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Merck

G211150

Sigma-Aldrich

DMT-2′O-Methyl-rG(ib) Phosphoramidite

configured for (ÄKTA® and OligoPilot®)

Sinónimos:

DMT-2′-O-Me-rG(ib) amidite, N-(2-methyl-1-oxopropyl)-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-O-methyl-guanosine, 3′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidite]

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About This Item

Fórmula empírica (notación de Hill):
C45H56N7O9P
Número de CAS:
Peso molecular:
869.94
Número MDL:
Código UNSPSC:
41116105
ID de la sustancia en PubChem:
NACRES:
NA.51

origen biológico

non-animal source (no BSE/TSE risk)

Línea del producto

Proligo Reagents

Análisis

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

formulario

powder

técnicas

oligo synthesis: suitable

impurezas

≤0.1% single unspecified Impurity (reversed phase HPLC)
≤0.3% mG2 (reversed phase HPLC, Hydrolysate)
≤0.3% mG3 (reversed phase HPLC, DMT-rG(ib)me)
≤0.3% water content (Karl Fischer)
≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (31P-NMR)
≤1.0% mG1 (reversed phase HPLC, DMT-rG(ib)me-DMT)
≤3% residual Solvent content

color

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

idoneidad

conforms to structure for H-NMR
conforms to structure for LC-MS

compatibilidad

configured for (ÄKTA® and OligoPilot®)

perfil del nucleósido

base: guanosine
base protecting group: isobutyryl
2' protecting group: methyl
5' protecting group: DMT
deprotection: standard

temp. de almacenamiento

2-8°C

cadena SMILES

CO[C@@H]1[C@H](OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)[C@@H](COC(c2ccccc2)(c3ccc(OC)cc3)c4ccc(OC)cc4)O[C@H]1n5cnc6C(=O)NC(NC(=O)C(C)C)=Nc56

InChI

1S/C45H56N7O9P/c1-28(2)41(53)49-44-48-40-37(42(54)50-44)47-27-51(40)43-39(57-9)38(61-62(59-25-13-24-46)52(29(3)4)30(5)6)36(60-43)26-58-45(31-14-11-10-12-15-31,32-16-20-34(55-7)21-17-32)33-18-22-35(56-8)23-19-33/h10-12,14-23,27-30,36,38-39,43H,13,25-26H2,1-9H3,(H2,48,49,50,53,54)/t36-,38-,39-,43-,62?/m1/s1

Clave InChI

IRRDHRZUOZNWDJ-MLLDKZSOSA-N

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Descripción general

Proligo′s 2′O-Methyl RNA monomers are compatible with fast deprotectionschemes that are based on the application of aliphatic amines, such asmethylamine. The adenosine and guanosine monomers are protected bythe standard benzoyl (bz) and isobutyryl (ib) groups.2′O-Methyl RNA is a nucleic acid analog that is characterized by theexceptional hybridization properties that it imparts with complimentaryDNA or RNA, as well as increased stability against enzymatic degradationcompared to natural nucleic acids.The unique combination of properties of 2′O-Methyl RNA had foundwidespread use in the fields of:
  • Diagnostic probes
  • Aptamer and ribozyme development
  • Mixed 2′O-Methyl-RNA/DNA antisense molecules
Key Features:
  • High yield of crude oligonucleotides
  • Compatible with DNA synthesis
  • Can be employed together with DNA or RNA phosphoramidites in thesame synthesis to produce mixmer oligonucleotides
  • Recommended deprotection conditions are 8 hours at 55 °C usingconcentrated ammonia solution, or with AMA (concentrated ammonia/40% aqueous methylamine I/I, v/v) for 10 minutes at 65 °C
  • Purification and other downstream processing of fully modified 2′OMethyl RNA oligonucleotides are simpler than in the case of RNA, as nospecial precautions are required to provide protection against nucleolyticdegradationDMT-2′O-Methyl-rG(ib)
Phosphoramidite is configured for ÄKTA® Synthesizers.

Información legal

OligoPilot is a registered trademark of Cytiva
ÄKTA is a registered trademark of Cytiva

Código de clase de almacenamiento

11 - Combustible Solids

Clase de riesgo para el agua (WGK)

WGK 3

Punto de inflamabilidad (°F)

Not applicable

Punto de inflamabilidad (°C)

Not applicable


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