07-354
Anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18)
serum, Upstate®
Synonyme(s) :
H3K18Ac, Histone H3 (acetyl K18)
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About This Item
Code UNSPSC :
12352203
eCl@ss :
32160702
Nomenclature NACRES :
NA.41
Produits recommandés
Source biologique
rabbit
Niveau de qualité
Forme d'anticorps
serum
Type de produit anticorps
primary antibodies
Clone
polyclonal
Espèces réactives
yeast, Saccharomyces cerevisiae, human
Réactivité de l'espèce (prédite par homologie)
vertebrates (most common)
Fabricant/nom de marque
Upstate®
Technique(s)
ChIP: suitable (ChIP-seq)
dot blot: suitable
western blot: suitable
Numéro d'accès NCBI
Numéro d'accès UniProt
Conditions d'expédition
dry ice
Modification post-traductionnelle de la cible
acetylation (Lys18)
Informations sur le gène
human ... H3C1(8350)
Description générale
L'histone H3 est l'une des 5 principales protéines de type histone impliquées dans la structure de la chromatine dans les cellules eucaryotes. Caractérisée par un domaine principal globulaire et une longue queue N-terminale, l'histone H3 détermine la structure en "collier de perles" des nucléosomes.
L'histone H3 est acétylée au niveau de plusieurs résidus lysine différents de sa queue par une famille d'enzymes connues sous le nom d'histone acétyltransférases (HAT).
L'histone H3 est acétylée au niveau de plusieurs résidus lysine différents de sa queue par une famille d'enzymes connues sous le nom d'histone acétyltransférases (HAT).
Spécificité
Reconnaît l'histone H3 acétylée au niveau du résidu lysine 18.
Immunogène
Peptide de synthèse (GKAPRAcKQLASK-C) conjugué à de la KLH et correspondant aux acides aminés 13 à 23 de l'histone H3 de levure acétylée au niveau du résidu lysine 18, avec ajout d'une cystéine C-terminale à des fins de conjugaison.
Application
Immunoprécipitation de la chromatine :
Données d'un lot représentatif.
De la chromatine préparée à partir de cellules HeLa (1 x 10E6 équivalents cellulaires par IP) et passée aux ultrasons à été soumise à une immunoprécipitation de la chromatine avec soit 2 µl de sérum de lapin normal, soit 2 µl d'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18), et le kit Magna ChIP A (réf. 7-610). Le succès de l'immunoprécipitation de fragments d'ADN associés à l'acétyl-histone H3 (Lys18) a été vérifié par qPCR en utilisant des amorces de contrôle spécifiques de la région promotrice du gène GAPDH comme locus positif, et des amorces de globine β comme locus négatif. Les données sont présentées sous la forme d'un pourcentage d'"input" de chaque échantillon d'IP par rapport à la chromatine "input" pour chaque amplicon et chaque échantillon de ChIP, comme indiqué.
Pour les détails expérimentaux, se référer au protocole du kit EZ-Magna ChIP A (réf. 17-408) ou EZ-ChIP (réf. 17-371).
Séquençage ChIP :
Données d'un lot représentatif. Une immunoprécipitation de la chromatine a été réalisée avec le kit Magna ChIP HiSens (réf. 17-10460), 2 μg d'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (réf. 07-354), 20 µl de billes avec protéine A/G, et la chromatine de 1e6 cellules HeLa réticulée, suivie d'une purification de l'ADN à l'aide de billes magnétiques. Des banques ont été préparées à partir des échantillons d'ADN "input" et ChIP selon des protocoles standard avec des adaptateurs à code-barres Illumina, puis analysées sur un appareil Illumina HiSeq. Plus de dix millions de lectures ("read") tirées de fichiers FastQ ont été alignées ("mapped") avec Bowtie (http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml), après suppression des étiquettes ("tag") avec TagDust (http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource/). Les pics ont été identifiés à l'aide de l'algorithme MACS (http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/), après visualisation des pics et des lectures sous forme de piste personnalisée ("custom track") dans UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu) à partir de fichiers BigWig et BED.
Analyse par western blotting :
Données d'un lot représentatif.
De l'histone H3 recombinante (piste 1, réf. 14-494) et des extraits acides de cellules HeLa (réf. 17-305) traitées au butyrate de sodium (piste 2) et non traitées (piste 3) ont été mis en présence de l'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (dilution au 1/10 000e).
La flèche indique l'acétyl-histone H3 (Lys18) (17 kDa).
Dot blot :
Données d'un lot représentatif.
40 ng et 4 ng de peptides d'histone portant diverses modifications (voir tableau 1) ont été transférés sur une membrane en PVDF et mis en présence de l'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (dilution au 1/5000e). Les protéines ont été visualisées à l'aide d'une IgG de chèvre anti-lapin conjuguée à de la HRP et d'un système de détection par chimiluminescence. L'image présentée correspond à une exposition de 60 secondes.
Données d'un lot représentatif.
De la chromatine préparée à partir de cellules HeLa (1 x 10E6 équivalents cellulaires par IP) et passée aux ultrasons à été soumise à une immunoprécipitation de la chromatine avec soit 2 µl de sérum de lapin normal, soit 2 µl d'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18), et le kit Magna ChIP A (réf. 7-610). Le succès de l'immunoprécipitation de fragments d'ADN associés à l'acétyl-histone H3 (Lys18) a été vérifié par qPCR en utilisant des amorces de contrôle spécifiques de la région promotrice du gène GAPDH comme locus positif, et des amorces de globine β comme locus négatif. Les données sont présentées sous la forme d'un pourcentage d'"input" de chaque échantillon d'IP par rapport à la chromatine "input" pour chaque amplicon et chaque échantillon de ChIP, comme indiqué.
Pour les détails expérimentaux, se référer au protocole du kit EZ-Magna ChIP A (réf. 17-408) ou EZ-ChIP (réf. 17-371).
Séquençage ChIP :
Données d'un lot représentatif. Une immunoprécipitation de la chromatine a été réalisée avec le kit Magna ChIP HiSens (réf. 17-10460), 2 μg d'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (réf. 07-354), 20 µl de billes avec protéine A/G, et la chromatine de 1e6 cellules HeLa réticulée, suivie d'une purification de l'ADN à l'aide de billes magnétiques. Des banques ont été préparées à partir des échantillons d'ADN "input" et ChIP selon des protocoles standard avec des adaptateurs à code-barres Illumina, puis analysées sur un appareil Illumina HiSeq. Plus de dix millions de lectures ("read") tirées de fichiers FastQ ont été alignées ("mapped") avec Bowtie (http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml), après suppression des étiquettes ("tag") avec TagDust (http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource/). Les pics ont été identifiés à l'aide de l'algorithme MACS (http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/), après visualisation des pics et des lectures sous forme de piste personnalisée ("custom track") dans UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu) à partir de fichiers BigWig et BED.
Analyse par western blotting :
Données d'un lot représentatif.
De l'histone H3 recombinante (piste 1, réf. 14-494) et des extraits acides de cellules HeLa (réf. 17-305) traitées au butyrate de sodium (piste 2) et non traitées (piste 3) ont été mis en présence de l'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (dilution au 1/10 000e).
La flèche indique l'acétyl-histone H3 (Lys18) (17 kDa).
Dot blot :
Données d'un lot représentatif.
40 ng et 4 ng de peptides d'histone portant diverses modifications (voir tableau 1) ont été transférés sur une membrane en PVDF et mis en présence de l'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (dilution au 1/5000e). Les protéines ont été visualisées à l'aide d'une IgG de chèvre anti-lapin conjuguée à de la HRP et d'un système de détection par chimiluminescence. L'image présentée correspond à une exposition de 60 secondes.
Utilisez l'anticorps polyclonal de lapin anti-acétyl-histone H3 (Lys18), validé en ChIP et WB, pour détecter l'acétyl-histone H3 (Lys18), aussi appelée H3K18Ac ou histone H3 (acétyl K18).
Qualité
Produit évalué en routine par immunoblot sur des extraits acides de cellules HeLa traitées au butyrate de sodium
Description de la cible
17 kDa
Liaison
Remplace : 04-1107
Forme physique
100 μl de sérum de lapin contenant 0,05 % d'azoture de sodium et 30 % de glycérol.
Autres remarques
Concentration : La concentration de chaque lot figure sur le certificat d'analyse.
Informations légales
UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
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Code de la classe de stockage
12 - Non Combustible Liquids
Classe de danger pour l'eau (WGK)
WGK 1
Point d'éclair (°F)
Not applicable
Point d'éclair (°C)
Not applicable
Certificats d'analyse (COA)
Recherchez un Certificats d'analyse (COA) en saisissant le numéro de lot du produit. Les numéros de lot figurent sur l'étiquette du produit après les mots "Lot" ou "Batch".
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