://doi.org/10.1038/modpathol.2009.124

55.

Hjelm B, Brennan DJ, Zendehrokh N, Eberhard J, Nodin B, Gaber A, Pontén F, Johannesson H, Smaragdi K, Frantz C, et al. 2011. High nuclear RBM3 expression is associated with an improved prognosis in colorectal cancer. Prot. Clin. Appl.. 5(11-12):624-635. https://doi.org/10.1002/prca.201100020

56.

Ehlén Å, Brennan DJ, Nodin B, O'Connor DP, Eberhard J, Alvarado-Kristensson M, Jeffrey IB, Manjer J, Brändstedt J, Uhlén M, et al. 2010. Expression of the RNA-binding protein RBM3 is associated with a favourable prognosis and cisplatin sensitivity in epithelial ovarian cancer. Journal of Translational Medicine. 8(1):78. https://doi.org/10.1186/1479-5876-8-78

57.

Jonsson L, Gaber A, Ulmert D, Uhlén M, Bjartell A, Jirström K. 2011. High RBM3 expression in prostate cancer independently predicts a reduced risk of biochemical recurrence and disease progression. Diagn Pathol. 6(1): https://doi.org/10.1186/1746-1596-6-91

58.

Nodin B, Fridberg M, Jonsson L, Bergman J, Uhlén M, Jirström K. 2012. High MCM3 expression is an independent biomarker of poor prognosis and correlates with reduced RBM3 expression in a prospective cohort of malignant melanoma. Diagnostic Pathology. 7(1):82. https://doi.org/10.1186/1746-1596-7-82

59.

Jonsson L, Bergman J, Nodin B, Manjer J, Pontén F, Uhlén M, Jirström K. 2011. Low RBM3 protein expression correlates with tumour progression and poor prognosis in malignant melanoma: An analysis of 215 cases from the Malmö Diet and Cancer Study. Journal of Translational Medicine. 9(1):114. https://doi.org/10.1186/1479-5876-9-114

60.

Ehlén Õ, Nodin B, Rexhepaj E, Brändstedt J, Uhlén M, Alvarado-Kristensson M, Pontén F, Brennan DJ, Jirström K. 2011. RBM3-Regulated Genes Promote DNA Integrity and Affect Clinical Outcome in Epithelial Ovarian Cancer. Translational Oncology. 4(4):212-IN1. https://doi.org/10.1593/tlo.11106

61.

62.

Boman K, Segersten U, Ahlgren G, Eberhard J, Uhlén M, Jirström K, Malmström P. 2013. Decreased expression of RNA-binding motif protein 3 correlates with tumour progression and poor prognosis in urothelial bladder cancer. BMC Urol. 13(1): https://doi.org/10.1186/1471-2490-13-17

63.

64.

Telikicherla D, Marimuthu A, Kashyap M, Ramachandra YL, Mohan S, Roa J, Maharudraiah J, Pandey A. 2012. Overexpression of ribosome binding protein 1 (RRBP1) in breast cancer. Clin Proteomics. 9(1):7. https://doi.org/10.1186/1559-0275-9-7

65.

Iwanaga R, Wang C, Micalizzi DS, Harrell JC, Jedlicka P, Sartorius CA, Kabos P, Farabaugh SM, Bradford AP, Ford HL. 2012. Expression of Six1 in luminal breast cancers predicts poor prognosis and promotes increases in tumor initiating cells by activation of extracellular signal-regulated kinase and transforming growth factor-beta signaling pathways. Breast Cancer Res. 14(4): https://doi.org/10.1186/bcr3219

66.

Smith AL, Iwanaga R, Drasin DJ, Micalizzi DS, Vartuli RL, Tan A, Ford HL. 2012. The miR-106b-25 cluster targets Smad7, activates TGF-? signaling, and induces EMT and tumor initiating cell characteristics downstream of Six1 in human breast cancer. Oncogene. 31(50):5162-5171. https://doi.org/10.1038/onc.2012.11

67.

Wan F, Miao X, Quraishi I, Kennedy V, Creek KE, Pirisi L. 2008. Gene expression changes during HPV-mediated carcinogenesis: A comparison between anin vitrocell model and cervical cancer. Int. J. Cancer. 123(1):32-40. https://doi.org/10.1002/ijc.23463

68.

McCoy EL, Iwanaga R, Jedlicka P, Abbey N, Chodosh LA, Heichman KA, Welm AL, Ford HL. 2009. Six1 expands the mouse mammary epithelial stem/progenitor cell pool and induces mammary tumors that undergo epithelial-mesenchymal transition. J. Clin. Invest.. 119(9):2663-2677. https://doi.org/10.1172/jci37691

69.

Micalizzi DS, Christensen KL, Jedlicka P, Coletta RD, Barón AE, Harrell JC, Horwitz KB, Billheimer D, Heichman KA, Welm AL, et al. 2009. The Six1 homeoprotein induces human mammary carcinoma cells to undergo epithelial-mesenchymal transition and metastasis in mice through increasing TGF-? signaling. J. Clin. Invest.. 119(9):2678-2690. https://doi.org/10.1172/jci37815

70.

Farabaugh SM, Micalizzi DS, Jedlicka P, Zhao R, Ford HL. 2012. Eya2 is required to mediate the pro-metastatic functions of Six1 via the induction of TGF-? signaling, epithelial?mesenchymal transition, and cancer stem cell properties. Oncogene. 31(5):552-562. https://doi.org/10.1038/onc.2011.259

71.

Ono H, Imoto I, Kozaki K, Tsuda H, Matsui T, Kurasawa Y, Muramatsu T, Sugihara K, Inazawa J. 2012. SIX1 promotes epithelial?mesenchymal transition in colorectal cancer through ZEB1 activation. Oncogene. 31(47):4923-4934. https://doi.org/10.1038/onc.2011.646

72.

Le Grand F, Grifone R, Mourikis P, Houbron C, Gigaud C, Pujol J, Maillet M, Pagès G, Rudnicki M, Tajbakhsh S, et al. 2012. Six1 regulates stem cell repair potential and self-renewal during skeletal muscle regeneration. 198(5):815-832. https://doi.org/10.1083/jcb.201201050

73.

Sernbo S, Borrebaeck CAK, Uhlén M, Jirström K, Ek S. Nuclear T-STAR Protein Expression Correlates with HER2 Status, Hormone Receptor Negativity and Prolonged Recurrence Free Survival in Primary Breast Cancer and Decreased Cancer Cell Growth In Vitro. PLoS ONE. 8(7):e70596. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0070596

74.

Ek S, Andréasson U, Hober S, Kampf C, Pontén F, Uhlén M, Merz H, Borrebaeck CAK. 2006. From Gene Expression Analysis to Tissue Microarrays. Mol Cell Proteomics. 5(6):1072-1081. https://doi.org/10.1074/mcp.m600077-mcp200

75.

Schenke-Layland K, Stock UA, Nsair A, Xie J, Angelis E, Fonseca CG, Larbig R, Mahajan A, Shivkumar K, Fishbein MC, et al. 2009. Cardiomyopathy is associated with structural remodelling of heart valve extracellular matrix. 30(18):2254-2265. https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehp267

76.

Ghosh Z, Huang M, Hu S, Wilson KD, Dey D, Wu JC. 2011. Dissecting the Oncogenic and Tumorigenic Potential of Differentiated Human Induced Pluripotent Stem Cells and Human Embryonic Stem Cells. Cancer Research. 71(14):5030-5039. https://doi.org/10.1158/0008-5472.can-10-4402

77.

Edlund K, Lindskog C, Saito A, Berglund A, Pontén F, Göransson-Kultima H, Isaksson A, Jirström K, Planck M, Johansson L, et al. 2012. CD99 is a novel prognostic stromal marker in non-small cell lung cancer. Int. J. Cancer. 131(10):2264-2273. https://doi.org/10.1002/ijc.27518

78.

Pontén F, Jirström K, Uhlen M. 2008. The Human Protein Atlas?a tool for pathology. J. Pathol.. 216(4):387-393. https://doi.org/10.1002/path.2440

79.

Wu C, Hsu C, Chen C, Yu C, Chang K, Tai D, Liu H, Su W, Chang Y, Yu J. 2010. Candidate Serological Biomarkers for Cancer Identified from the Secretomes of 23 Cancer Cell Lines and the Human Protein Atlas. Mol Cell Proteomics. 9(6):1100-1117. https://doi.org/10.1074/mcp.m900398-mcp200

80.

81.

Dzi?giel P, Owczarek T, Plaz?uk E, Gomu?kiewicz A, Majchrzak M, Podhorska-Oko?ów M, Driouch K, Lidereau R, Ugorski M. 2010. Ceramide galactosyltransferase (UGT8) is a molecular marker of breast cancer malignancy and lung metastases. Br J Cancer. 103(4):524-531. https://doi.org/10.1038/sj.bjc.6605750

82.

de Kruijf EM, Sajet A, van Nes JG, Putter H, Smit VT, Eagle RA, Jafferji I, Trowsdale J, Liefers GJ, van de Velde CJ, et al. 2012. NKG2D ligand tumor expression and association with clinical outcome in early breast cancer patients: an observational study. BMC Cancer. 12(1): https://doi.org/10.1186/1471-2407-12-24

83.

Elkabets M, Gifford AM, Scheel C, Nilsson B, Reinhardt F, Bray M, Carpenter AE, Jirström K, Magnusson K, Ebert BL, et al. 2011. Human tumors instigate granulin-expressing hematopoietic cells that promote malignancy by activating stromal fibroblasts in mice. J. Clin. Invest.. 121(2):784-799. https://doi.org/10.1172/jci43757

MammaPrint、Oncotype、EndoPredictおよびuPA検査における遺伝子産物に対する抗体

ここでは、診断用のMammaPrint、EndoPredict、OncotypeおよびuPA検査に含まれる遺伝子産物に対するPrestige抗体製品カタログの抗体を提示しています。MammaPrintは、Agendiaが販売するアムステルダム70遺伝子の乳がん遺伝子発現シグネチャーに基づいた遺伝子発現プロファイルの検査です。それは、乳がんが身体の他の部位に転移するリスクを評価する検査です。MammaPrintは、患者を「低リスク」および「高リスク」に層別化することが目的です。Oncotype DX（Genomic Healthが開発）は、米国の臨床の現場で最も頻繁に使用されている遺伝子発現プロファイル検査であり、腫瘍内の21の遺伝子のパネルを分析し、再発スコア（Recurrence Score）を判定します。

BIRC5/Survivin

抗BIRC5抗体（HPA002830）は、IHCによりヒト扁桃組織の胚中心細胞および大腸がんの腫瘍細胞で核陽性を示します。

CD68/Macrosialin

抗CD68抗体（HPA048982）を使用したヒト肺組織のIHC染色では、マクロファージおよび脾臓のような造血組織に強力な細胞質陽性が認められます。

DTL

抗DTL抗体（HPA028016）を用いたヒト骨髄のIHC染色では、骨髄造血細胞に強力な核陽性が認められます。ICC-IFにより、U-251 MG細胞では核の染色が認められます。

GSTM5

抗GSTM5抗体（HPA048652）は、IHCによりヒト直腸の腺細胞で細胞質陽性を示し、RT-4、U-251 MGの細胞ライセートおよび肝組織ライセートを用いたWBでは、予測されるサイズのバンドを検出します。

製品番号	ターゲットタンパク質	製品名	バリデートされたアプリケーション
HPA002636	AURKA/STK15	抗AURKA	IHC、WB
HPA012582	AZGP1	抗AZGP1	IHC、WB
HPA018121	BAG1	抗BAG1	IHC、ICC-IF
HPA002830	BIRC5/Survivin	抗BIRC5	IHC、WB、ICC-IF
HPA048982	CD68/Macrosialin	抗CD68	IHC
HPA005565	CDCA7	抗CDCA7^1,2	IHC、WB、ICC-IF
HPA006871	CMC2/C16orf61	抗CMC2	IHC
HPA044280	DHCR7	抗DHCR7	IHC、WB
HPA018670	DHX58/LGP2	抗DHX58	IHC、WB、ICC-IF
HPA019570	DHX58/LGP2	抗DHX58	IHC
HPA032152	DIAPH3	抗DIAPH3	IHC、WB*
HPA028016	DTL	抗DTL³	IHC、WB、ICC-IF
HPA022130	ECI2/PECI	抗ECI2	IHC、WB、ICC-IF
HPA022129	EGLN1/PHD2	抗EGLN1⁴	IHC、ICC-IF
HPA036660	ESM1	抗ESM1	IHC、WB
HPA000449	エストロゲン受容体	抗ESR1	IHC、WB
HPA000450	エストロゲン受容体	抗ESR1	IHC、WB
HPA044394	Exostosin-1	抗EXT1	IHC、WB
HPA018795	FGF18	抗FGF18	IHC、WB、ICC-IF
HPA050682	GMPS	抗GMPS	IHC
HPA003011	GNAZ	抗GNAZ	IHC、WB
HPA017346	GPR126/VIGR	抗GPR126	IHC
HPA047250	GPR180	抗GPR180	IHC、ICC-IF
HPA035190	GSTM3	抗GSTM3	IHC、WB
HPA048652	GSTM5/GSTM1	抗GSTM⁵	IHC、WB
HPA001383	HER2/ERBB2	抗ERBB2	IHC、WB
AMAb90627	HER2/ERBB2	抗HER2	IHC、WB
HPA051179	HRASLS	抗HRASLS	IHC
HPA010558	IL6ST/GP130	抗IL6ST5	IHC
HPA012114	JHDM1D/KDM7A	抗JHDM1D	IHC、ICC-IF

* ヒトとげっ歯類の両サンプルのWB

Gill RM, Gabor TV, Couzens AL, Scheid MP. 2013. The MYC-Associated Protein CDCA7 Is Phosphorylated by AKT To Regulate MYC-Dependent Apoptosis and Transformation. Mol. Cell. Biol.. 33(3):498-513. https://doi.org/10.1128/mcb.00276-12

Shubbar E, Kovács A, Hajizadeh S, Parris TZ, Nemes S, Gunnarsdóttir K, Einbeigi Z, Karlsson P, Helou K. 2013. Elevated cyclin B2 expression in invasive breast carcinoma is associated with unfavorable clinical outcome. BMC Cancer. 13(1): https://doi.org/10.1186/1471-2407-13-1

Karaayvaz M, Pal T, Song B, Zhang C, Georgakopoulos P, Mehmood S, Burke S, Shroyer K, Ju J. 2011. Prognostic Significance of miR-215 in Colon Cancer. Clinical Colorectal Cancer. 10(4):340-347. https://doi.org/10.1016/j.clcc.2011.06.002

Bozóky B, Savchenko A, Csermely P, Korcsmáros T, Dúl Z, Pontén F, Székely L, Klein G. 2013. Novel signatures of cancer-associated fibroblasts. Int. J. Cancer. 133(2):286-293. https://doi.org/10.1002/ijc.28035

Rognum IJ, Haynes RL, Vege ?, Yang M, Rognum TO, Kinney HC. 2009. Interleukin-6 and the serotonergic system of the medulla oblongata in the sudden infant death syndrome. Acta Neuropathol. 118(4):519-530. https://doi.org/10.1007/s00401-009-0535-y

MMP9

抗MMP9抗体（HPA001238）を使用したヒト肺組織のIHC染色では、マクロファージおよび骨髄組織の骨髄造血細胞に強力な核陽性が認められます。

モノクローナル抗MMP9抗体は、十二指腸（AMAb90805）およびヒト扁桃組織（AMAb90804）の一部のリンパ様細胞で強力な細胞質陽性を示します。

LYRIC/MTDH

抗MTDH抗体（HPA010932）を使用したIHC染色では、ヒト大脳皮質組織の神経細胞に強力な細胞質陽性が認められます。A-431細胞株を用いたICC-IFでは、本抗体は小胞体を染色します。

モノクローナル抗MTDH抗体（AMAb90762）を使用したIHC染色では、乳がんおよび大腸がんサンプル由来の腫瘍細胞に強力な細胞質反応が認められます。

P5C脱水素酵素／ALDH4A1

抗ALDH4A1抗体（HPA006401）を使用したIHC染色では、ヒト腎臓および肝臓組織に顆粒状パターンを示す強力な細胞質陽性が認められます。

製品番号	ターゲットタンパク質	製品名	バリデートされたアプリケーション
HPA000451	Ki67/MKI67	抗MKI67¹	IHC、ICC-IF
HPA001164	KI67/MKI67	抗MKI67²	IHC、ICC-IF
AMAb90870	KI67/MKI67	抗MKI67	IHC
HPA030241	LIN9	抗LIN9	IHC、ICC-IF
HPA012501	LPCAT/AYTL2	抗LPCAT1	IHC、WB
HPA022268	LPCAT/AYTL2	抗LPCAT1³	IHC、WB、ICC-IF
HPA015104	LYRIC	抗MTDH⁴	IHC、WB、ICC-IF
HPA010932	LYRIC	抗MTDH⁵	IHC、WB*、ICC-IF
AMAb90762	LYRIC	抗MTDH	IHC、WB
AMAb90763	LYRIC	抗MTDH	IHC、WB
HPA013949	Matrix Gla protein	抗MGP⁶	IHC
HPA004818	MCM6	抗MCM6	IHC、WB*、ICC-IF
HPA017214	MELK/PK38	抗MELK	IHC、ICC-IF
HPA001238	MMP9	抗MMP9	IHC、WB、ICC-IF
AMAb90804	MMP9	抗MMP9	IHC、WB
AMAb90805	MMP9	抗MMP9	IHC、WB
AMAb90806	MMP9	抗MMP9	IHC
HPA017418	MS4A7	抗MS4A7	IHC、WB
HPA030530	MYBL2	抗MYBL2	IHC、WB
HPA025926	Neuromedin-U	抗NMU	IHC、WB
HPA042904	NUSAP1	抗NUSAP1	IHC、ICC-IF
HPA006401	P5C脱水素酵素	抗ALDH4A1	IHC、WB

* ヒトとげっ歯類の両サンプルのWB

Pohler E, Mamai O, Hirst J, Zamiri M, Horn H, Nomura T, Irvine AD, Moran B, Wilson NJ, Smith FJD, et al. 2012. Haploinsufficiency for AAGAB causes clinically heterogeneous forms of punctate palmoplantar keratoderma. Nat Genet. 44(11):1272-1276. https://doi.org/10.1038/ng.2444

Friedman JS, Chang B, Krauth DS, Lopez I, Waseem NH, Hurd RE, Feathers KL, Branham KE, Shaw M, Thomas GE, et al. 2010. Loss of lysophosphatidylcholine acyltransferase 1 leads to photoreceptor degeneration in rd11 mice. Proceedings of the National Academy of Sciences. 107(35):15523-15528. https://doi.org/10.1073/pnas.1002897107

Nohata N, Hanazawa T, Kikkawa N, Mutallip M, Sakurai D, Fujimura L, Kawakami K, Chiyomaru T, Yoshino H, Enokida H, et al. 2011. Tumor suppressive microRNA-375 regulates oncogene AEG-1/MTDH in head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC). J Hum Genet. 56(8):595-601. https://doi.org/10.1038/jhg.2011.66

LIU B, WU Y, PENG D. 2013. Astrocyte elevated gene-1 regulates osteosarcoma cell invasion and chemoresistance via endothelin-1/endothelin A receptor signaling. 5(2):505-510. https://doi.org/10.3892/ol.2012.1056

Lorenzen JM, Martino F, Scheffner I, Bröcker V, Leitolf H, Haller H, Gwinner W. Fetuin, Matrix-Gla Protein and Osteopontin in Calcification of Renal Allografts. PLoS ONE. 7(12):e52039. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0052039

PITRM1/MP1

抗PITRM1抗体（HPA006753）のIHC染色では、ヒト心筋細胞で強力な細胞質陽性が認められます。ヒト細胞株U-251 MGのICC-IF染色では、ミトコンドリアで陽性が認められます。

PRC1

抗PRC1抗体（HPA034521）を用いたヒト精巣組織のIHC染色では、輸精管細胞に強力な核陽性が認められます。ICC-IFでは、A-431細胞の核、細胞膜および微小管に染色が認められます。

SCOT/OXCT1

抗OXCT1抗体（HPA012047）を用いたヒト心筋および腎臓のIHC染色では、心筋細胞および尿細管の細胞に陽性が認められます。ICC-IFでは、A431細胞のミトコンドリアに染色が認められます。

製品番号	ターゲットタンパク質	製品名	バリデートされたアプリケーション
HPA006753	PITRM1/MP1	抗PITRM1	IHC、WB、ICC-IF
HPA006754	PITRM1/MP1	抗PITRM1	IHC、WB*、ICC-IF
HPA008719	PLAU/UPA	抗PLAU	IHC、WB
HPA034521	PRC1	抗PRC¹	IHC、ICC-IF
HPA004751	プロゲステロン受容体	抗PGR1	IHC、ICC-IF
HPA008428	プロゲステロン受容体	抗PGR	IHC
HPA017176	プロゲステロン受容体	抗PGR	IHC
HPA012716	QSOX2/QSCN6L1	抗QSOX2	IHC、WB、ICC-IF
HPA039890	RBBP8	抗RBBP8	IHC、WB
HPA029970	RECQL5	抗RECQL5	IHC、ICC-IF
HPA029971	RECQL5	抗RECQL5	IHC、WB、ICC-IF
HPA044428	RTN4RL1/NgR3	抗RTN4RL1	IHC
HPA023726	RUNDC1	抗RUNDC1	IHC、WB、ICC-IF
HPA006353	SCUBE2/CEGP1	抗SCUBE2	IHC、ICC-IF
HPA029871	SCUBE2/CEGP1	抗SCUBE2	IHC
HPA012047	SCOT/OXCT1	抗OXCT1²	IHC、WB*、ICC-IF
HPA050039	SERPINE1/PAI1	抗SERPINE1	IHC
HPA006539	SLC2A3/GLUT3	抗SLC2A3	IHC
HPA045372	Stanniocalcin-2	抗STC2	IHC、WB、IF
HPA015820	STK32B	抗STK32B	IHC、ICC-IF
HPA027923	TGFB3	抗TGFB3	IHC、WB
HPA045213	TMEM74B/C20orf46	抗TMEM74B	IHC
HPA031347	TSPYL5	抗TSPYL5	IHC
HPA005908	UCHL5	抗UCHL5	IHC、ICC-IF
HPA014290	VEGFR-1	抗FLT1	IHC、ICC-IF
AMAb90703	VEGFR-1	抗FLT1	IHC
AMAb90704	VEGFR-1	抗FLT1	IHC、WB
HPA007121	WISP1	抗WISP1	IHC、ICC-IF

* ヒトとげっ歯類の両サンプルのWB

Human Protein Atlasで同定されている抗体

乳がんサンプルにおけるIHC染色パターンの差異

抗KLHL26抗体（HPA023074）を使用したIHC染色では、異なる患者由来の乳がんサンプルで膜／細胞質のさまざまな染色パターンが認められます。

抗ACSF2抗体（HPA024693）は、異なる患者由来の乳がん細胞で粒状に染色される強力な陽性から陰性まで強度の異なる細胞質陽性を示します。

抗GCM1抗体（HPA011343）は、乳がん細胞で膜陽性を示しますが、正常乳房組織では陰性です。

抗AGR3抗体（HPA053942）は、12例中11例の乳がん患者で強力な細胞質陽性を示しますが、1例では完全に陰性です。

製品番号	製品名	バリデートされたアプリケーション
HPA037918	抗AAMDC	IHC、WB
HPA037919	抗AAMDC	IHC
HPA040312	抗ABCG4	IHC、ICC-IF
HPA007695	抗NIM1	IHC、WB、ICC-IF
HPA023993	抗AC145676.2	IHC、WB
HPA024693	抗ACSF2	IHC、WB
HPA042014	抗ADAMTS13	IHC、WB
HPA053942	抗AGR3	IHC
HPA020522	抗AIF1L	IHC、WB
HPA006171	抗AJUBA	IHC、WB
HPA046271	抗ALDH1A3	IHC、WB
HPA013758	抗ANKRD46	IHC、WB
HPA004341	抗ASB6	IHC、WB、ICC-IF
HPA005935	抗ATF6	IHC
HPA008147	抗ATP6V1B2	IHC、WB*、ICC-IF
HPA046678	抗AVPR2	IHC
HPA020274	抗BCL9	IHC
HPA038478	抗BTG4	IHC
HPA026810	抗ADIRF	IHC、WB
HPA007968	抗C10orf54	IHC、WB、ICC-IF
HPA039713	抗C12orf76	IHC、WB
HPA008959	抗C17orf85	IHC
HPA045811	抗C1ORF195	IHC、ICC-IF
HPA051143	抗C2orf68	IHC
HPA037889	抗SIMC1	IHC、WB
HPA021480	抗CAPN8	IHC、WB
HPA023457	抗CCDC144NL	IHC、WB
HPA027185	抗CCDC170	IHC、WB
HPA027121	抗CCDC170	IHC、WB
HPA002637	抗CDK6	IHC、WB*、ICC-IF
HPA014361	抗CLDN3	IHC
HPA041132	抗CPNE2	IHC、WB
HPA004135	抗CRABP2	IHC、WB、ICC-IF
HPA015077	抗CTNND2	IHC
HPA006128	抗CXorf67	IHC、WB
HPA017661	抗CYP4X1	IHC
HPA012672	抗DACH1	IHC、ICC-IF
HPA051589	抗DBF4	IHC
HPA050246	抗DCHS1	IHC
HPA015655	抗DCLK1	IHC
HPA047631	抗DECR2	IHC
HPA046708	抗DOM3Z	IHC
HPA018221	抗DUSP26	IHC、WB
HPA006465	抗ECD	IHC、WB、ICC-IF
HPA049331	抗EFHD1	IHC、WB、ICC-IF
HPA007397	抗EPHA6	IHC
HPA030879	抗FAM101B	IHC
HPA009410	抗FAM189A1	IHC
HPA008707	抗FKBP7	IHC、WB*、ICC-IF
HPA004937	抗FMN2	IHC
HPA052324	抗G6PC	IHC
HPA044371	抗GABRD	IHC、WB
HPA027463	抗GAK	IHC、ICC-IF
HPA011343	抗GCM1	IHC
HPA039916	抗GLB1L3	IHC
HPA002318	抗GLDC	IHC、WB*
HPA039501	抗GLYATL1	IHC、WB
HPA007990	抗GTF3A	IHC、ICC-IF
HPA007611	抗HIPK2	IHC、ICC-IF
HPA036913	抗HMGCS1	IHC、WB、ICC-IF
HPA027423	抗HMGCS2	IHC、WB
HPA027442	抗HMGCS2	IHC、WB
HPA004337	抗IFITM3	IHC、WB
HPA054669	抗IRX2	IHC、WB
HPA007931	抗ISYNA1	IHC
HPA008232	抗ISYNA1	IHC、WB
HPA008572	抗ITGA3	IHC
HPA005676	抗ITGBL1	IHC、WB
HPA000506	抗ITIH6	IHC
HPA051637	抗KLHL2	IHC
HPA023074	抗KLHL26	IHC、WB
HPA049550	抗KRT31	IHC
HPA040330	抗KRT32	IHC
HPA042482	抗KRTAP9-3	IHC
HPA012072	抗LASP1¹	IHC、WB、ICC-IF
HPA008556	抗LGR6	IHC
HPA036706	抗LRRIQ4	IHC
HPA002820	抗MAGEB1	IHC
HPA039454	抗MANSC4	IHC、WB
HPA059457	抗MROH2B	IHC
HPA017642	抗MRS2	IHC、WB
HPA005914	抗MSTO1	IHC
HPA049831	抗MTMR2	IHC
HPA005466	抗MYBBP1A	IHC、WB、ICC-IF
HPA024338	抗NAPEPLD	IHC、WB、ICC-IF
HPA028136	抗NASP	IHC、WB、ICC-IF
HPA006111	抗NFIA	IHC、WB*、ICC-IF
HPA006873	抗NKAIN1	IHC
HPA007489	抗NPSR1²	IHC、ICC-IF
HPA048760	抗OR2Z1	IHC
HPA015808	抗OR9K2	IHC
HPA024524	抗OTOP2	IHC
HPA048975	抗PDE4C	IHC、WB
HPA051038	抗PEG10	IHC、ICC-IF
HPA003994	抗PHLDA2	IHC
HPA020200	抗PHLPP1	IHC
HPA012312	抗PHTF2	IHC
HPA045390	抗PKN3	IHC
HPA044690	抗PNMA5	IHC、ICC-IF
HPA051607	抗PPP1R35	IHC
HPA023923	抗PPR11	IHC、WB、ICC-IF
HPA048536	抗PVALB	IHC
HPA019717	抗RAB31³	IHC、WB*
HPA047820	抗RAC3	IHC、WB
HPA008752	抗RAD18	IHC、WB
HPA058061	抗REEP1	IHC
HPA005681	抗RIOK2	IHC、ICC-IF
HPA015733	抗RNF152	IHC、WB
HPA005985	抗RPS13	IHC
HPA006462	抗S100A1	IHC、WB、ICC-IF
HPA019592	抗S100A13	IHC、WB*
HPA027613	抗S100A14	IHC、ICC-IF
HPA006997	抗S100A7	IHC、ICC-IF
HPA013321	抗SGK196	IHC、WB、ICC-IF
HPA051248	抗SH3BGRL	IHC、WB
HPA037690	抗SHROOM1	IHC
HPA005911	抗SLC16A7	IHC、WB
HPA042377	抗SLC39A6	IHC、WB
HPA023748	抗SPAG1	IHC、ICC-IF
HPA018038	抗SQLE	IHC、WB
HPA011173	抗SRPRB	IHC、WB
HPA039789	抗SSSCA1	IHC、WB*、ICC-IF
HPA049106	抗STAG3	IHC、WB、ICC-IF
HPA042583	抗STARD6	IHC、IF
HPA001467	抗STX7⁴	IHC、WB*、ICC-IF
HPA005781	抗TACC3	IHC、WB
HPA007066	抗TAPBP	IHC
HPA000262	抗TBC1D9	IHC、ICC-IF
HPA046156	抗TCTE3	IHC
HPA017019	抗TGFBI	IHC
HPA051855	抗TMEM110-MUSTN1	IHC
HPA016579	抗TMEM222	IHC、ICC-IF
HPA046658	抗TMEM47	IHC
HPA018216	抗TMEM68	IHC、ICC-IF
HPA005487	抗TPX2	IHC、WB、ICC-IF
HPA003054	抗TTLL12	IHC、WB
HPA023605	抗UBE20	IHC、WB*
HPA042302	抗WFDC2	IHC
HPA050514	抗WNT3A	IHC
HPA006811	抗ZBTB7B	IHC、WB*、ICC-IF
HPA009637	抗ZKSCAN3	IHC、ICC-IF
HPA007023	抗ZNF131	IHC
HPA049770	抗ZNF627	IHC、WB
HPA039116	抗ZNF662	IHC、WB

* ヒトとげっ歯類の両サンプルのWB

Ngan E, Diamond B. 2012. LPP is Required for TGF-Beta Induced Motility and Invasion of Neu/ErbB-2 Expressing Breast Cancer Cells. https://doi.org/10.21236/ada568114

Stro?mberg S, Agnarsdo?ttir M, Magnusson K, Rexhepaj E, Bolander Å, Lundberg E, Asplund A, Ryan D, Rafferty M, Gallagher WM, et al. 2009. Selective Expression of Syntaxin-7 Protein in Benign Melanocytes and Malignant Melanoma. J. Proteome Res.. 8(4):1639-1646. https://doi.org/10.1021/pr800745e

がんバイオマーカーの特定

乳がん

乳がんは二番目によくみられるがんであり、女性では群を抜いて最も発現頻度が高いがんです。乳がんの発生率は、徐々に増加していますが、それに伴った死亡率の増加はみられません。初期に見つかる場合、先進国では予後は比較的良好であり、一般的な5年生存率は約85%です。

乳がんと治療

がんは、しばしば単一疾患として称されますが、実は多種の疾患を指します。このような理解は、長年かけて進展してきましたが、多くの患者が自分に最適ながん治療を受けられていません。がん患者がより個々に適した治療を受けるために、患者を層別化する、より良い方法が引き続き求められています。腫瘍のステージおよびグレードのような従来の予後ファクターは患者の予後を正しく推測するには不十分です。がんバイオマーカーから得られる追加情報は、このような推測を大幅に改善し、最終的には個々の患者に適した治療法を導き出し、治療不十分および過剰治療を回避することができると期待されています。

乳がん患者の主要な治癒的治療は外科手術であり、しばしば、アジュバント療法を併用します。しかし、アジュバント療法は、かなり費用がかかり、重篤な副作用を伴うこともあるため、今日、医師は乳がん治療において主に臨床的に必要なことは過剰治療の低減であると認識しています。したがって、患者をさまざまな予後分類に層別化することは、医師が患者に最も適した治療を選択するための助けとなると考えられるため、非常に重要です。

大半の乳がんは、ホルモン受容体に反応を示します。すなわち、エストロゲン受容体（ER）および／またはプロゲステロン受容体（PR）を発現しています。これらの受容体を発現する腫瘍を有する患者は、タモキシフェンのようなアジュバント内分泌療法を受けることができます。

また、乳がんはHER2タンパク質（ヒト上皮成長因子受容体2）を発現することもあり、このようなタンパク質を発現する腫瘍を有する患者は、トラスツズマブによるアジュバント療法を受けることができます。

アジュバント療法には、化学療法または放射線療法も含まれることがあります。

RBM3

RNA結合モチーフタンパク質3（RBM3）は、RNAおよびDNA結合タンパク質です。これらの機能は完全には解明されていません。軽度低体温、およびグルコース欠乏や低酸素症のような細胞ストレスと関連するその他の状態の初期事象として、発現することが明らかになっています1。ストレスがかかるときに、RBM3は、生存に必要なタンパク質合成の維持を促進して細胞を保護すると考えられています¹。最近、RBM3は前立腺がん細胞において幹細胞様の特性を弱めることも示されました²。

Human Protein Atlas（HPA）プロジェクトの一環（proteinatlas.org）として検討された複数のがんで認められる差次的発現パターンから、RBM3は、HPAにより腫瘍バイオマーカー候補として特定されています^3,4。

抗RBM3抗体のHPA003624を用いたIHC解析において、正常な乳房組織における発現パターンは弱いものでしたが、乳がん組織では階層的な発現パターンが認められました（図1）。研究者がさらに大規模な乳がんコホートを対象として詳細に発現を検討したところ、RBM3の発現は、長期生存と関連することが明らかになりました⁵。

Ehlén Å. 2011. Te Role of RNA-Binding Motif 3 in Epithelial Ovarian Cancer: A Biomarker Discovery Approach .

Zeng Y, Wodzenski D, Gao D, Shiraishi T, Terada N, Li Y, Vander Griend DJ, Luo J, Kong C, Getzenberg RH, et al. 2013. Stress-Response Protein RBM3 Attenuates the Stem-like Properties of Prostate Cancer Cells by Interfering with CD44 Variant Splicing. Cancer Res. 73(13):4123-4133. https://doi.org/10.1158/0008-5472.can-12-1343

Berglund L, Björling E, Oksvold P, Fagerberg L, Asplund A, Al-Khalili Szigyarto C, Persson A, Ottosson J, Wernérus H, Nilsson P, et al. 2008. A Genecentric Human Protein Atlas for Expression Profiles Based on Antibodies. Mol Cell Proteomics. 7(10):2019-2027. https://doi.org/10.1074/mcp.r800013-mcp200

図1. 抗RBM3抗体（HPA003624）を用いた免疫組織染色では、正常乳房組織（A）では弱い発現が認められ、乳がんサンプル（B、C）では弱い～強いまでさまざまな強度の差次的発現が認められる

乳がんの予後バイオマーカーとしてのRBM3

研究者は、RBM3を予後バイオマーカー候補として特定した後、さらに大規模な乳がんコホートを対象にRBM3タンパク質の発現を検討しました1。ステージIIの浸潤性乳がんを認める閉経前の女性500例から成るコホートにおいて、RBM3の発現は、小型で、低グレードの、エストロゲン受容体（ER）陽性の腫瘍と関連していることが明らかになりました。ER陽性患者の一部について解析したところ、RBM3は、無再発生存（RFS）の独立した予測因子でした。図2に示すとおり、RBM3タンパク質の発現量が多い腫瘍の患者の生存は、RBM3発現量が少ない腫瘍の患者よりも良好でした。

RBM3タンパク質の発現は、さまざまながん型の多数の患者コホートを対象にしてさらに詳細に解析されています。RBM3の発現量は、乳がん¹、結腸がん²、卵巣がん^3,4、精巣がん、尿路上皮がん⁵、および前立腺がん⁶、ならびに悪性黒色腫⁷の患者の生存と有意な関係があることが明らかになっています。

RBM3は乳がんおよびその他の複数のがんにおいて良好な予後を示すマーカーであると結論されます。

図2.ER陽性乳がん患者におけるRBM3発現量で分類した無再発生存（RFS）についてのKaplan-Meier（生存）解析。患者をRBM3発現量の高低に基づいて2群に分けている。

RBM3抗体

Atlas抗体製品では、ポリクローナルHPA003624およびPrecisAモノクローナルAMAb90655の2種の抗RBM3抗体を取り揃えています。モノクローナル抗RBM3抗体AMAb90655は、ヒト細胞株のウェスタンブロッティングにおいて優れた特異性が認められており、IHCのホルマリン固定パラフィン包埋組織の染色に一般的に使用されています（図3）。

図3.乳がん（左）および前立腺がん（右）についてのAMAb90655を使用したRBM3発現のIHC分析では、腫瘍細胞で核陽性が認められる。AMAb90655を用いて行ったヒト細胞株RT4ライセートのWBの画像には、17 kDaの予測されるバンドが認められる乳がん患者の生存率低下と関係することが示されました。

参考文献

Granulin

Granulinは、単一の前駆体タンパク質から開裂して生成される分泌型グリコシル化ペプチドのファミリーです。単一ペプチドの開裂によって、成熟Granulinが産生されますが、それはさらに開裂を受けてさまざまな活性型ペプチドになる可能性もあります。これらの開裂産物は、Granulin A、Granulin B、Granulin Cなどと呼ばれます。ペプチドと開裂していないGranulinタンパク質はどちらも、細胞増殖を制御します。Granulinタンパク質ファミリーに属する種々のメンバーは、細胞増殖に対して阻害因子、刺激因子として働く場合もあり、両作用を持っていることもあります。Granulinファミリーメンバーは、正常な成長、創傷治癒および腫瘍形成において重要です［2008年7月、RefSeq提供］。

Elkabetsらの論文では、GRNを発現させた骨髄細胞をマウスの応答腫瘍へリクルートすることによって、応答腫瘍の発生におけるGRN発現の役割を研究しています¹。特定の腫瘍は他の腫瘍増殖または解剖学的に遠位に位置する転移細胞の増殖を助長することができ、それは腫瘍の扇動（tumor instigation）と呼ばれています。この研究において、激しく増殖するヒト乳がん細胞をマウスに移植したところ、これらの細胞は、移植しなければ、腫瘍形成性が低く不活性である形質転換細胞を刺激して増殖させることが明らかになりました。GRNは、扇動している骨髄細胞の中で最も増加させる遺伝子と特定されました。GRN発現細胞は、常在の線維芽細胞を誘導して、悪性腫瘍の増殖を促進する遺伝子を発現させました。抗がん療法において、GRNまたは活性化されたGRN発現細胞をターゲットにすることにより、これらの細胞株によるがん増殖促進の伝達を破壊できるのではないかと推測されました。

抗GRN抗体のHPA028747を使用して乳がん患者のコホート由来の腫瘍組織を解析したところ、高いGRN発現は、悪性度の非常に高いトリプルネガティブ基底細胞様腫瘍のサブタイプと相関し、患者生存率の低下と関連することが明らかになりました（図4）。

参考文献

図4.抗体HPA028747により、GRN発現は悪性の腫瘍サブタイプと相関がみられ、乳がん患者の生存率低下と関係することが示された。左の図は、各カテゴリー［トリプルネガティブ（TN）／基底細胞腫瘍または基底細胞以外の腫瘍］において高いGRN陽性を示す腫瘍の割合を示す。右のKaplan-Meier解析は、GRN発現陽性の場合（緑）またはGRN発現陰性の場合（青）と生存の関係を示す。

Granulin抗体

Atlas抗体には、HPA008763およびHPA028747の2種のポリクローナル抗GRN抗体を取り揃えています。

抗GRN抗体（HPA008763）を用いたヒト膵臓組織のIHC染色では外分泌腺細胞に強力な細胞質陽性が認められます。ICC-IFでは、A-431細胞の小胞に陽性が認められます。

ihc-analysis-using-the-anti-grn-antibody

抗GRN抗体HPA028747 を用いたIHC分析では、正常十二指腸組織の腺細胞に強力な細胞質陽性が認められ、U-251 MG細胞では小胞陽性が認められます。

Anillin

Anillinは、マイクロフィラメント（細胞骨格成分の1つ）のサブユニットであるアクチン結合タンパク質です。Anillinは、大部分の細胞に発現し、運動性、分裂およびシグナル伝達のような基本的な細胞機能に関与しています。Anillin発現の研究から、いくつかのヒト腫瘍でAnillinが過剰発現していることが明らかになっています。

乳がんにおける治療の予後予測バイオマーカーとしてのAnillin

Anillinの発現は、乳がんと診断された患者から得られた467件のサンプルから成る患者コホートを対象に、抗ANLN抗体のHPA005680により分析されています。Anillinの発現量が高い腫瘍を有する患者の無再発生存率（RFS）は、Anillin発現量の低い患者のRFSよりも低くなりました（図5A）。乳がん特異的生存率（BCSS）を分析したところ、Anillin発現と生存率低下に同様の関係が認められると考えられました（図5B）。O´Learyらによる研究では、Cox回帰分析により、Anillinの予後に対する影響が確認されました。単変量解析、ならびに診断時の腫瘍サイズとグレード、年齢、リンパ節、 ER、PR、HER2およびKi67 の状態について調整した多変量解析では、Anillin発現量が高いとBCSSおよびRFSに低下が見られました。

Anillinは乳がんについて予後不良を示すマーカーであると結論されます。

図5. 乳がん患者におけるAnillin発現量で分類した無再発生存率（A）および乳がん特異的生存率（B）についてのKaplan-Meier（生存）解析患者をAnillin発現量の高低に基づいて2群に分けている。

参考文献

Anillin Antibodies

Atlas抗体では、モノクローナルAMAb90660 およびAMAb90662、ならびにポリクローナルHPA005680の3種類の抗ANLN抗体を取り揃えています。

抗ANLN抗体（HPA005680）は、IHCにより、ヒト精巣内の輸精管細胞で強力な核陽性を示します。ICC-IFでは、A-431細胞の核（核小体ではない）は陽性を示します。また、本抗体は、RT-4およびU-251 MGの細胞ライセートを用いたWBで、予測されるサイズのバンドを検出します。

抗ANLN抗体AMAb90660は、肺腺がんの一部の腫瘍細胞で強力な核免疫反応を示し、ヒト細胞株U-251 MGにおいて予測されるサイズのバンドを検出します。

抗ANLN抗体AMAb90662は、大腸がんの一部の腫瘍細胞で強力な核免疫反応を示し、ヒトU-251 MG細胞において予測されるサイズのバンドを検出します。

ログインして続行

続きを確認するには、ログインするか、新規登録が必要です。

アカウントをお持ちではありませんか？

乳がん研究用Prestige Antibodies®（Prestige抗体）

Human Protein Atlas

Human Protein Atlasではヒトプロテオームの特性評価を実施

2014年11月のHuman Protein Atlas

乳房組織サンプルおよび細胞株を用いたバリデーション

参考文献

Atlas Antibodies社のPrestige Antibodies®（Prestige抗体）

Prestige抗体 – HPAの構成要素

製品開発

認可

Prestige抗体のラインナップ

モノクローナル抗体の開発

独自の特徴

クローンの選択

エピトープマッピング

アイソタイピング

ハイブリドーマ細胞の培養

抗体の特性評価

臨床マーカー（ESR1、HER2、Ki67、PGR）

確立された臨床乳がんマーカー

乳がん研究で使用されるPrestige抗体

参考文献

MammaPrint、Oncotype、EndoPredictおよびuPA検査における遺伝子産物に対する抗体

Human Protein Atlasで同定されている抗体

乳がんサンプルにおけるIHC染色パターンの差異

がんバイオマーカーの特定

乳がん

乳がんと治療

RBM3

RBM3抗体

参考文献

Granulin

参考文献

Granulin抗体

Anillin

乳がんにおける治療の予後予測バイオマーカーとしてのAnillin

参考文献

Anillin Antibodies

乳がん研究用Prestige Antibodies^®（Prestige抗体）

Atlas Antibodies社のPrestige Antibodies^®（Prestige抗体）