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Fusion of dioxygenase and lignin-binding domains in a novel secreted enzyme from cellulolytic Streptomyces sp. SirexAA-E.

The Journal of biological chemistry (2013-05-09)
Christopher M Bianchetti, Connor H Harmann, Taichi E Takasuka, Gregory L Hura, Kevin Dyer, Brian G Fox
RÉSUMÉ

Streptomyces sp. SirexAA-E is a highly cellulolytic bacterium isolated from an insect/microbe symbiotic community. When grown on lignin-containing biomass, it secretes SACTE_2871, an aromatic ring dioxygenase domain fused to a family 5/12 carbohydrate-binding module (CBM 5/12). Here we present structural and catalytic studies of this novel fusion enzyme, thus providing insight into its function. The dioxygenase domain has the core β-sandwich fold typical of this enzyme family but lacks a dimerization domain observed in other intradiol dioxygenases. Consequently, the x-ray structure shows that the enzyme is monomeric and the Fe(III)-containing active site is exposed to solvent in a shallow depression on a planar surface. Purified SACTE_2871 catalyzes the O2-dependent intradiol cleavage of catechyl compounds from lignin biosynthetic pathways, but not their methylated derivatives. Binding studies show that SACTE_2871 binds synthetic lignin polymers and chitin through the interactions of the CBM 5/12 domain, representing a new binding specificity for this fold-family. Based on its unique structural features and functional properties, we propose that SACTE_2871 contributes to the invasive nature of the insect/microbial community by destroying precursors needed by the plant for de novo lignin biosynthesis as part of its natural wounding response.

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Description du produit

Sigma-Aldrich
Cellulose, microcrystalline, powder, 20 μm
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Sigma-Aldrich
Cellulose, microcrystalline, powder
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Sigma-Aldrich
Cellulose, fibers, (medium)
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Sigma-Aldrich
Chitin from shrimp shells, practical grade, powder
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Sigma-Aldrich
Cellulose, Type 20, 20 μm
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Sigma-Aldrich
α-Cellulose, powder
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Sigma-Aldrich
Cellulose, colloidal, microcrystalline
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Sigma-Aldrich
Chitin from shrimp shells, BioReagent, suitable for analysis of chitinase, purified powder
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Sigma-Aldrich
Cellulose, Type 101, Highly purified, fibers
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Sigma-Aldrich
Cellulose, Type 50, 50 μm
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Sigma-Aldrich
α-Cellulose, BioReagent, suitable for insect cell culture
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Sigma-Aldrich
1,2-Dihydroxybenzene, ReagentPlus®, ≥99%
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Sigma-Aldrich
Pyrocatechol, ≥99%
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Supelco
Cellulose, ~50 μm particle size
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Sigma-Aldrich
Cellulose, tested according to Ph. Eur.
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Supelco
Cellulose, powder, for column chromatography
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Supelco
Cellulose, DS-0, powder, suitable for thin layer chromatography (TLC)
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Sigma-Aldrich
Pyrocatechol, purified by sublimation, ≥99.5%
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Supelco
Cellulose, acid washed, powder, for column chromatography
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Supelco
Cellulose, DFS-0, microcrystalline, suitable for thin layer chromatography (TLC)
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Supelco
Cellulose, acid washed, from spruce, for column chromatography
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