MBD0037

Inaktywowane Vibrio harveyi

Suitable for DNA extraction, PCR, sequencing, next generation sequencing

• Kod UNSPSC: 12352200
• NACRES: NA.51

Właściwości

• Poziom jakości: 200
• Formularz: powder
• stężenie: >10^8 bacteria/vial
• metody: FISH: suitable
• Warunki transportu: dry ice
• temp. przechowywania: −20°C

Opis

Opis ogólny

Standaryzacja analizy próbek jest obecnie niezbędna w badaniach nad genomiką mikrobiomów. Brak standaryzacji może prowadzić do stronniczości i błędów we wspólnych procesach podczas przygotowywania i analizy próbek, takich jak amplifikacja próbek, sekwencjonowanie i analizy bioinformatyczne.1 Standard inaktywowanych komórek Vibrio har veyi może służyć jako standard do analizy porównawczej wydajności w toku analiz mikrobiomu lub meta-genomiki oraz jako narzędzie zwiększające powtarzalność i umożliwiające porównanie wyników uzyskanych przez różne laboratoria.

Ponieważ V. Harveyi nie jest typowym mieszkańcem ludzkiej mikrobioty, może służyć jako standard spike-in w analizie przepływu pracy genomiki ludzkiej mikrobioty.

V. harveyi to gram ujemna, pręcikowata, ruchliwa, heterotroficzna morska bakteria patogenna, która powszechnie zamieszkuje naturalne środowiska wodne. Należy do rodziny Vibrionaceae z klasy Gammaproteobacteria 2, znanej jako poważny patogen bakteryjny ryb morskich i bezkręgowców, w tym krewetek penaeid w akwakulturze 2,3.

V. harveyi ma zdolność regulowania ekspresji genów poprzez quorum sensing. Aktualne badania 4,5,6 wskazują na 3 cząsteczki regulatorowe, które pośredniczą w wykrywaniu kworum u V. harveyi: lakton homoseryny (HAI-1), diester boranu furanozylu (AI-2) i autoinduktor cholery 1 (CAI-1). Szlak quorum sensing, który reguluje bioluminescencję, tworzenie biofilmu i inne czynniki wirulencji u V. harveyi jest bardzo podobny do szlaku, który reguluje ekspresję czynników wirulencji u Vibrio cholerae, 7, 8 czyniąc V. harveyi ważnym systemem modelowym dla badań nad zdrowiem człowieka.

Zastosowanie

• Rozmrażać liofilizowane komórki w temperaturze pokojowej przez 5 minut.
• Użyj 1 ml wody o czystości molekularnej (nr kat. W4502), aby ponownie zawiesić liofilizowane komórki, pipetuj, aż wszystkie komórki zostaną zawieszone.
• Przenieś zawieszone komórki do czystej probówki Eppendorfa o pojemności 1,5 ml.
• Zawieszone bakterie mogą być używane jako kontrola i/lub spike-in do ekstrakcji gDNA z próbek mikrobiomu.

Nadaje się do ekstrakcji DNA, PCR, sekwencjonowania, sekwencjonowania nowej generacji.

Postać fizyczna

Inaktywowane bakterie są dostarczane w ilości >10^8 bakterii/fiolkę w postaci liofilizowanego proszku.

Inne uwagi

Zaleca się unikanie długotrwałego przechowywania zawieszonych komórek.

Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Informacja o środkach bezpieczeństwa

• Kod klasy składowania: 11 - Combustible Solids
• Klasa zagrożenia wodnego (WGK): WGK 3