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U211000

DMT-2′O-TBDMS-rU-phosphoramidit

Synonym(e):

5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-uridin, 3′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidit], DMT-2′-O-TBDMS-rU-amidit

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Über diesen Artikel

Empirische Formel (Hill-System):
C45H61N4O9PSi
CAS-Nummer:
Molekulargewicht:
861.05
NACRES:
NA.51
PubChem Substance ID:
UNSPSC Code:
12352200
MDL number:
Assay:
≥99% (31P-NMR), ≥99.0% (reversed phase HPLC)
Biological source:
non-animal source (no BSE/TSE risk)
Form:
powder
Storage temp.:
−20°C
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biological source

non-animal source (no BSE/TSE risk)

Quality Segment

product line

Proligo Reagents

assay

≥99% (31P-NMR), ≥99.0% (reversed phase HPLC)

form

powder

impurities

≤0.3 wt. % water content (Karl Fischer), ≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (31P-NMR), ≤0.5% single Impurity (reversed phase HPLC), ≤3 wt. % residual Solvent content

color

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

suitability

conforms to structure for H-NMR, conforms to structure for LC-MS

nucleoside profile

base: uridine
base protecting group: none
2' protecting group: TBDMS
5' protecting group: DMT
deprotection: fast/standard

storage temp.

−20°C

SMILES string

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O[Si](C)(C)C(C)(C)C)[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)N3C=CC(=O)NC3=O)(c4ccccc4)c5ccc(OC)cc5

InChI

1S/C45H61N4O9PSi/c1-31(2)49(32(3)4)59(55-29-15-27-46)57-40-38(56-42(48-28-26-39(50)47-43(48)51)41(40)58-60(10,11)44(5,6)7)30-54-45(33-16-13-12-14-17-33,34-18-22-36(52-8)23-19-34)35-20-24-37(53-9)25-21-35/h12-14,16-26,28,31-32,38,40-42H,15,29-30H2,1-11H3,(H,47,50,51)/t38-,40-,41-,42-,59?/m1/s1

InChI key

SKNLXHRBXYGJOC-ZMHKPELYSA-N

General description

DMT-2′O-TBDMS-rU-Phosphoramidit gehört zur Gruppe der 2′O-TBDMS-RNA-Phosphoramidite.

Application

RNA-Interferenz (RNAi) ist ein beliebtes Tool für die sequenzspezifische Hemmung der Genexpression und kann für die Zielvalidierung und andere Arzneimitteltechniken eingesetzt werden. Die praktischste Methode zum Bereitstellen von sequenzspezifischen RNA-Oligonukleotiden ist eine chemische Synthese auf einem festen Träger mit RNA-Phosphoramiditen und RNA-CPG, analog zur DNA-Synthese.

Features and Benefits

  • Industriestandard 2′O-TBDMS-Schutzgruppe
  • Gleichbleibende Reinheit und Leistung über alle Chargen
  • Mit Entschützungsverfahren auf Basis von Methylamin oder AMA kompatibel
  • Standard-RNA-Phosphoramidite liefern ausgezeichnete Kupplungsergebnisse, wenn sie mit ETT oder BTT als Aktivator verwendet werden; die besten Ergebnisse werden mit Aktivator 42 erzielt
  • Verkappung mit gängigem Essigsäureanhydrid-Verkappungsreagens statt mit Fast Deprotection Cap A
  • Hergestellt nach einem durch ISO 9001 zertifizierten Qualitätssystem

Other Notes

Die einzigartigen Eigenschaften von RNA regten die Entwicklung einer Reihe von Diagnose- und Therapieanwendungen sowie Anwendungen in der grundlegenden molekularbiologischen Forschung an, in denen RNA als Folgendes verwendet werden kann:
  • Katalysatoren (Ribozyme)
  • Affinitätsliganden (Aptamere)
  • Mittel zum Einleiten von Gen-Silencing (RNA-Interferenz)


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11 - Combustible Solids

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