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A211000

Sigma-Aldrich

DMT-2′O-TBDMS-rA(bz) Phosphoramidite

Synonyme(s) :

DMT-2’O-TBDMS-rA(bz) Amidite, N-benzoyl-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-adenosine, 3′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidite]

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About This Item

Formule empirique (notation de Hill):
C53H66N7O8PSi
Numéro CAS:
Poids moléculaire :
988.19
Numéro MDL:
Code UNSPSC :
12352200
ID de substance PubChem :
Nomenclature NACRES :
NA.51

Source biologique

non-animal source (no BSE/TSE risk)

Niveau de qualité

Gamme de produits

Proligo Reagents

Pureté

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

Forme

powder

Technique(s)

oligo synthesis: suitable

Impuretés

≤0.3 wt. % water content (Karl Fischer)
≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (31P-NMR)
≤0.5% single Impurity (reversed phase HPLC)
≤3 wt. % residual Solvent content

Couleur

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

Adéquation

conforms to structure for H-NMR
conforms to structure for LC-MS

Profil des nucléosides

base: adenosine
base protecting group: benzoyl
2' protecting group: TBDMS
5' protecting group: DMT
deprotection: standard

Température de stockage

−20°C

Chaîne SMILES 

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O[Si](C)(C)C(C)(C)C)[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)n3cnc4c(NC(=O)c5ccccc5)ncnc34)(c6ccccc6)c7ccc(OC)cc7

InChI

1S/C53H66N7O8PSi/c1-36(2)60(37(3)4)69(65-32-18-31-54)67-46-44(33-64-53(39-21-16-13-17-22-39,40-23-27-42(62-8)28-24-40)41-25-29-43(63-9)30-26-41)66-51(47(46)68-70(10,11)52(5,6)7)59-35-57-45-48(55-34-56-49(45)59)58-50(61)38-19-14-12-15-20-38/h12-17,19-30,34-37,44,46-47,51H,18,32-33H2,1-11H3,(H,55,56,58,61)/t44-,46-,47-,51-,69?/m1/s1

Clé InChI

FFXHNCNNHASXCT-RFMFGJHUSA-N

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Description générale

DMT-2′O-TBDMS-rA(bz) Phosphoramidite belongs to the group of 2′O-TBDMS RNA Phosphoramidites.

Application

RNA interference (RNAi) has become a popular tool for the sequence-specific inhibition of gene expression and can be used in target validation and other drug development techniques. The most convenient method to provide sequence-specific RNA oligonucleotides is a chemical synthesis on a solid support with RNA phosphoramidites and RNA CPG, analogous to DNA synthesis.

Caractéristiques et avantages

  • Industry standard 2′O-TBDMS protective group
  • Consistent lot-to-lot purity and performance
  • Compatible with deprotection methods based on methylamine or AMA
  • Standard RNA phosphoramidites provide excellent coupling results when used with ETT or BTT as activator; best results are obtained with Activator 42
  • Capping with standard acetic anhydride capping reagent rather than with Fast Deprotection Cap A
  • Manufactured under a certified ISO 9001 quality system

Autres remarques

The unique properties of RNA have stimulated the development of a variety of applications in diagnostics and therapeutics, as well as in basic molecular biology research where RNA can be used as:
  • Catalytic agents (ribozymes)
  • Affinity ligands (aptamers)
  • Agents to induce gene silencing (RNA interference)

Code de la classe de stockage

11 - Combustible Solids

Classe de danger pour l'eau (WGK)

WGK 3

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable


Certificats d'analyse (COA)

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