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07-354

Sigma-Aldrich

Anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18)

serum, Upstate®

Synonyme(s) :

H3K18Ac, Histone H3 (acetyl K18)

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About This Item

Code UNSPSC :
12352203
eCl@ss :
32160702
Nomenclature NACRES :
NA.41

Source biologique

rabbit

Niveau de qualité

Forme d'anticorps

serum

Type de produit anticorps

primary antibodies

Clone

polyclonal

Espèces réactives

yeast, Saccharomyces cerevisiae, human

Réactivité de l'espèce (prédite par homologie)

vertebrates (most common)

Fabricant/nom de marque

Upstate®

Technique(s)

ChIP: suitable (ChIP-seq)
dot blot: suitable
western blot: suitable

Numéro d'accès NCBI

Numéro d'accès UniProt

Conditions d'expédition

dry ice

Modification post-traductionnelle de la cible

acetylation (Lys18)

Informations sur le gène

human ... H3C1(8350)

Description générale

L'histone H3 est l'une des 5 principales protéines de type histone impliquées dans la structure de la chromatine dans les cellules eucaryotes. Caractérisée par un domaine principal globulaire et une longue queue N-terminale, l'histone H3 détermine la structure en "collier de perles" des nucléosomes.



L'histone H3 est acétylée au niveau de plusieurs résidus lysine différents de sa queue par une famille d'enzymes connues sous le nom d'histone acétyltransférases (HAT).

Spécificité

Reconnaît l'histone H3 acétylée au niveau du résidu lysine 18.

Immunogène

Peptide de synthèse (GKAPRAcKQLASK-C) conjugué à de la KLH et correspondant aux acides aminés 13 à 23 de l'histone H3 de levure acétylée au niveau du résidu lysine 18, avec ajout d'une cystéine C-terminale à des fins de conjugaison.

Application

Immunoprécipitation de la chromatine :
Données d'un lot représentatif.
De la chromatine préparée à partir de cellules HeLa (1 x 10E6 équivalents cellulaires par IP) et passée aux ultrasons à été soumise à une immunoprécipitation de la chromatine avec soit 2 µl de sérum de lapin normal, soit 2 µl d'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18), et le kit Magna ChIP A (réf. 7-610). Le succès de l'immunoprécipitation de fragments d'ADN associés à l'acétyl-histone H3 (Lys18) a été vérifié par qPCR en utilisant des amorces de contrôle spécifiques de la région promotrice du gène GAPDH comme locus positif, et des amorces de globine β comme locus négatif. Les données sont présentées sous la forme d'un pourcentage d'"input" de chaque échantillon d'IP par rapport à la chromatine "input" pour chaque amplicon et chaque échantillon de ChIP, comme indiqué.
Pour les détails expérimentaux, se référer au protocole du kit EZ-Magna ChIP A (réf. 17-408) ou EZ-ChIP (réf. 17-371).

Séquençage ChIP :
Données d'un lot représentatif. Une immunoprécipitation de la chromatine a été réalisée avec le kit Magna ChIP HiSens (réf. 17-10460), 2 μg d'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (réf. 07-354), 20 µl de billes avec protéine A/G, et la chromatine de 1e6 cellules HeLa réticulée, suivie d'une purification de l'ADN à l'aide de billes magnétiques. Des banques ont été préparées à partir des échantillons d'ADN "input" et ChIP selon des protocoles standard avec des adaptateurs à code-barres Illumina, puis analysées sur un appareil Illumina HiSeq. Plus de dix millions de lectures ("read") tirées de fichiers FastQ ont été alignées ("mapped") avec Bowtie (http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml), après suppression des étiquettes ("tag") avec TagDust (http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource/). Les pics ont été identifiés à l'aide de l'algorithme MACS (http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/), après visualisation des pics et des lectures sous forme de piste personnalisée ("custom track") dans UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu) à partir de fichiers BigWig et BED.

Analyse par western blotting :
Données d'un lot représentatif.
De l'histone H3 recombinante (piste 1, réf. 14-494) et des extraits acides de cellules HeLa (réf. 17-305) traitées au butyrate de sodium (piste 2) et non traitées (piste 3) ont été mis en présence de l'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (dilution au 1/10 000e).
La flèche indique l'acétyl-histone H3 (Lys18) (17 kDa).

Dot blot :
Données d'un lot représentatif.
40 ng et 4 ng de peptides d'histone portant diverses modifications (voir tableau 1) ont été transférés sur une membrane en PVDF et mis en présence de l'anticorps anti-acétyl-histone H3 (Lys18) (dilution au 1/5000e). Les protéines ont été visualisées à l'aide d'une IgG de chèvre anti-lapin conjuguée à de la HRP et d'un système de détection par chimiluminescence. L'image présentée correspond à une exposition de 60 secondes.
Utilisez l'anticorps polyclonal de lapin anti-acétyl-histone H3 (Lys18), validé en ChIP et WB, pour détecter l'acétyl-histone H3 (Lys18), aussi appelée H3K18Ac ou histone H3 (acétyl K18).

Qualité

Produit évalué en routine par immunoblot sur des extraits acides de cellules HeLa traitées au butyrate de sodium

Description de la cible

17 kDa

Liaison

Remplace : 04-1107

Forme physique

100 μl de sérum de lapin contenant 0,05 % d'azoture de sodium et 30 % de glycérol.

Autres remarques

Concentration : La concentration de chaque lot figure sur le certificat d'analyse.

Informations légales

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

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Code de la classe de stockage

12 - Non Combustible Liquids

Classe de danger pour l'eau (WGK)

WGK 1

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable


Certificats d'analyse (COA)

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Inducible activation of Cre recombinase in adult mice causes gastric epithelial atrophy, metaplasia and regenerative changes in the absence of "floxed" alleles.
Huh WJ, Mysorekar IU, Mills JC
American Journal of Physiology: Gastrointestinal and Liver Physiology null
Paola Y Bertucci et al.
Nucleic acids research, 41(12), 6072-6086 (2013-05-04)
Steroid receptors were classically described for regulating transcription by binding to target gene promoters. However, genome-wide studies reveal that steroid receptors-binding sites are mainly located at intragenic regions. To determine the role of these sites, we examined the effect of
Nucleosome competition reveals processive acetylation by the SAGA HAT module.
Ringel, AE; Cieniewicz, AM; Taverna, SD; Wolberger, C
Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA null
Jason S Patzlaff et al.
Experimental cell research, 316(13), 2123-2135 (2010-05-11)
Histone acetylation is a key modification that regulates chromatin accessibility. Here we show that treatment with butyrate or other histone deacetylase (HDAC) inhibitors does not induce histone hyperacetylation in metaphase-arrested HeLa cells. When compared to similarly treated interphase cells, acetylation
H2B- and H3-specific histone deacetylases are required for DNA methylation in Neurospora crassa.
Smith, KM; Dobosy, JR; Reifsnyder, JE; Rountree, MR; Anderson, DC; Green, GR; Selker, EU
Genetics null

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