G115000

DMT-dG(dmf)-Phosphoramidit

≥99.0% (reversed phase HPLC)

• Synonym(e): DMT-dG(dmf)-Amidit, N-[(Dimethylamino)methylen]-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-deoxyguanosin, 3′-[2-Cyanoethyl-N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidit], N2-Dimethylformamidin-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-deoxyguanosin-3′-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N′-diisopropylphosphoramidit]
• Empirische Formel (Hill-System): C₄₃H₅₃N₈O₇P
• CAS-Nummer: 330628-04-1
• Molekulargewicht: 824.90
• MDL-Nummer: MFCD00797420
• UNSPSC-Code: 12352200
• PubChem Substanz-ID: 329799820
• NACRES: NA.51

Eigenschaften

• Typ: for DNA synthesis
• Qualitätsniveau: 200
• Produktlinie: Proligo Reagents
• Assay: ≥99% (³¹P-NMR); ≥99.0% (reversed phase HPLC)
• Form: powder
• Mol-Gew.: 824.90 g/mol
• Methode(n): oligo synthesis: suitable
• Farbe: white to off-white
• λ: conforms (UV/VIS Identity)
• Nukleosidprofil: base: deoxyguanosine; base protecting group: DMF; 2' protecting group: none; 5' protecting group: DMT; deprotection: fast
• Lagertemp.: -10 to -25°C
• SMILES String: COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)n3cnc4C(=O)NC(\N=C/N(C)C)=Nc34)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6
• InChI: 1S/C43H53N8O7P/c1-29(2)51(30(3)4)59(56-24-12-23-44)58-36-25-38(50-28-45-39-40(50)47-42(48-41(39)52)46-27-49(5)6)57-37(36)26-55-43(31-13-10-9-11-14-31,32-15-19-34(53-7)20-16-32)33-17-21-35(54-8)22-18-33/h9-11,13-22,27-30,36-38H,12,24-26H2,1-8H3,(H,47,48,52)/b46-27-/t36-,37+,38+,59?/m0/s1
• InChIKey: YRQAXTCBMPFGAN-UJASEYITSA-N

Beschreibung

Allgemeine Beschreibung

DMT-dG(dmf)-Phosphoramidit ist ein schnelles zur Entschützung eingesetztes Phosphoramidit. Der Entschützungsschritt der automatisierten Oligonukleotidsynthese ist wesentlich für die Synthesedauer und die Qualität des Endprodukts. Der Austausch der dG-Schutzgruppe zur Dimethylformamidin(dmf)-Basen-Schutzgruppe ermöglich die schnelle Synthese eines besonders reinen Oligonukleotids in hoher Ausbeute und erhöht dadurch die Effizienz bei Produktionen mit hohem Durchsatz.

Leistungsmerkmale und Vorteile

Hauptmerkmale von dG(dmf)

• dG(dmf) wird schneller entschützt als herkömmliches dG(ib): Die Entschützungsdauer in konzentriertem Ammoniak wird auf 2 Stunden bei 55 °C oder 1 Stunde bei 65 °C reduziert
• Das dG(dmf)-Monomer eignet sich besonders für G-reiche Sequenzen: Eine unvollständige Entschützung wird im Vergleich zum herkömmlichen dG(ib)-Monomer stark reduziert
• dG(dmf)-Phosphoramidit ist in Lösung so stabil wie die gängigen dA(bz)-,
• dG(dmf)-Phosphoramidit kann dG(ib)-Phosphoramidit direkt substituieren
• Bei Reagenzien, die üblicherweise für die DNA-Synthese verwendet werden, ist keine Änderung erforderlich (nur ein Iod-Oxidationsmittel in geringer Konzentration, d. h. 0,02 M Iod, sollte verwendet werden).

Sicherheitshinweise

• Lagerklassenschlüssel: 11 - Combustible Solids
• WGK: WGK 3
• Flammpunkt (°F): Not applicable
• Flammpunkt (°C): Not applicable