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臭化エチジウム 溶液

suitable for fluorescence, ~1% in H₂O

• 別名: 3,8-ジアミノ-5-エチル-6-フェニルフェナントリジニウムブロミド, EtBr, 臭化ホミジウム
• 実験式（ヒル表記法）: C₂₁H₂₀BrN₃
• CAS番号: 1239-45-8
• 分子量: 394.31
• UNSPSC Code: 12161505
• NACRES: NA.32
• PubChem Substance ID: 57650684
• MDL number: MFCD00011724
• Beilstein/REAXYS Number: 3642536

特性

• Quality Segment: 100
• concentration: ~1% in H₂O
• fluorescence: λ_ex 480 nm; λ_em 620 nm in H₂O, λ_ex 518 nm; λ_em 605 nm (bound to DNA), λ_ex 530 nm; λ_em 600 nm in 50 mM phosphate buffer pH 7.0 (upon binding to DNA)
• suitability: suitable for fluorescence
• storage temp.: 2-8°C
• SMILES string: [Br-].CC[n+]1c(-c2ccccc2)c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc14
• InChI: 1S/C21H19N3.BrH/c1-2-24-20-13-16(23)9-11-18(20)17-10-8-15(22)12-19(17)21(24)14-6-4-3-5-7-14;/h3-13,23H,2,22H2,1H3;1H
• InChI key: ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N

詳細

Application

臭化エチジウム(EtBr)は、PAGEまたはアガロースゲル電気泳動で核酸の染色に最も一般的に使用されています。EtBrの蛍光は、二本鎖RNAに結合すると21倍に、二本鎖DNAに結合すると25倍に増加するため、低濃度(10 μg/mL)で染色する場合はバックグラウンドを脱色する必要がありません。臭化エチジウムは、核酸に対する蛍光分析で多数使用されています。一本鎖DNAと(強力ではないが)結合し、また三本鎖DNAと結合することが示されています。DNAに結合する能力があることから、EtBrはDNAポリメラーゼの阻害剤です。

Biochem/physiol Actions

臭化エチジウムは二本鎖のDNAとRNAとにインターカレーションし、フレームシフト型変異原物質として作用します。生存細胞、アポトーシス細胞、および壊死細胞を区別するため、アクリジンオレンジと併用することもできます。

Preparation Note

電気泳動後のゲルの染色に用いる場合は、ストック溶液を水で0.5 μg/mlに希釈して、15~30分間ゲルを浸漬します。通常、脱色の必要はありませんが、バックグラウンドを下げる必要がある場合は水に15分間浸漬します。染色後、UVライトボックス(波長254 nm)上でDNAのバンドを検出します。ゲルおよび泳動用バッファーに臭化エチジウムを0.5 μg/mlとなるよう添加しておくと、泳動終了後すぐにバンド検出を行なうことができます。

安全性情報

• pictograms: GHS06,GHS08
• signalword: Danger
• hcodes: H331,H341
• pcodes: P202 - P261 - P271 - P280 - P304 + P340 + P311 - P308 + P313
• Hazard Classifications: Acute Tox. 3 Inhalation - Muta. 2
• 保管分類: 6.1D - Non-combustible acute toxic Cat.3 / toxic hazardous materials or hazardous materials causing chronic effects
• wgk: nwg
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable
• ppe: Eyeshields, Faceshields, Gloves, type ABEK (EN14387) respirator filter