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Sigma-Aldrich

2-Methylnicotinic acid imidazolide

Synonyme(s) :

(1H-imidazol-1-yl)(2-methylpyridin-3-yl)methanone, 1H-Imidazol-1-yl(2-methyl-3-pyridinyl)methanone, 3-(1H-imidazole-1-carbonyl)-2-methylpyridine, NAI, RNA SHAPE probe, RNA structure probe, mNAI

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About This Item

Formule empirique (notation de Hill):
C10H9N3O
Numéro CAS:
1055970-47-2
Poids moléculaire :
187.20
Numéro MDL:
MFCD25954959
Code UNSPSC :
12352106
Nomenclature NACRES :
NA.22

Forme

powder

Niveau de qualité

100

Pf

68-72 °C

Température de stockage

2-8°C

InChI

1S/C10H9N3O/c1-8-9(3-2-4-12-8)10(14)13-6-5-11-7-13/h2-7H,1H3

Clé InChI

OWQPEDNXDCVXJO-UHFFFAOYSA-N

Application

2-Methylnicotinic acid imidazolide (NAI or mNAI) is an RNA SHAPE probe for live-cell RNA structure profiling. SHAPE -- or selective 2′-hydroxyl acylation analyzed by primer extension -- uses small, electrophilic chemical probes to react with the 2′-hydroxyl group and provides insight to RNA structure and its dynamics in varied cells states or in cells with gene knockouts. It has also been extended to the SHALiPE approach, selective 2′-hydroxyl acylation with lithium ion-based primer extension.

Autres remarques

Conditional control of RNA-guided nucleic acid cleavage and gene editing

Guidelines for SHAPE Reagent Choice and Detection Strategy for RNA Structure Probing Studies

SnapShot: RNA Structure Probing Technologies

Structural Analysis using SHALiPE to Reveal RNA G-Quadruplex Formation in Human Precursor MicroRNA

Determination of in vivo RNA structure in low-abundance transcripts

Produit(s) apparenté(s)

Réf. du produit
Description
Tarif

Code de la classe de stockage

11 - Combustible Solids

Classe de danger pour l'eau (WGK)

WGK 3

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable

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Lot/Batch Number
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Robert C Spitale et al.
Nature chemical biology, 9(1), 18-20 (2012-11-28)
RNA structure has important roles in practically every facet of gene regulation, but the paucity of in vivo structural probes limits current understanding. Here we design, synthesize and demonstrate two new chemical probes that enable selective 2'-hydroxyl acylation analyzed by
Shao-Ru Wang et al.
Nature communications, 11(1), 91-91 (2020-01-05)
Prokaryotes use repetitive genomic elements termed CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) to destroy invading genetic molecules. Although CRISPR systems have been widely used in DNA and RNA technology, certain adverse effects do occur. For example, constitutively active CRISPR

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