CRISPR RNP 基於基因組編輯的應用
雖然 CRISPR 系統可以透過質粒傳遞到細胞中,但直接引入 Cas9 RNP 可消除質粒 DNA 整合到宿主基因組中的可能性,從而加強和擴大 CRISPR 基因組修飾技術的應用。RNP 復合物可提供更快速的基因編輯,因為功能性核酸酶可立即在細胞中使用,而且復合物會快速降解和清除,使編輯活性變得短暫。縮短 RNP 在細胞中的可用時間可減少脫靶效應。
圖 1.具有 Cas9 蛋白的 CRISPR 一部份和二部份系統示意圖,展示核糖核蛋白 (RNP) 的組成。在產生雙鏈斷裂之後,細胞 DNA 機器會採取兩種可能的修復途徑:非同源末端接合 (NHEJ)、Indel 形成或針對性插入或敲入的同源定向修復 (HDR)。
詳細方案
我們的合成指南與廣泛的基因編輯應用相容。無論您需要的是一般使用指南、胚胎的核感染及顯微注射、T 細胞編輯或 iPSC 協議。您也可以在下游裂解效率評估、克隆分離 & 篩選和故障排除方面找到幫助。
使用 RNP 進行原代 T 細胞編輯
以核酸核蛋白 (RNP) 為基礎的基因組編輯實驗從未像 Sigma-Aldrich® 合成 合成導向 RNA 和 Cas9 蛋白那樣容易,然而有些細胞可能比其他細胞更難編輯。我們已經廣泛地驗證了我們的試劑和協議,可以在最具挑戰性的應用中工作,包括在原代 T 細胞中,當嘗試敲入或敲除一個構建或基因時,需要克服許多重大的挑戰。然而,使用 sgRNA,可以在原代人類 T 細胞中實現編輯,其效率和特異性超過了兩部分導向系統(以下數據表的圖 2 )。sgRNAs 可以作為高度特異性的成對缺口酶和 Cas9 缺口酶導入,或作為單位點 SpCas9 蛋白質導入,以獲得 PD-1 基因的完全敲除,通過 PD-1 表達和 NGS 測定(以下資料表的圖 2 )。sgRNA 可以快速設計成任何基因的單一目標 RNA 或成對缺口酶系統的一部分,非常適合各種人類細胞類型,包括原代 T 細胞。Cas 核酸酶以蛋白形式遞送,預先與單一、經修訂的導向 RNA (gRNA) 複合,而不是編碼在質粒上,可讓研究人員繞過 CRISPR 在治療領域中使用的歷史限制因素,即非靶向效應、低效率以及細胞對外來 DNA 的不良反應。當您需要確定時, Sigma-Aldrich® sgRNAs 是唯一有 100% 性能保證的導向 RNAs --預先設計的 和 定制序列。
圖 2.使用 RNP Nickase 系統進行編輯,只有單一活性切割域,然後與近端導向 RNA 成對遞送,可以精確地進行雙鏈斷裂,並在較難編輯的細胞類型中提供超特異和高效的基因組編輯。
在小鼠胚胎中經過驗證的高性能基因編輯
創建小鼠模型是一個勞動密集和昂貴的過程,但它對了解健康和疾病的基礎研究至關重要。Sigma-Aldrich® sgRNA 的性能經過測試 ,在小鼠胚胎中的多個基因組位點,將我們的 sgRNA 與其他頂尖提供商的 sgRNA 進行比較,以測試我們的 sgRNA 在小鼠胚胎中基因組工程應用的最高水準。
Sigma-Aldrich® sgRNA 與其他頂尖供應商之間在每個位點的多個複製並排比較顯示了相同 sgRNA 目標之間編輯效率的差異。另外,Sigma-Aldrich®sgRNA 對胚胎存活率的毒性沒有增加。 總的來說, 數據顯示我們的高活性和高純度 sgRNAs 在獨立機構進行的實驗中提供了優於競爭對手的基因編輯效果,而無需對胚胎進行顯微注射或電穿孔。
圖 3.傳統上,在小鼠胚胎中進行基因編輯是一個漫長的過程,然而,使用 CRISPR 進行基於 RNP 的編輯可以降低複雜性。小鼠模型可以快速產生,幾乎適用於任何目標。我們合成的 sgRNA 適用於胚胎的顯微注射和電穿孔。
相關產品
表 1:Cas9 蛋白產品
表 2: 其他相關產品
。疑難排解
如果沒有觀察到切削,並且有理由懷疑是實驗缺陷造成的錯誤,以下注意事項可能有助於實驗的疑難排解。
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