Tris
Le Tris, aussi appelé THAM (tris(hydroxyméthyl)aminométhane), est une poudre cristalline de couleur blanche. Le tampon Tris a un pKa d'environ 8,1 à 25 °C, ce qui en fait un bon choix pour la plupart des processus biologiques dans la gamme de pH de 7 à 9. Comparé à d'autres tampons spéciaux comme l'HEPES, le Tris en poudre est une option rentable et plus robuste.
Les solutions de tampon Tris sont préparées en dissolvant de la base Tris dans de l'eau, puis en ajustant le pH avec un acide, typiquement de l'acide chlorhydrique ou de l'acide sulfurique. La solution ainsi obtenue constitue un régulateur de pH et un stabilisant extrêmement fiables pour divers types d'expériences, notamment en biochimie des protéines, en biologie moléculaire ou en enzymologie, ainsi que dans certaines techniques comme l'électrophorèse, les dosages immuno-enzymatiques (ELISA) et les procédés chromatographiques. En culture cellulaire, le tampon Tris aide aussi à maintenir l'environnement de pH optimal, essentiel à la croissance et à la prolifération des cellules, ainsi que les conditions physiologiques des milieux de culture cellulaire.
Le tampon Tris est disponible sous différentes formes, notamment en solutions toutes prêtes ou en poudre, pour faciliter son utilisation au laboratoire.
Tris-HCl
Le Tris-HCl ou chlorhydrate de Tris (aussi dénommé Trizma-HCl) est un agent de tamponnage (tampon acide) couramment utilisé en biologie moléculaire et en biochimie pour ajuster le pH des solutions ou stabiliser le pH. Similaire à la base Tris, le Tris-HCl est aussi une poudre cristalline blanche, de formule moléculaire C4H12ClNO3, et d'un poids moléculaire de 157,60, légèrement supérieur. La principale différence entre les deux consiste en l'ajout d'acide chlorhydrique à la base Tris, pour donner du Tris-HCl. Tandis que la base Tris à un pKa d'environ 8,1, ce qui lui permet de servir de tampon dans la plage de pH de 7-9, le Tris-HCl contient, lui, de l'acide chlorhydrique. Cet ajout abaisse le pH et permet au Tris-HCl de tamponner les solutions dans la plage de pH de 7,0-8,6.
La base Tris est un tampon polyvalent sur une large gamme de pH, alors que le Tris-HCl donne une plage de pH plus spécifique en raison de la présence d'acide chlorhydrique. Le choix entre Tris et Tris-HCl dépend de la plage de pH recherchée et des besoins expérimentaux ou des exigences spécifiques de l'application.
Solution saline tamponnée au Tris (TBS)
La solution saline tamponnée au Tris (TBS) est un tampon couramment employé dans les applications biologiques et biochimiques. Elle contient typiquement du tris(hydroxyméthyl)aminométhane, abrégé en Tris, un agent tamponnant qui maintient un pH constant, et du chlorure de sodium, qui apporte la force ionique nécessaire. Le TBS a un pH relativement neutre (autour de 7,4) et est largement utilisé dans les applications comme le western blotting, l'immunohistochimie et les essais ELISA. Il sert aussi de tampon de lavage pour retirer des échantillons les anticorps non fixés ou d'autres réactifs. La concentration du Tris et du chlorure de sodium peut varier en fonction de l'application envisagée, mais la formulation du tampon contient souvent du Tris 50 mM et du chlorure de sodium 150 mM.
Tris-acétate-EDTA (TAE)
Le tampon TAE est un autre tampon couramment utilisé en biologie moléculaire, en électrophorèse et pour les northern et Southern blottings. Dans ce tampon, le Tris sert d'agent tamponnant, l'acide acétique contribue au pouvoir tampon et l'EDTA (acide éthylènediaminetétraacétique) agit comme un agent chélatant. Le TAE est souvent employé comme tampon de charge en électrophorèse sur gel d'agarose, dans l'analyse des fragments d'ADN, en électrophorèse sur gel en champ pulsé (pour déterminer la taille des fragments d'ADN), dans l'électrophorèse de l'ARN, et dans les transferts d'acides nucléiques.
Tris-borate-EDTA (TBE)
Le tampon TBE est largement utilisé pour séparer et analyser les fragments d'ADN, en particulier lorsqu'il est nécessaire d'atteindre une grande résolution lors de la séparation de petits fragments d'ADN. Dans ce tampon, l'acide borique joue un rôle important dans le maintien du pouvoir tampon de la solution. Le tampon TBE est employé dans diverses techniques, notamment l'électrophorèse sur gel d'agarose, le séquençage de l'ADN, l'analyse de produits par amplification en chaîne par polymérase (PCR), l'analyse d'oligonucléotides, l'électrophorèse sur gel dénaturant et l'électrophorèse sur gel natif.
Tampon Tris-glycine
Le tampon Tris-glycine est un système tampon couramment utilisé en biologie moléculaire, en particulier dans l'électrophorèse des protéines. Dans ce tampon, la glycine contribue grandement au pouvoir tampon de la solution et aide à atteindre le niveau de pH souhaité. Le pH du tampon peut être ajusté par ajout de HCl. Le tampon Tris-glycine sert à remettre en suspension les échantillons de protéines, à diluer les extraits protéiques en vue d'une analyse ou d'un stockage ultérieur, et est particulièrement utile dans les techniques d'électrophorèse des protéines en conditions non dénaturantes où il est crucial de maintenir la conformation native des protéines. Il sert aussi employé en focalisation isoélectrique et fonctionne comme un agent tamponnant pour diverses expériences sur les protéines.
Tris-glycine-dodécylsulfate de sodium (SDS)
Le tampon Tris-glycine-SDS sert de tampon de migration standard en SDS-PAGE, une technique permettant de séparer et d'analyser les protéines en fonction de leur poids moléculaire. Ce tampon est employé dans la quantification et la dénaturation des protéines, en western blotting, et durant les procédures de préparation des échantillons en vue d'une analyse en aval ultérieure.
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