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Merck

Phenotypic analysis of Eschericia coli mutants lacking L,D-transpeptidases.

Microbiology (Reading, England) (2013-07-09)
Akeisha N Sanders, Martin S Pavelka
RESUMEN

Escherichia coli has five genes encoding L,D-transpeptidases (Ldt) with varied functions. Three of these enzymes (YbiS, ErfK, YcfS) have been shown to cross-link Braun's lipoprotein to the peptidoglycan (PG), while the other two (YnhG, YcbB) form direct meso-diaminopimelate (DAP-DAP, or 3-3) cross-links within the PG. In addition, Ldt enzymes can also incorporate non-canonical D-amino acids, such as D-methionine, into the PG. To further investigate the role of these enzymes and, in particular, 3-3 linkages in cell envelope physiology we constructed and phenotypically characterized a variety of multiple Ldt deletion mutants of E. coli. We report that a triple deletion mutant lacking ybiS, erfK and ycfS is hypersusceptible to the metal-chelating agent EDTA, leaks periplasmic proteins and is resistant to the toxic effect of D-methionine. A double ynhG ycbB mutant had no discernible phenotype; however, examination of the phenotypes of various Ldt mutants bearing an additional DAP auxotrophic mutation (dapA : : Cm) showed that a quintuple mutant strain lacking all Ldt genes was severely impaired for growth on media with limited DAP. These data demonstrate that loss of the E. coli Ldt enzymes involved with coupling the PG to Braun's lipoprotein resulted in the loss of outer membrane stability while loss of the Ldt enzymes involved with DAP-DAP linkages had no observable effect on the cell envelope. Loss of all Ldt enzymes proved detrimental to growth when cells were starved for DAP, indicating a combined role for both 3-3 and Braun's lipoprotein cross-links in cell viability only under a specific PG stress.

MATERIALES
Referencia del producto
Marca
Descripción del producto

Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, suitable for electrophoresis, for molecular biology, 99.0-101.0% (titration)
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid solution, 0.02% in DPBS (0.5 mM), sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, anhydrous, crystalline, BioReagent, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, 99.995% trace metals basis
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid calcium disodium salt hydrate
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, ACS reagent, 99.4-100.6%, powder
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, ACS reagent, 99.0-101.0%
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, Sigma Grade, suitable for plant cell culture, 98.5-101.5%
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution, 2%, solution
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution, BioUltra, for molecular biology, pH 8.0, ~0.5 M in H2O
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution, for molecular biology, 0.5 M in H2O, DNase, RNase, NICKase and protease, none detected
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, anhydrous, BioUltra, ≥99% (titration)
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, reagent grade, 98.5-101.5% (titration)
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, purified grade, ≥98.5%, powder
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, meets analytical specification of Ph. Eur., BP, USP, FCC, 99.0-101.0%
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, JIS special grade, ≥99.5%
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Supelco
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, Pharmaceutical Secondary Standard; Certified Reference Material
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution, 0.1 M
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution, 0.05 M
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution, 0.01 M
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, 98.5-101.5%, BioUltra
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, ≥98.0% (KT)
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, BioUltra, for molecular biology, ≥99.0% (T)
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, ≥97.0% (KT)
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, BioUltra, ≥99.0% (KT)
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution, 0.02 M
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution
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Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, SAJ special grade, ≥99.0%
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Sigma-Aldrich
Ácido etilenodiaminotetraacético disodium salt dihydrate, SAJ first grade, ≥98.0%
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