Agarose : propriétés et applications en recherche

Qu'est-ce que l'agarose ?

L'agarose est un polysaccharide qui est isolé et purifié à partir de l'agar-agar ou d'algues marines porteuses d'agar-agar (varech). L'agarose est un polymère naturel dont la structure chimique est constituée d'une alternance de motifs β-D-galactose et 3,6-anhydro-L-galactose du disaccharide agarobiose. Ce polymère linéaire forme des chaînes qui créent des fibres qui sont flexibles et forment un réseau de canaux de 50 nm à 200 nm de diamètre, selon la quantité d'agarose utilisée.

Comment l'agarose est-il utilisé ?

L'agarose est non toxique et possède plusieurs propriétés et caractéristiques qui le rendent utile comme agent gélifiant dans de nombreuses applications telles que l'électrophorèse d'acides nucléiques, les techniques d'immunodiffusion, les plaques ou superpositions de gel pour cellules en culture tissulaire, les milieux de culture cellulaire, la chromatographie sur gel, la chromatographie d'affinité et la chromatographie d'échange d'ions. L'électrophorèse sur gel est une technique de laboratoire courante en sciences de la vie, utilisée pour extraire des molécules biologiques en fonction de leur taille, par exemple en séparation d'ADN et détection d'ADN.

Principales propriétés de l'agarose

• Teneur en sulfates - Utilisée comme indicateur de sa pureté, les sulfates étant le principal groupement ionique présent.
• Force du gel - Force qui doit être exercée sur un gel pour le rompre.
• Point de gélification - Température à laquelle une solution d'agarose aqueuse forme un gel en refroidissant. Les solutions d'agarose présentent une hystérésis lors de leur passage de l'état liquide à l'état de gel. En d'autres termes, leur point de gélification est différent de leur température de fusion.
• Électro-endosmose (EEO) - Fait référence au déplacement d'un liquide à travers un gel. Les groupements anioniques d'un gel d'agarose sont fixés à la matrice et ne peuvent pas migrer, alors que les contre-cations dissociables migrent vers la cathode dans la matrice, générant l'EEO. Puisque l'électrophorèse des biopolymères se fait généralement vers l'anode, l'EEO peut interférer avec la séparation par une convection interne.