ABE1889
Anticorps anti-ZMYND11
serum, from rabbit
Synonyme(s) :
Zinc finger MYND domain-containing protein 11
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A propos de cet article
UNSPSC Code:
12352203
NACRES:
NA.41
eCl@ss:
32160702
Conjugate:
unconjugated
Clone:
polyclonal
Application:
ChIP, WB
Citations:
-
Service technique
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rabbit
Quality Segment
conjugate
unconjugated
antibody form
serum
antibody product type
primary antibodies
clone
polyclonal
species reactivity
human
species reactivity (predicted by homology)
mouse (based on 100% sequence homology)
technique(s)
ChIP: suitable (ChIP-seq), western blot: suitable
NCBI accession no.
UniProt accession no.
shipped in
dry ice
target post-translational modification
unmodified
Gene Information
mouse ... Zmynd11(66505)
General description
La protéine 11 contenant un domaine MYND en doigt de zinc ("zinc finger MYND domain-containing protein 11", UniProt Q8R5C8) est codée par le gène Zmynd11 (identifiant du gène : 66505) chez les espèces murines. ZMYND11/BS69 fonctionne comme un corépresseur des protéines E1A et de facteurs de transcription cellulaire, notamment les oncoprotéines c-Myb et ETS-2. ZMYND11 contient plusieurs motifs de lecture d'histone, notamment un domaine PHD ("plant homeodomain"), un bromodomaine, et un domaine PWWP. L'histone H3 triméthylée au niveau de Lys36 (H3K36me3) est déposée sur les nucléosomes dans les régions transcrites après élongation par l'ARN polymérase II, et ZMYND11 reconnaît spécifiquement H3K36me3 et régule l'élongation par l'ARN polymérase II. Une étude de liaison a montré que le module combiné PHD-bromo-PWWP (PBP) médie la reconnaissance par ZMYND11 de H3K36me3, et le domaine PWWP, pris isolément, n'a que peu d'affinité voire aucune pour H3K36 sans méthylation, H3K36me, ou H3K36me2. ZMYND11 est un suppresseur de tumeur qui agit comme un corépresseur de transcription non conventionnel en modulant l'ARN polymérase II lors de l'étape d'élongation. De faibles taux d'expression de ZMYND11 chez les patients atteints de cancer du sein sont corrélés à un pronostic défavorable. À l'inverse, la surexpression de ZMYND11 stoppe la croissance des cellules cancéreuses in vitro et la formation de tumeurs in vivo chez la souris.
~70 kDa (poids observé). 70,96 kDa (isoforme 1), 64,43 kDa (isoforme 2), 66,59 kDa (isoforme 3), 60,05 kDa (isoforme 4), 60,87 kDa (isoforme 5) et 66,52 kDa (isoforme 6) (poids déterminés par calcul).
Immunogen
Fragment C-terminal de ZMYND11 de souris recombinant avec étiquette His.
Épitope : Région C-terminale.
Application
Analyse par western blotting : Une dilution au 1/1000e d'un lot représentatif a permis de détecter un niveau de ZMYND11 régulé à la baisse dans des extraits nucléaires de cellules U2OS d'ostéosarcome humain après traitement par un shARN réduisant l'expression de ZMYND11 (avec la permission du Dr Hong Wen, UT M.D. Anderson Cancer Center, TX).
Analyse par immunoprécipitation de la chromatine : Un lot représentatif a permis de détecter par ChIP l'occupation du gène c-Myc par ZMYND11 dans des extraits nucléaires de cellules U2OS d'ostéosarcome humain. Un traitement à l'aide d'un shARN réduisant l'expression de ZMYND11 a permis de considérablement réduire les fragments du gène c-Myc dans une étude de ChIP (avec la permission du Dr Hong Wen, UT M.D. Anderson Cancer Center, TX).
Analyse par immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) : Un lot représentatif a permis de détecter par ChIP l'occupation de la chromatine par ZMYND11 en utilisant des préparations de chromatine provenant de cellules U2OS d'ostéosarcome humain. L'abaissement du niveau de H3K36me3 par inactivation de SETD2 a réduit l'association aux gènes ciblés par ZMYND11 (Wen, H., et al. (2014). Nature. 508(7495):263-268).
Analyse par ChIP-seq : Un lot représentatif a permis de détecter les sites de la chromatine ciblés par ZMYND11 à l'aide d'une analyse par ChIP-seq sur l'ensemble du génome en utilisant des préparations de chromatine provenant de cellules U2OS d'ostéosarcome humain. Les sites occupés par ZMYND11 sont extrêmement riches en introns et en exons, mais pas en promoteurs des gènes ciblés (Wen, H., et al. (2014). Nature. 508(7495):263-268).
Analyse par western blotting : Un lot représentatif a permis de détecter la protéine BS69 humaine exprimée de façon exogène dans une levure et des fibroblastes QT-6 de caille (Ladendorff, N.E., et al. (2001). Oncogene. 20(1):125-132).
Analyse par immunoprécipitation de la chromatine : Un lot représentatif a permis de détecter par ChIP l'occupation du gène c-Myc par ZMYND11 dans des extraits nucléaires de cellules U2OS d'ostéosarcome humain. Un traitement à l'aide d'un shARN réduisant l'expression de ZMYND11 a permis de considérablement réduire les fragments du gène c-Myc dans une étude de ChIP (avec la permission du Dr Hong Wen, UT M.D. Anderson Cancer Center, TX).
Analyse par immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) : Un lot représentatif a permis de détecter par ChIP l'occupation de la chromatine par ZMYND11 en utilisant des préparations de chromatine provenant de cellules U2OS d'ostéosarcome humain. L'abaissement du niveau de H3K36me3 par inactivation de SETD2 a réduit l'association aux gènes ciblés par ZMYND11 (Wen, H., et al. (2014). Nature. 508(7495):263-268).
Analyse par ChIP-seq : Un lot représentatif a permis de détecter les sites de la chromatine ciblés par ZMYND11 à l'aide d'une analyse par ChIP-seq sur l'ensemble du génome en utilisant des préparations de chromatine provenant de cellules U2OS d'ostéosarcome humain. Les sites occupés par ZMYND11 sont extrêmement riches en introns et en exons, mais pas en promoteurs des gènes ciblés (Wen, H., et al. (2014). Nature. 508(7495):263-268).
Analyse par western blotting : Un lot représentatif a permis de détecter la protéine BS69 humaine exprimée de façon exogène dans une levure et des fibroblastes QT-6 de caille (Ladendorff, N.E., et al. (2001). Oncogene. 20(1):125-132).
Domaine de recherche
Épigénétique et fonction nucléaire
Épigénétique et fonction nucléaire
Détectez ZMYND11 à l'aide de cet anticorps anti-ZMYND11 dont l'utilisation a été validée en western blotting, immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), et ChIP-seq.
Sous-domaine de recherche
Biologie de la chromatine
Biologie de la chromatine
Biochem/physiol Actions
Cet antisérum a permis de détecter deux bandes immunoréactives dans l'analyse par western blot d'un extrait nucléaire de cellules U2OS. Un traitement à l'aide d'un shARN inactivant ZMYND11 a permis de supprimer spécifiquement la bande de ~70 kDa, mais pas celle de ~60 kDa. La détection de la bande non-ZMYND11 par western blotting n'affecte pas les performances de l'antisérum dans les applications d'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP). L'inactivation de ZMYND11 à l'aide d'un traitement par shARN avant de procéder à une ChIP avec cet antisérum a permis de supprimer les fragments d'ADN présents dans les immunoprécipitats issus des cellules non traitées par shARN. En outre, le profil obtenu en ChIP avec cet antisérum ressemble étroitement à celui obtenu avec un anticorps anti-FLAG et des cellules exprimant la protéine ZMYND11 portant une étiquette FLAG.
Physical form
Produit non purifié
Sérum polyclonal de lapin contenant 0,05 % d'azoture de sodium.
Preparation Note
Stable pendant 1 an à -20 °C à partir de la date de réception.
Recommandations d'utilisation : Dès réception, et avant retrait du bouchon, centrifuger le flacon et mélanger délicatement la solution. Diviser en aliquotes dans des microtubes à centrifuger et les stocker à -20 °C. Éviter les congélations/décongélations répétées, qui peuvent détériorer les IgG et nuire aux performances du produit.
Recommandations d'utilisation : Dès réception, et avant retrait du bouchon, centrifuger le flacon et mélanger délicatement la solution. Diviser en aliquotes dans des microtubes à centrifuger et les stocker à -20 °C. Éviter les congélations/décongélations répétées, qui peuvent détériorer les IgG et nuire aux performances du produit.
Analysis Note
Produit évalué par western blotting sur un extrait nucléaire de cellules U2OS.
Analyse par western blotting : Une dilution au 1/500e de cet anticorps a permis de détecter ZMYND11 dans 20 µg d'extrait nucléaire de cellules U2OS.
Analyse par western blotting : Une dilution au 1/500e de cet anticorps a permis de détecter ZMYND11 dans 20 µg d'extrait nucléaire de cellules U2OS.
Other Notes
Concentration : Voir la fiche technique correspondant spécifiquement au lot utilisé.
Disclaimer
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