Saltar al contenido
Merck

Direct metabolomics for plant cells by live single-cell mass spectrometry.

Nature protocols (2015-08-28)
Takashi Fujii, Shuichi Matsuda, Mónica Lorenzo Tejedor, Tsuyoshi Esaki, Iwao Sakane, Hajime Mizuno, Naohiro Tsuyama, Tsutomu Masujima
RESUMEN

Live single-cell mass spectrometry (live MS) provides a mass spectrum that shows thousands of metabolite peaks from a single live plant cell within minutes. By using an optical microscope, a cell is chosen for analysis and a metal-coated nanospray microcapillary tip is used to remove the cell's contents. After adding a microliter of ionization solvent to the opposite end of the tip, the trapped contents are directly fed into the mass spectrometer by applying a high voltage between the tip and the inlet port of the spectrometer to induce nanospray ionization. Proteins are not detected because of insufficient sensitivity. Metabolite peaks are identified by exact mass or tandem mass spectrometry (MS/MS) analysis, and isomers can be separated by combining live MS with ion-mobility separation. By using this approach, spectra can be acquired in 10 min. In combination with metabolic maps and/or molecular databases, the data can be annotated into metabolic pathways; the data analysis takes 30 min to 4 h, depending on the MS/MS data availability from databases. This method enables the analysis of a number of metabolites from a single cell with rapid sampling at sub-attomolar-level sensitivity.

MATERIALES
Referencia del producto
Marca
Descripción del producto

Sigma-Aldrich
Agua, Nuclease-Free Water, for Molecular Biology
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Agua, sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Agua, for embryo transfer, sterile-filtered, BioXtra, suitable for mouse embryo cell culture
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ácido perclórico, 70%, 99.999% trace metals basis
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Agua, for molecular biology, sterile filtered
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Metanol, JIS special grade, ≥99.8%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Agua, BioPerformance Certified
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo, anhydrous, 99.8%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Metanol, SAJ first grade, ≥99.5%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Metanol, anhydrous, 99.8%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Agua, for cell biology, sterile ultrafiltered
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Agua, PCR Reagent
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo, electronic grade, 99.999% trace metals basis
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ácido perclórico, 0.1 M
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Supelco
Acetonitrilo, HPLC grade, ≥99.93%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Metanol, suitable for HPLC
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo, ≥99.8%, suitable for HPLC
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Metanol, SAJ special grade
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Agua, endotoxin, free
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Metanol, suitable for HPLC, gradient grade, 99.93%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Metanol, NMR reference standard
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo, ≥99.8%, for residue analysis, JIS 300
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
DL-Tyrosine, 99%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo, JIS special grade, ≥99.5%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Methanol solution, NMR reference standard, 4% in methanol-d4 (99.8 atom % D), NMR tube size 3 mm × 8 in.
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Methanol-12C, 99.95 atom % 12C
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Acetonitrilo
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad