A9539

Agarose

BioReagent, Molecular Biology, low EEO

• Synonym(e): 3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan, Agarose LE
• CAS-Nummer: 9012-36-6
• UNSPSC Code: 41105317
• PubChem Substance ID: 24891469
• EC Number: 232-731-8
• NACRES: NA.25
• MDL number: MFCD00081294

Eigenschaften

• biological source: algae (marine)
• Quality Segment: 200
• grade: Molecular Biology
• product line: BioReagent
• form: powder
• technique(s): electrophoresis: suitable
• impurities: ≤10% moisture content
• EEO: 0.09-0.13
• transition temp: gel point 36 °C ±1.5 °C (1.5% gel)
• gel strength: ≥1200 g/cm² (1% gel)
• anion traces: sulfate (SO₄^2-): ≤0.15%
• suitability: suitable for electrophoresis, suitable for molecular biology
• foreign activity: DNase, RNase, none detected
• SMILES string: O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O
• InChI: 1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
• InChI key: MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Beschreibung

General description

Agarose ist ein natürliches Polysaccharid, das aus den Algenarten Gelidium und Gracilaria isoliert wird. Strukturell handelt es sich um ein lineares Polymer, das aus alternierenden D-Galactose- und 3,6-Anhydro-L-Galactose-Einheiten besteht.[1]

Application

Agarose wird wie folgt eingesetzt:

• bei der Gelelektrophorese zur Analyse der DNA-Integrität
• zur Vorbereitung von Hydrokolloid-Gelen und Untersuchung des strukturellen Einflusses von Gelen auf die Freisetzung von Kohlenhydraten
• bei der Gelelektrophorese zur Analyse der RNA-Integrität
• geeignet für Proteinanwendungen wie Ouchterlony und radiale Immundiffusion (RID).

Biochem/physiol Actions

Agarose dient als Geliermittel und wird in der molekularbiologischen Forschung weithin zur Trennung und Analyse von Nukleinsäuren durch Gelelektrophorese oder Blotten (Northern oder Southern) eingesetzt. Während der Gelbildung kombinieren Agarose-Polymere nicht kovalent, was zu einem Netz aus Bündeln führt, deren Porengrößen die molekularen Siebeigenschaften eines Gels bestimmen. Der Typ und die Konzentration der Agarose beeinflussen die Migrationsgeschwindigkeit eines DNA-Moleküls durch ein Gel.[1] Agarose weist jedoch auch attraktive Eigenschaften auf, die ein starkes Interesse an ihrer Verwendung in biologischen Anwendungen wecken. Es ist bekannt, dass sie die extrazelluläre Matrix nachahmt, was sie zu einem ausgezeichneten Biomaterial für gewebetechnische Anwendungen (Tissue Engineering) macht. Aufgrund seiner hervorragenden Wasseraufnahmefähigkeit ist Agarose für die Zellverkapselung geeignet. Agarose ermöglicht die regulierte Permeation von Sauerstoff und Nährstoffen und ist nützlich beim Zellwachstum, bei der Differenzierung und Proliferation. Agarose wird in der kontrollierten/lokalisierten Arzneimittelverabreichung und regenerativen Medizin eingesetzt, wie z. B. für die Neurogenese, Angiogenese, Spermatogenese, Knorpelbildung, Knochenregeneration, Wundheilung und beim künstlichen Pankreas.

Features and Benefits

• Biokompatibel
• Agarosegele haben bei niedrigen Konzentrationen größere Porengrößen als Polyacrylamid-Gele
• Im Gegensatz zu Polyacrylamid ist die Konsistenz der Gele fester (aber auch weniger elastisch)
• Verfügt über eine geringe Hintergrundfärbung mit Ethidiumbromid und SYBR Green

Analysis Note

Nachfolgend finden Sie eine Liste der Eigenschaften unserer Agarosen:
Sulfatgehalt - dient als Indikator für die Reinheit, da Sulfat die hauptsächlich vorhandene Ionengruppe ist.
Gelstärke - die Kraft, die aufgewendet werden muss, damit ein Gel zerbricht.
Gelierpunkt - die Temperatur, bei der die wässrige Agaroselösung beim Abkühlen geliert. Agaroselösungen zeigen beim Übergang von der Flüssigkeit zum Gel Hysterese - das bedeutet, dass die Temperatur des Gelierpunkts nicht dieselbe ist wie die Schmelztemperatur.
Elektroendosmose (EEO) - Bewegung einer Flüssigkeit durch das Gel. Anionische Gruppen sind in einem Agarosegel an die Matrix gebunden und können sich nicht bewegen, aber dissoziierbare Gegenkationen können in der Matrix in Richtung der Kathode wandern und führen zu EEO. Da die elektrophoretische Bewegung der Biopolymere normalerweise in Richtung der Anode stattfindet, kann EEO die Auftrennung aufgrund von interner Konvektion stören.

Other Notes

Gewinner des CiteAb Award 2024 in der Kategorie „Supplier Succeeding in Parkinson′s Research“ (Erfolgreiche Anbieter in der Parkinson-Forschung)

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Sicherheitshinweise

• Lagerklasse: 11 - Combustible Solids
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable
• ppe: Eyeshields, Gloves, type N95 (US)