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17-10264

Sigma-Aldrich

Anticorps ChIPAb+ JHDM1B

from rabbit, purified by affinity chromatography

Synonyme(s) :

JMJD, Lysine (K)-specific demethylase 2B, F-box protein FBL10, [Histone-H3]-lysine-36 demethylase 1B, JEMMA (Jumonji domain, EMSY-interactor, methyltransferase motif) protein, F-box and leucine-rich repeat protein 10, Protein containing CXXC domain 2, Ju

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About This Item

Code UNSPSC :
12352203
eCl@ss :
32160702
Nomenclature NACRES :
NA.32

Source biologique

rabbit

Niveau de qualité

Clone

polyclonal

Produit purifié par

affinity chromatography

Espèces réactives

horse, mouse, pig, human

Réactivité de l'espèce (prédite par homologie)

porcine (based on 100% sequence homology), equine (based on 100% sequence homology), chimpanzee (based on 100% sequence homology), rat (based on 100% sequence homology), rabbit (based on 100% sequence homology)

Fabricant/nom de marque

ChIPAb+
Upstate®

Technique(s)

ChIP: suitable
dot blot: suitable
western blot: suitable

Numéro d'accès NCBI

Numéro d'accès UniProt

Conditions d'expédition

dry ice

Informations sur le gène

human ... KDM2B(84678)

Description générale

Protéines JHDM1B (protéine de déméthylation des histones à domaine Jumonji 1B) et KDM2B. En raison de la présence d'un motif de type "boîte F", cette protéine est également désignée par l'abréviation FBXL10 ("F-box/LRR-repeat protein 10", protéine à répétitions de type boîte F/riches en leucine 10). Elle fonctionne comme une histone déméthylase pour la lysine 36 de l'histone H3 et déméthyle de préférence la lysine 3 diméthylée, avec une activité faible ou nulle pour la lysine 36 mono ou triméthylée.
Tous les anticorps ChIPAb+ sont validés individuellement pour la précipitation de la chromatine, sur tous les lots, sans exception. Chaque jeu d'anticorps ChIPAb+ comprend des amorces témoins (testées sur chaque lot par PCR quantitative) vous permettant de valider biologiquement vos résultats d'immunoprécipitation dans un contexte locus-spécifique. Le protocole de PCR quantitative (qPCR) et les séquences des amorces sont fournis, ce qui permet aux chercheurs de valider leur protocole d'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) lorsqu'ils utilisent notre anticorps dans leur contexte chromatinien. Chaque jeu comprend également un anticorps témoin négatif afin de garantir la spécificité de la réaction de ChIP.
Le jeu ChIPAb+ JHDM1B comprend l'anticorps anti-JHDM1B, une IgG de lapin normale et des amorces témoins qui amplifient une région de 110 pb des amorces ChIP, la globine β humaine. La protéine JHDM1B et les témoins négatifs se présentent dans une taille adaptable à une réaction de ChIP ; ils peuvent être utilisés pour valider fonctionnellement la précipitation de la chromatine associée à la protéine JHDM1B.

Immunogène

Peptide linéaire conjugué à l'hémocyanine de patelle (KLH) correspondant à la protéine JHDM1B humaine.

Application

Ce jeu d'anticorps et d'amorces ChIPAb+ JHDM1B, validé pour l'immunoprécipitation de la chromatine, réunit l'anticorps et les amorces de PCR témoins spécifiques.
Domaine de recherche
Épigénétique et fonction nucléaire
Immunoprécipitation de la chromatine :
Données d'un lot représentatif.
De la chromatine traitée aux ultrasons préparée à partir de cellules HeLa (1 × 10E6 équivalents-cellules par immunoprécipitation) a été soumise à une immunoprécipitation de la chromatine avec 2 µl d'IgG de lapin normale ou d'anticorps anti-JHDM1B et le kit Magna ChIP A (réf. 17-610). Le succès de l'immunoprécipitation des fragments d'ADN associés à la protéine JHDM1B a été contrôlé par qPCR avec des amorces ChIP, la globine β humaine, comme région positive, et des amorces ciblant le promoteur du gène de la β-actine comme région négative (figure 2). Les données sont exprimées en pourcentage de chaque échantillon immunoprécipité par rapport à la chromatine de départ ("input") pour chacun des amplicons et des échantillons de ChIP indiqués.
Se référer au protocole du kit EZ-Magna ChIP A (réf. 17-408) ou du kit EZ-ChIP (réf. 17-371) pour une description détaillée du protocole expérimental.
Analyse par western blotting :
Données d'un lot représentatif.
Un extrait nucléaire de cellules HeLa a été immunoprécipité avec l'anticorps anti-JHDM1B (1 µg/ml). Les protéines ont été visualisées à l'aide d'un anticorps secondaire d'âne anti-IgG de lapin conjugué à la peroxydase de raifort et d'un système de détection par chimioluminescence.
La flèche montre la protéine JHDM1B (~165 kDa) (figure 3). Une bande non caractérisée apparaît à ~109 kDa avec certains lysats.
Analyse par immunocytochimie :
Données d'un lot représentatif.
Analyse par microscopie confocale à fluorescence de cellules NIH/3T3 et HeLa avec l'anticorps anti-JHDM1B (rouge). Les filaments d'actine ont été marqués à la phalloïdine couplée au fluorochrome Alexa Fluor 488 (vert). Les noyaux sont colorés en bleu au diamidinophénylindole (DAPI). Cet anticorps colore positivement les noyaux (figure 4).
Sous-domaine de recherche
Histones

Conditionnement

25 expériences par jeu. Utilisation recommandée : 1,4 μg (2 μl) d'anticorps par immunoprécipitation de la chromatine (selon le contexte biologique).

Qualité

Immunoprécipitation de la chromatine :
Données d'un lot représentatif.
De la chromatine traitée aux ultrasons préparée à partir de cellules HeLa (1 × 10E6 équivalents-cellules par immunoprécipitation) a été soumise à une immunoprécipitation de la chromatine avec 2 µl d'IgG de lapin normale ou d'anticorps anti-JHDM1B et le kit Magna ChIP® A (réf. 17-610). Le succès de l'immunoprécipitation des fragments d'ADN associés à la protéine JHDM1B a été contrôlé par qPCR avec des amorces ChIP, la globine β humaine (figure 1).
Se référer au protocole du kit EZ-Magna ChIP A (réf. 17-408) ou du kit EZ-ChIP (réf. 17-371) pour une description détaillée du protocole expérimental.

Description de la cible

Poids réel : ~165 kDa. Une bande de faible poids moléculaire non caractérisée peut apparaître avec certains lysats.

Forme physique

Anticorps purifié par affinité
Constituants :
Anticorps anti-JHDM1B (anticorps polyclonal de lapin). Un flacon contenant 50 µl d'anticorps polyclonal de lapin purifié dans un tampon contenant de la Tris-glycine 0,1 M (pH 7,4) et du NaCl 150 mM avec 0,05 % d'azoture de sodium, avant l'ajout de glycérol jusqu'à une concentration de 30 %. À conserver à -20 °C.
Concentration : 0,7 mg/ml
IgG de lapin normale. Un flacon contenant 125 µg d'IgG de lapin dans 125 µl de tampon de conservation contenant 0,05 % d'azoture de sodium. À conserver à -20 °C.
Amorces ChIP, globine β humaine. Un flacon contenant 75 μl de chaque amorce (5 μM) spécifique du promoteur du gène de la globine β humaine. À conserver à -20 °C.
Amorce sens : AGG ACA GGT ACG GCT GTC ATC
Amorce antisens : TTT ATG CCC AGC CCT GGC TC

Stockage et stabilité

Stable à -20 °C pendant 1 an à compter de la date de réception. Recommandations relatives à la manipulation du produit : Après la première décongélation, et avant de retirer le bouchon, centrifuger le flacon et mélanger délicatement la solution. Répartir en aliquotes dans des microtubes à centrifuger et conserver ces derniers à -20 °C. Éviter les congélations/décongélations répétées qui peuvent endommager les IgG et altérer les performances du produit.
Remarque : En raison de la variabilité des températures à l'intérieur du congélateur en dessous de -20 °C, les solutions glycérolées risquent de congeler pendant le stockage.

Remarque sur l'analyse

Témoin
Comprend une IgG de lapin normale et des amorces spécifiques de la globine β humaine.

Autres remarques

Concentration : voir le certificat d'analyse du lot concerné.

Informations légales

MAGNA CHIP is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Clause de non-responsabilité

Sauf indication contraire dans notre catalogue ou toute autre documentation associée au(x) produit(s), nos produits sont uniquement destinés à la recherche et ne sauraient être utilisés à d'autres fins, ce qui inclut, sans s'y limiter, les utilisations commerciales non autorisées, les utilisations diagnostiques in vitro, les utilisations thérapeutiques ex vivo ou in vivo, ou tout type de consommation ou d'application chez l'être humain ou chez l'animal.

Code de la classe de stockage

12 - Non Combustible Liquids

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable


Certificats d'analyse (COA)

Recherchez un Certificats d'analyse (COA) en saisissant le numéro de lot du produit. Les numéros de lot figurent sur l'étiquette du produit après les mots "Lot" ou "Batch".

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