A4718

Agarosa

for molecular biology

• Sinónimos: 3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan
• Número de CAS: 9012-36-6
• EC Number: 232-731-8
• MDL number: MFCD00081294
• UNSPSC Code: 41105317
• PubChem Substance ID: 24890904
• NACRES: NA.25

Propiedades

• biological source: algae (marine)
• Quality Level: 200
• grade: for molecular biology
• form: powder
• technique(s): electrophoresis: suitable
• EEO: ≤0.05
• mp: ≤75 °C (3% gel)
• transition temp: gel point ≤35 °C (3% gel)
• foreign activity: DNase, RNase, NICKase, none detected
• storage temp.: room temp
• InChI: 1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
• InChI key: MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Descripción

General description

Agarose is a polymer extracted from agar or agar-bearing marine algae. This purified linear galactan hydrocolloid comprises alternating co-polymers D-galactose and 3,6-anhydro-L-galactose units connected by α-(1→3) and β-(1→4) glycosidic bonds. Agarose is highly biocompatible and possesses variable mechanical and diffusion properties. Agarose can be used as a gelling agent, to separate nucleic acids electrophoretically.

Application

Agarose has been used in the preparation of microgel slides employed in lysis and electrophoresis. It has also been used in the gel electrophoresis to separate restriction enzyme digested products in catechol-O-methyltransferase (COMT) genotyping

Ideal for the separation of small DNA fragments (e.g., PCR products) differing in size by as little as 2% and compares to the resolution of DNA in polyacrylamide gels. High resolution agarose is also ideal for resolving amplification fragment length polymorphisms (AmpFLP), short tandem repeats (STR) and tri- and tetranucleotide repeats.
Low ethidium bromide and SYBR Green background staining

Analysis Note

A continuación se presenta una lista de las propiedades asociadas a nuestras agarosas:
Contenido de sulfatos - utilizados como un indicador de pureza, ya que los sulfatos constituyen el principal grupo iónico presente.
Fuerza del gel - la fuerza que debe aplicarse a un gel para provocar su fractura.
Punto de gelificación - la temperatura a la cual una disolución acuosa de agarosa forma un gel cuando se enfría. Las disoluciones de agarosa exhiben histéresis en la transición de líquido a gel - es decir, su punto de gelificación no es el mismo que su temperatura de fusión.
Electroendosmosis (EEO) - movimiento de líquido a través del gel. En un gel de agarosa, los grupos aniónicos están pegados a la matriz y no pueden moverse, pero los contra-cationes disociables pueden migrar en la matriz hacia el cátodo, dando lugar a EEO. Dado que el movimiento electroforético de los biopolímeros suele ser en dirección al ánodo, la EEO puede alterar las separaciones debido a la convección interna.

Información de seguridad

• Storage Class: 11 - Combustible Solids
• wgk_germany: WGK 3
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable
• ppe: Eyeshields, Gloves, type N95 (US)