A9539

Agarose

BioReagent, Molecular Biology, low EEO

• Synonyme(s) : 3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan, Agarose LE
• Numéro CAS: 9012-36-6
• UNSPSC Code: 41105317
• PubChem Substance ID: 24891469
• EC Number: 232-731-8
• NACRES: NA.25
• MDL number: MFCD00081294

Propriétés

• biological source: algae (marine)
• Quality Segment: 200
• grade: Molecular Biology
• product line: BioReagent
• form: powder
• technique(s): electrophoresis: suitable
• impurities: ≤10% moisture content
• EEO: 0.09-0.13
• transition temp: gel point 36 °C ±1.5 °C (1.5% gel)
• gel strength: ≥1200 g/cm² (1% gel)
• anion traces: sulfate (SO₄^2-): ≤0.15%
• suitability: suitable for electrophoresis, suitable for molecular biology
• foreign activity: DNase, RNase, none detected
• SMILES string: O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O
• InChI: 1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
• InChI key: MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Description

General description

L'agarose est un polysaccharide naturel isolé à partir d'algues appartenant aux genres Gelidium et Gracilaria. Du point de vue structural, il s'agit d'un polymère linéaire constitué d'une alternance de motifs D-galactose et 3,6-anhydro-L-galactose.[1]

Application

L'agarose a été utilisé :

• en électrophorèse sur gel pour analyser l'intégrité de l'ADN.
• pour préparer des gels hydrocolloïdaux et étudier l'influence structurale des gels sur la libération de glucides.
• en électrophorèse sur gel pour analyser l'intégrité de l'ARN.
• dans certaines applications relatives aux protéines comme la méthode d'Ouchterlony et l'immunodiffusion radiale (RID).

Biochem/physiol Actions

L'agarose sert d'agent gélifiant et est énormément utilisé dans la recherche en biologie moléculaire pour séparer et analyser les acides nucléiques par électrophorèse sur gel ou par transfert (northern blotting ou southern blotting). Durant la gélification, les polymères d'agarose s'associent de manière non covalente en formant un réseau de chaînes dont la taille des pores définit les propriétés de tamisage moléculaire du gel. Le type et la concentration de l'agarose influent sur la vitesse de migration des molécules d'ADN au sein du gel.[1] L'agarose présente aussi des caractéristiques attractives qui suscitent un vif intérêt dans le domaine de la biologie. Il est connu pour imiter la matrice extracellulaire, ce qui en fait un excellent biomatériau pour les applications d'ingénierie tissulaire. Du fait de sa forte capacité d'absorption d'eau, l'agarose peut être utilisé dans l'encapsulation cellulaire. L'agarose régule la perméation de l'oxygène et des nutriments et est utile à la croissance, la différenciation et la prolifération des cellules. L'agarose est employé dans l'administration contrôlée/localisée de médicaments et la médecine régénératrice, dans des domaines tels que la neurogenèse, l'angiogenèse, la spermatogenèse, la formation de cartilage, la régénération osseuse, la cicatrisation et le pancréas artificiel.

Features and Benefits

• Produit biocompatible.
• Les gels d'agarose ont une dimension de pores inférieure à celle des gels de polyacrylamide à faible concentration.
• Contrairement au polyacrylamide, la consistance des gels d'agarose est plus solide (mais aussi moins élastique).
• L'agarose présente une faible coloration du fond au bromure d'éthidium et au colorant SYBR Green.

Analysis Note

Nos agaroses ont les propriétés suivantes :
Teneur en sulfates : sert d'indicateur de pureté, le sulfate étant le principal groupement ionique présent.
Force du gel : équivaut à la force qu'il faut appliquer sur le gel pour le rompre.
Point de gélification : correspond à la température à laquelle une solution aqueuse d'agarose forme un gel en refroidissant. Les solutions d'agarose présentent une hystérésis lorsqu'elles passent de la forme liquide à la forme gélifiée, ce qui signifie que leur point de gélification n'est pas égal à leur température de fusion.
Électro-endosmose (EEO) : définit un mouvement de liquide à travers le gel. Les groupements anioniques d'un gel d'agarose sont fixés à la matrice et ne peuvent pas bouger, mais les contre-ions positifs dissociables peuvent migrer dans la matrice en direction de la cathode, créant ainsi une EEO. Comme le déplacement électrophorétique des biopolymères se fait généralement vers l'anode, l'EEO peut perturber les séparations en raison d'une convection interne.

Other Notes

Lauréat du prix CiteAb 2024 récompensant les avancées des fournisseurs dans la recherche sur la maladie de Parkinson

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Informations sur la sécurité

• Classe de stockage: 11 - Combustible Solids
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable
• ppe: Eyeshields, Gloves, type N95 (US)