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Merck

C111000

Sigma-Aldrich

DMT-dC(bz) ホスホロアミダイト

別名:

DMT-dC(bz)アミダイト, N-ベンゾイル-5'-O-[ビス(4-メトキシフェニル)フェニルメチル]-2'-デオキシシチジン,3'-[2-シアノエチルN,N-?ビス(1-メチルエチル)ホスホロアミダイト], N4-ベンゾイル-5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-2'-デオキシシチジン-3'-O-[O-(2-シアノエチル)-N,N'-ジイソプロピルホスホロアミダイト], シチジン、N-ベンゾイル-5'-O-[ビス(4-メトキシフェニル)フェニルメチル]-2'-デオキシ-,3'-[2-シアノエチルビス(1-メチルエチル)ホスホロアミダイト]

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About This Item

実験式(ヒル表記法):
C46H52N5O8P
CAS番号:
分子量:
833.91
MDL番号:
UNSPSCコード:
41116107
PubChem Substance ID:
NACRES:
NA.51

由来生物

non-animal source (no BSE/TSE risk)

品質水準

タイプ

for DNA synthesis

製品種目

Proligo Reagents

アッセイ

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

形状

powder or granules

テクニック

oligo synthesis: suitable

不純物

≤0.3 wt. % water content (Karl Fischer)

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

核酸プロファイル

base: deoxycytidine
base protecting group: benzoyl
2' protecting group: none
5' protecting group: DMT
deprotection: standard

保管温度

2-8°C

SMILES記法

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)N3C=CC(NC(=O)c4ccccc4)=NC3=O)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C46H52N5O8P/c1-32(2)51(33(3)4)60(57-29-13-27-47)59-40-30-43(50-28-26-42(49-45(50)53)48-44(52)34-14-9-7-10-15-34)58-41(40)31-56-46(35-16-11-8-12-17-35,36-18-22-38(54-5)23-19-36)37-20-24-39(55-6)25-21-37/h7-12,14-26,28,32-33,40-41,43H,13,29-31H2,1-6H3,(H,48,49,52,53)/t40-,41+,43+,60?/m0/s1

InChI Key

PGTNFMKLGRFZDX-SALLYJDFSA-N

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詳細

DMT-dC(bz)ホスホロアミダイトは、DNAホスホロアミダイトのグループに属します。主な特徴は以下のとおりです:
  • 環外アミン機能は、ベンゾイル基(dA(bz)およびdC(bz))またはイソブチリル基(dG(ib))によって保護
  • 推奨される切断および脱保護条件は、標準的な塩基部保護オリゴヌクレオチドでは、濃縮アンモニア溶液を用いて55 °Cで8時間または室温で24時間
  • ProligoのDNAホスホロアミダイトの高いカップリング効率により、高収率で高品質のオリゴヌクレオチドを取得可能

試験成績書(COA)

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