OligoEvaluator™ per il calcolo delle Tm e l’analisi dei primer
OligoEvaluator™ per i primer a DNA o a RNA
OligoEvaluator è uno strumento di analisi dei primer oligonucleotidici. Analizza la struttura secondaria, la formazione di dimeri di primer e le caratteristiche fisiche degli oligonucleotidi.
Siamo lieti di mettere a vostra disposizione OligoEvaluator™, il nostro calcolatore online di sequenze oligonucleotidiche che fornisce i seguenti valori di analisi dei primer per la PCR:
- Numero di basi
- Peso molecolare
- Coefficiente di estinzione
- Tipo di oligo
- µg/OD a 260 nm
- Lunghezza (paia di basi, bp)
- Temperatura di melting (Tm) dei primer (°C)
- Contenuto % di GC
- Clamp di GC
- Run length (bp)
- Struttura secondaria
- Verifica dei dimeri di primer
- Link per la sequenza nel BLAST
Lo strumento è facile da usare: si seleziona DNA o RNA, si incolla la sequenza di interesse e si clicca su calcola per ottenere da OligoEvaluator™ i valori di interesse. Tutte le proprietà refertate sono esportabili in un pratica cartella di lavoro di Excel.
Calcolo delle proprietà degli oligo e dei volumi di risospensione e diluizione
OligoEvaluator™ è suddiviso in tre moduli. Il modulo Analysis elenca tutte le proprietà di un massimo di 10 primer alla volta. Resuspension e Dilution sono moduli di calcolo separati all’interno di OligoEvaluator™.
Funzioni avanzate del calcolatore |
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Reaction Conditions
Definizioni e valori utilizzati nel calcolatore OligoEvaluator™
Come si calcola la temperatura di annealing di un primer?
OligoEvaluator™ fornisce le temperature di melting degli oligo. Basta aggiungere la sequenza nel modulo Analysis del calcolatore e, nella settima colonna, viene visualizzata la Tm. La temperatura di annealing in genere deve essere di molti gradi inferiore al valore della Tm. Informazioni più dettagliate sulla temperatura di melting sono riportate nel nostro articolo Temperatura di melting degli oligonucleotidi.
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