Accéder au contenu
Merck

Suppression of problematic compound oligomerization by cosolubilization of nondetergent sulfobetaines.

ChemMedChem (2015-03-12)
Yumiko Mizukoshi, Koh Takeuchi, Misa Arutaki, Takeshi Takizawa, Hiroyuki Hanzawa, Hideo Takahashi, Ichio Shimada
RÉSUMÉ

Numerous small organic compounds exist in equilibrium among monomers, soluble oligomers, and insoluble aggregates in aqueous solution. Compound aggregation is a major reason for false positives in drug screening, and even soluble oligomers can interfere with structural and biochemical analyses. However, an efficient way to manage the equilibrium of aggregation-prone compounds, especially those involved with soluble oligomers, has not been established. In this study, solution NMR spectroscopy was used as a suitable technique to detect compound oligomers in equilibrium, and it was demonstrated that cosolubilization of nondetergent sulfobetaines (NDSBs) can largely suppress compound oligomerization and aggregation by shifting the equilibrium toward the monomers. The rotational correlation time was obtained from the ratio of the selective and nonselective longitudinal NMR relaxation times, which directly and quantitatively reflected the apparent sizes of the compounds in the equilibrium. The rotational correlation time of the aggregation-prone compound SKF86002 (1 mM) was substantially reduced from 0.31 to 0.23 ns by cosolubilization of 100 mM NDSB195. NDSB cosolubilization allowed us to perform successful structural and biochemical experiments with substantially fewer artifacts, which represents a strategy to directly resolve the problematic oligomerization and aggregation of compounds.

MATÉRIAUX
Référence du produit
Marque
Description du produit

Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, Hybri-Max, sterile-filtered, BioReagent, suitable for hybridoma, ≥99.7%
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, ACS reagent, ≥99.9%
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Oxyde de deutérium, 99.9 atom % D
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, suitable for HPLC, ≥99.7%
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, sterile-filtered, BioPerformance Certified, meets EP, USP testing specifications, suitable for hybridoma
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, ReagentPlus®, ≥99.5%
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, ≥99.5% (GC), suitable for plant cell culture
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
DL-Dithiothréitol solution, BioUltra, ~1 M in H2O
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Supelco
DL-Dithiothréitol solution, 1 M in H2O
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium solution, 0.9% in water, BioXtra, suitable for cell culture
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99%
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium solution, 5 M in H2O, BioReagent, suitable for cell culture
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Oxyde de deutérium, 99.9 atom % D, contains 0.05 wt. % 3-(trimethylsilyl)propionic-2,2,3,3-d4 acid, sodium salt
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Nω-Nitro-L-arginine methyl ester hydrochloride, ≥97% (TLC), powder
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
SAFC
Chlorure de sodium solution, 5 M
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
N-Succinyl-Ala-Ala-Pro-Phe p-nitroanilide
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
L-Arginine monohydrochloride, not synthetic, meets EP, JP, USP testing specifications, suitable for cell culture, 98.5-101.0%
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, BioUltra, ≥99.5% (GC)
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium solution, BioUltra, ~5 M in H2O
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
L-Arginine monohydrochloride, BioUltra, ≥99.5% (AT)
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium, 99.999% trace metals basis
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium, BioUltra, ≥99.5% (AT)
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, PCR Reagent
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Oxyde de deutérium, 99.9 atom % D, contains 0.75 wt. % 3-(trimethylsilyl)propionic-2,2,3,3-d4 acid, sodium salt
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
SAFC
L-Arginine monohydrochloride
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Clotrimazole
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Oxyde de deutérium, filtered, 99.8 atom % D
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.
Sigma-Aldrich
Diméthylsulfoxyde, anhydrous, ≥99.9%
Le tarif et la disponibilité ne sont pas disponibles actuellement.