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一般shRNA常见问题解答

何为shRNA?

shRNA 是慢病毒构建体 LTR 区域内的短发夹序列。LTR-LTR 区域整合到宿主基因组中后,由细胞生成shRNA并穿梭到细胞质中,并在此被 Dicer 酶复合物切割。切割完成,这种双链分子的一条链就会载入 RISC(RNA 诱导沉默复合体),在此寻找互补的 mRNA 靶标进行降解。

我们保证,在 shRNA 详情页面上描述的针对靶基因建立的指定数量克隆(数目不一,通常为5条克隆),至少会有一条克隆达到70%以上的靶基因敲低率。

目前以细菌甘油原液形式提供
目前以慢病毒转导颗粒形式提供
我们会不断更新自己的基因组合产品。这类产品以甘油或慢病毒形式提供。未来几个月将提供更多套装。如果您关注的基因集暂无可用,请向我们咨询高级定制制剂。我们随时可为您组装定制基因集。

包含靶标基因3' UTR的克隆,可以在引入与靶标对应的cDNA克隆时,可以回补敲低表型。相对于内源性基因,从外源性cDNA克隆的转录不易被沉默。许多论文/评论委员会要求进行此类实验确认观测到的表型。遗憾的是,尽管大多数靶基因集具有这一附加特性,但并非全部含有3' UTR克隆。

设计MISSION® TRC克隆文库所用的算法与TRC页面基本相同。但由于是Broad-TRC克隆文库,设计会出现许多改进。您在公共TRC页面查找到的克隆并非最新设计版本。最新的靶基因集仅可通过我们提供给TRC会员。

我们在复制后随机对克隆进行序列验证。我们对最后复制的大约 5% 的克隆进行测序。我们的研发小组未观察到任何重组迹象。TRC 库已被克隆到经过优化以避免这些问题的骨架中。

MISSION® TRC shRNA文库由三种形式组成,兼具灵活性和便利性。纯化质粒 DNA 形式可直接用于瞬时转染分析,或与我们的慢病毒包装混合物(货号SHP001)结合生产慢病毒颗粒。您可将质粒转化为感受态细胞(我们推荐 GC5 细胞),进一步扩增 DNA 以制成细菌甘油原液。

慢病毒颗粒提供了最大的便利性。它们可直接加入细胞以进行稳定转导。没错,转导的细胞将继续表达掺入的 shRNA。这类细胞可扩增用于许多下游分析。

我们针对人类和小鼠基因组提供了多种 shRNA 克隆,通常约为 5 钟。此文库通常也可包含其他物种,我们的生物信息学团队可帮助您解决这个问题。每个目标克隆可选择三种形式:细菌甘油原液、纯化质粒 DNA 和慢病毒颗粒。有关订购MISSION®产品的更多信息,请单击此处

不需要。您可使用现有的质粒 DNA 转染方法。如果您未转染过质粒 DNA,我们推荐使用ESCORT V转染试剂。

更多实验方案请见我们的实验方案页面

这是由 The RNAi Consortium(RNAi 联盟)开发的唯一编号,用于识别 TRC 库。TRC 编号以“TRCN”开头,后跟 10 位数字。(例如MISSION® shRNA TRCN0000030720)。

如果您出于研究目的从我们这里购买MISSION® TRC产品,我们会向您提供 Oxford BioMedica 专利和 Benitec 专利的标签许可。但如果您从其他来源购买慢病毒 shRNA 载体,则需要额外购买这些专利的许可。我们提供的许可仅供研究使用。请咨询你们的法律部门,了解有关自由使用的意见。

是的。商业应用需要联系 OxfordBioMedica 和 Benitec 单独获取许可。

DNA 和甘油原液可多次冻融; 尽管我们强烈建议避免过多冻融。也就是说,多次冻融慢病毒库会严重影响病毒的功能。我们建议在第一次解冻后等分,最大限度提高未来实验的病毒活率。

我们提供用于蛋白质检测的高质量验证抗体。此外,我们还提供一系列 PCR 相关产品。

非病毒递送:裸shRNA、聚合物和脂质递送试剂病毒递送:慢病毒、逆转录病毒和腺病毒。

我们与 Broad 合作,每月验证数千种 shRNA,并在我们的网站上公布这些数据供您评估。

通过SYBR Green qPCR确定特定 shRNA 的相对沉默效果。

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