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N8630

Sigma-Aldrich

Nucléase P1 from Penicillium citrinum

lyophilized powder, ≥200 units/mg protein (E1%/280, 3′-5′-Phosphodiesterase)

Synonyme(s) :

3′-phosphohydrolase, Nucléase 5′-nucléotide-hydrolase, Endonucléase P1

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About This Item

Numéro CAS:
54576-84-0
Numéro de classification (Commission des enzymes):
3.1.30.1 (BRENDA, IUBMB)
Numéro MDL:
MFCD00131010
Code UNSPSC :
12352204
Nomenclature NACRES :
NA.54
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.

Source biologique

Penicillium citrinum

Niveau de qualité

200

Forme

lyophilized powder

Activité spécifique

≥200 units/mg protein (E1%/280, 3′-5′-Phosphodiesterase)

secondary activity

≥1,000 units/mg protein 3′-nucleotidase

Poids mol.

42-50 kDa

Conditionnement

vial of ≥250 units (using RNA substrate)

Technique(s)

DNA extraction: suitable
DNA purification: suitable

Adéquation

suitable for molecular biology

Application(s)

cell analysis

Température de stockage

2-8°C

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Description générale

La nucléase P1 est l'une des nucléases spécifiques des acides nucléiques simple brin les plus connues en biologie moléculaire ; c'est une endonucléase spécifique des acides nucléiques simple brin (ADNsb ou ARNsb). La nucléase P1 est également capable de cliver des régions simple brin sur des acides nucléiques double brin.
La nucléase P1 de Penicillium citrinum est une endonucléase dépendante du zinc qui devient plus active en présence de faibles concentrations d'urée. [1] L'activité sélective de la nucléase P1 trouve des applications utiles dans l'étude de la structure des acides nucléiques.

Application

  • La nucléase P1 clive l'ARN ou l'ADN simple brin en 5' mononucléotides.
  • La nucléase P1 facilite la recherche sur la dégradation et la modification de l'ADN.
  • La nucléase P1 permet d'analyser la structure et la composition en bases des acides nucléiques.
  • La nucléase P1 est traditionnellement utilisée dans la production industrielle de 5′ mononucléotides à partir d'ARN levurien.
  • La nucléase P1 permet d'extraire les acides nucléiques par purification protéique.
  • La nucléase P1 est un réactif essentiel pour la mise au point de procédés dans la recherche sur la biosynthèse des acides aminés dépendante de l'ARNt et la transamidation dépendante de l'ARNt.
  • La nucléase P1 de Penicillium citrinum a servi à étudier des structures cristallines avec du sulfate d'ammonium ou du polyéthylèneglycol 4000 comme agent de précipitation.
  • La nucléase P1 a été utilisée dans une étude sur une technique d'analyse directe des séquences de 20 à 25 nucléotides des régions terminales d'un ARN marqué par des groupements d'extrémité 5′ ou 3′.
  • La nucléase P1 permet d'améliorer la sensibilité d'une technique de marquage au 32P pour la détection d'adduits à l'ADN.
Cette enzyme présente une température optimale d'environ 70 °C, mais il est préférable de la maintenir à une température inférieure à 60 °C pour une incubation de longue durée. Elle est stable à un pH compris entre 5 et 8.
Cette enzyme présente une température optimale d'environ 70 °C, mais il est préférable de la maintenir à une température inférieure à 60 °C pour une incubation de longue durée. Elle est stable à un pH compris entre 5 et 8.

Actions biochimiques/physiologiques

Cette enzyme catalyse le clivage endonucléolytique non spécifique de l'ARN et de l'ADN simple brin pour former des nucléoside 5′-phosphates et des 5′-phosphooligonucléotides. Elle ne dégrade pas de manière appréciable les acides nucléiques double brin, notamment en présence de plus de 400 mM de chlorure de sodium, à pH 6,0.

Caractéristiques et avantages

Notre nucléase P1 ultra-active est soumise à des tests afin de garantir son activité 3′-5′-phosphodiestérase et son activité 3′-nucléotidase : c'est la nucléase P1 la plus active du marché.

Propriétés physiques

Il s'agit d'une glycoprotéine dépendante du zinc constituée de 270 résidus d'acides aminés. Masse moléculaire : 42 à 50 kDa.

Définition de l'unité

3′-5′-phosphodiestérase : Une unité libère 1,0 μmol de nucléotides d'ARN solubles en milieu acide par minute, à pH 5,3 et à 37 °C.
3′-nucléotidase : Une unité hydrolyse 1,0 μmol d'orthophosphate de 3′-AMP par minute, à pH 7,2 et à 37 °C.

Pictogrammes

Health hazard
GHS08

Mention d'avertissement

Danger

Mentions de danger

H334

Conseils de prudence

P261 - P284 - P501

Classification des risques

Resp. Sens. 1

Code de la classe de stockage

11 - Combustible Solids

Classe de danger pour l'eau (WGK)

WGK 3

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable

Équipement de protection individuelle

Eyeshields, Gloves, type N95 (US)

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Certificats d'analyse (COA)

Lot/Batch Number
0000399439
0000387196
0000281586
0000360402
0000340475

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Xiaohuan Jin et al.
Nucleic acids research, 47(2), 883-898 (2018-12-07)
Modified nucleosides on tRNA are critical for decoding processes and protein translation. tRNAs can be modified through 1-methylguanosine (m1G) on position 37; a function mediated by Trm5 homologs. We show that AtTRM5a (At3g56120) is a Trm5 ortholog in Arabidopsis thaliana.
A Lahm et al.
Journal of molecular biology, 215(2), 207-210 (1990-09-20)
P1 nuclease, a zinc-dependent single-strand specific endonuclease from Penicillium citrinum, has been crystallized in three different space groups using either ammonium sulphate or polyethylene glycol 4000 as the precipitating agent. The crystals diffract to between 3 A and 2.2 A.
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Nature communications, 9(1), 24-24 (2018-01-04)
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M V Reddy et al.
Carcinogenesis, 7(9), 1543-1551 (1986-09-01)
Exceedingly sensitive procedures are required to detect the presence of covalent DNA adducts in humans exposed to environmental genotoxicants because of low levels of such derivatives (1 adduct in 10(8)-10(10) DNA nucleotides). A 32P-postlabeling assay for detection and quantitation of
Fahimeh Salehi et al.
Scientific reports, 8(1), 13902-13902 (2018-09-19)
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Questions

1–3 of 3 Questions  

  1. I have to prepare a 1mg/ml solution in ZnCl2. How can I do to convert the 200units/mg of nuclease P1 to mass?

    1 answer

    1. The minimum protein content for this product is 1 mg/vial. It is best to review the lot specific Certificate of Analysis prior to reconstitution as the vial content may be slightly higher that 1mg. The product may then be reconsituted in water to the desired concentration. Please see the links below to review the product datasheet and to access the corresponding Certificate:

      Product Datasheet
      https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/product/documents/272/311/n8630pis-ms.pdf

      Certificate of Analysis
      https://www.sigmaaldrich.com/search

      Helpful?

  2. Product N8630 (Nuclease P1 from Penicillium citrinum is a lyophilized powder. How should I store solutions of this enzyme?

    1 answer

    1. A solution of Nuclease P1 that has been reconstituted in 20 mM sodium acetate buffer (pH 5.3), 5 mM ZnCl2, and 50 mM sodium chloride can be stored for the short term at 2-8 °C for 2-3 weeks. For longer term storage, at -20 °C, one suggestion is to add 40-50% glycerol after reconstitution in the aqueous buffer. Such solutions (with glycerol added) may be stored for 3-6 months at -20 °C.

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  3. What is the Department of Transportation shipping information for this product?

    1 answer

    1. Transportation information can be found in Section 14 of the product's (M)SDS.To access the shipping information for this material, use the link on the product detail page for the product.

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