Sintesi peptidica

Un peptide è costituito da due o più amminoacidi legati tra loro da un legame ammidico a formare una catena composta di norma da 2 – 70 amminoacidi. I peptidi si distinguono dalle proteine perché non hanno bisogno di essere ripiegati per esplicare la loro attività biologica. Sono peptidi endogeni alcuni ormoni come l’angiotensina, LHRH e l’encefalina; anche diverse tossine animali e vegetali sono costituite da peptidi. I peptidi rivestono grande interesse come lead per il drug discovery e come farmaci essi stessi. Trovano inoltre applicazione nei vaccini, nei biomateriali e nelle sonde molecolari (p.es. per applicazioni istologiche), e vengono ampiamente utilizzati come antigeni per generare anticorpi. 

I peptidi vengono preparati per sintesi chimica in soluzione o in fase solida. Il processo consiste nella formazione controllata e selettiva di un legame ammidico fra un amminoacido N-protetto e un amminoacido che presenta il gruppo amminico libero e la funzione carbossilica protetta. Nella sintesi in fase solida, il gruppo di protezione del carbossile è legato ad un supporto polimerico. Dopo la formazione del legame, il gruppo che protegge il gruppo amminico del dipeptide viene rimosso e si procede con l'accoppiamento del successivo amminoacido N-protetto.

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Figure 2 Side-chain protecting groups for Boc solid-phase peptide synthesis (SPPS)

La sintesi peptidica in fase solida (SPPS) è il metodo usato più di frequente per la sintesi peptidica, grazie alla sua efficienza, alla sua semplicità, alla sua velocità ed alla facilità con cui è possibile condurla in parallelo. La SPPS consiste nell’aggiunta in sequenza di residui amminoacidici con il gruppo amminico e le catene laterali protette a un amminoacido o a un peptide attaccato ad un supporto polimerico insolubile (Figura 1).

Per la protezione dell’azoto N-α si ricorre a un gruppo tert-butilossicarbonile (Boc) sensibile agli acidi (Boc SPPS) o a un gruppo Fmoc sensibile alle basi (Fmoc SPPS). Dopo la rimozione di questo gruppo protettivo, si procede all'aggiunta del successivo amminoacido protetto utilizzando o un reagente di accoppiamento o un amminoacido protetto e pre-attivato. L’amminoacido C-terminale è ancorato alla resina attraverso un linker, la cui natura determina le condizioni necessarie per rilasciare il peptide dal supporto dopo l’estensione della catena. I gruppi di protezione delle catene laterali sono spesso scelti in modo che vengano rimossi contestualmente al distacco del peptide dalla resina (Figure 2 e 3).

Figure 3. Side-chain protecting groups for Fmoc solid-phase peptide synthesis (SPPS)

La maggior parte dei peptidi viene preparata con il metodo Fmoc perché il distacco finale e la deprotezione sono condotte mediante trattamento con acido trifluoroacetico, contrariamente al metodo Boc che necessita di HF anidro liquido, altamente tossico e corrosivo, e di attrezzatura specializzata.

Di routine è possibile preparare peptidi di 50 amminoacidi, ma sono note in letteratura assai comunemente sintesi di proteine con oltre 100 amminoacidi. Proteine più lunghe possono essere ottenute mediante ligazione chimica in ambiente nativo di peptidi completamente deprotetti in soluzione. Con questo metodo è possibile sintetizzare peptidi naturali che sono difficili da esprimere in batteri, incorporare D-amminoacidi o amminoacidi artificiali e originare peptidi ciclici, ramificati, marcati o peptidi post-traslazionalmente modificati.

La sintesi peptidica in fase liquida, condotta di solito facendo ricorso alla protezione con gruppi Boc o benzilossicarbossile (Z), è stata soppiantata dalla sintesi in fase solida, con l’eccezione dei processi di sintesi su larga scala di peptidi per finalità industriali.

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