Accéder au contenu
Merck

Feasibility of detecting prostate cancer by ultraperformance liquid chromatography-mass spectrometry serum metabolomics.

Journal of proteome research (2014-06-13)
Xiaoling Zang, Christina M Jones, Tran Q Long, María Eugenia Monge, Manshui Zhou, L DeEtte Walker, Roman Mezencev, Alexander Gray, John F McDonald, Facundo M Fernández
RÉSUMÉ

Prostate cancer (PCa) is the second leading cause of cancer-related mortality in men. The prevalent diagnosis method is based on the serum prostate-specific antigen (PSA) screening test, which suffers from low specificity, overdiagnosis, and overtreatment. In this work, untargeted metabolomic profiling of age-matched serum samples from prostate cancer patients and healthy individuals was performed using ultraperformance liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (UPLC-MS/MS) and machine learning methods. A metabolite-based in vitro diagnostic multivariate index assay (IVDMIA) was developed to predict the presence of PCa in serum samples with high classification sensitivity, specificity, and accuracy. A panel of 40 metabolic spectral features was found to be differential with 92.1% sensitivity, 94.3% specificity, and 93.0% accuracy. The performance of the IVDMIA was higher than the prevalent PSA test. Within the discriminant panel, 31 metabolites were identified by MS and MS/MS, with 10 further confirmed chromatographically by standards. Numerous discriminant metabolites were mapped in the steroid hormone biosynthesis pathway. The identification of fatty acids, amino acids, lysophospholipids, and bile acids provided further insights into the metabolic alterations associated with the disease. With additional work, the results presented here show great potential toward implementation in clinical settings.

MATÉRIAUX
Référence du produit
Marque
Description du produit

Sigma-Aldrich
Acétonitrile, suitable for HPLC, gradient grade, ≥99.9%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétone, ACS reagent, ≥99.5%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Dichlorométhane, suitable for HPLC, ≥99.8%, contains amylene as stabilizer
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acide acétique, glacial, ACS reagent, ≥99.7%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétone, suitable for HPLC, ≥99.9%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétonitrile, HPLC Plus, ≥99.9%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Dichlorométhane, contains 40-150 ppm amylene as stabilizer, ACS reagent, ≥99.5%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acide acétique, glacial, ReagentPlus®, ≥99%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétone, HPLC Plus, for HPLC, GC, and residue analysis, ≥99.9%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Dichlorométhane, HPLC Plus, for HPLC, GC, and residue analysis, ≥99.9%, contains 50-150 ppm amylene as stabilizer
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétonitrile, ACS reagent, ≥99.5%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétonitrile, suitable for HPLC, gradient grade, ≥99.9%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acide acétique, glacial, ≥99.99% trace metals basis
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acide acétique solution, suitable for HPLC
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Dichlorométhane, ACS reagent, ≥99.5%, contains 40-150 ppm amylene as stabilizer
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Uric acid, ≥99%, crystalline
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétone, ACS reagent, ≥99.5%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Decanoic acid, ≥99.5%, FCC, FG
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acide acétique, for luminescence, BioUltra, ≥99.5% (GC)
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Decanoic acid, ≥98.0%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
USP
Acétone, United States Pharmacopeia (USP) Reference Standard
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétone, histological grade, ≥99.5%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétonitrile, biotech. grade, ≥99.93%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
USP
Acide acétique glacial, United States Pharmacopeia (USP) Reference Standard
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acide acétique, ≥99.5%, FCC, FG
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Heptadecanoic acid, ≥98%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acide acétique, natural, ≥99.5%, FG
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acétonitrile, anhydrous, 99.8%
Référence
Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité