Data is not available to indicate whether DNA contamination could affect sequencing. However, including DNase treatment is recommended to minimize genomic DNA in the sequencing reads.
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| À vous/Référence | Disponibilité | Prix |
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A propos de cet article
usage
sufficient for 250 purifications
Quality Segment
greener alternative product characteristics
Designing Safer Chemicals
Learn more about the Principles of Green Chemistry.
sustainability
Greener Alternative Product
technique(s)
RNA purification: suitable
test parameters
: ~30 min kit run time, sample volume: 100 mg
greener alternative category
storage temp.
15-25°C
General description
Une fois les tissus broyés en poudre fine dans de l'azote liquide, les cellules sont lysées et les débris cellulaires sont séparés physiquement et chimiquement de l'ARN endogène. L'ARN est ensuite hybridé à un substrat de silice placé dans une colonne, et plusieurs étapes de lavage éliminent les contaminants résiduels.
L'ARN total élué de la colonne est généralement utilisé dans des analyses par northern blot, RT-PCR ou qRT-PCR.
Application
- pour extraire l'ARN contenu dans du matériel végétal broyé dans de l'azote liquide
- pour isoler l'ARN total de plantules sauvages (wt) et mutantes
- pour extraire l'ARN total d'échantillons de feuilles
- pour extraire l'ARN contenu dans n'importe quel tissu végétal
Features and Benefits
- Haut rendement : jusqu'à 60 μg d'ARN pur concentré par préparation
- Efficacité : ARN purifié en 30 minutes maximum
- Innovation : kit spécialement conçu pour la recherche sur les tissus végétaux difficiles
Legal Information
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Cet article | |||
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| description sufficient for 250 purifications | description sufficient for 50 purifications | description sufficient for 10 purifications | description sufficient for 350 purifications |
| usage sufficient for 250 purifications | usage sufficient for 50 purifications | usage sufficient for 10 purifications | usage sufficient for 350 purifications |
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| test parameters : ~30 min kit run time, sample volume: 100 mg | test parameters : ~30 min kit run time, sample volume: 100 mg | test parameters : ~30 min kit run time, sample volume: 100 mg | test parameters : <30 min kit run time, sample volume: up to 10^7 cells or 40 mg of tissue |
| storage temp. 15-25°C | storage temp. 15-25°C | storage temp. 15-25°C | storage temp. 15-25°C |
| sustainability Greener Alternative Product | sustainability Greener Alternative Product | sustainability Greener Alternative Product | sustainability Greener Alternative Product |
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Composants de kit seuls
- Binding Solution
- Lysis Solution
- Wash Solution 1
Composants de kit également disponibles séparément
- 2-Mercaptoethanol, Molecular Biology, suitable for electrophoresis, suitable for cell culture, BioReagent, 99% (GC/titration) 2
signalword
Danger
Hazard Classifications
Acute Tox. 2 Dermal - Acute Tox. 3 Inhalation - Acute Tox. 3 Oral - Aquatic Acute 1 - Aquatic Chronic 2 - Eye Dam. 1 - Repr. 2 - Skin Irrit. 2 - Skin Sens. 1 - STOT RE 2 Oral
target_organs
Liver,Heart
Classe de stockage
6.1A - Combustible acute toxic Cat. 1 and 2 / very toxic hazardous materials
wgk
WGK 3
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I’m using your plant RNA extraction kit for RNA-seq. If I skip the DNase treatment, could DNA contamination affect the sequencing library, or is it mandatory to include this step? Thank you.
1 answer-
Helpful?
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does it sufficient for small RNA and/or non-coding RNA extraction?
1 answer-
Yes, this kit is sufficient for small RNA. However, It is worth noting that small RNA molecules, such as microRNA, siRNA, tRNA, 5S rRNA, are not efficiently recovered using the standard procedure. If desired, these small RNA molecules can be recovered by increasing the amount of binding solution, as described in Protocol A under Procedure Step 4.
For more information, please see the protocol associated with this product:
https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/product/documents/323/177/strn250bul.pdfHelpful?
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