C213000

DMT-2′O-TBDMS-rC(ac)-Phosphoramidit

• Synonym(e): N-acetyl-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-cytidin, 3′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidit]
• Empirische Formel (Hill-System): C₄₇H₆₄N₅O₉PSi
• CAS-Nummer: 121058-88-6
• Molekulargewicht: 902.10
• NACRES: NA.51
• PubChem Substance ID: 329774946
• UNSPSC Code: 12352200
• MDL number: MFCD09842111
• Assay: ≥99% (³¹P-NMR), ≥99.0% (reversed phase HPLC)
• Biological source: non-animal source (no BSE/TSE risk)
• Form: powder
• Storage temp.: −20°C

Eigenschaften

• biological source: non-animal source (no BSE/TSE risk)
• Quality Segment: 200, 300
• product line: Proligo Reagents
• assay: ≥99% (³¹P-NMR), ≥99.0% (reversed phase HPLC)
• form: powder
• technique(s): oligo synthesis: suitable
• impurities: ≤0.3 wt. % water content (Karl Fischer), ≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (³¹P-NMR), ≤0.5% single Impurity (reversed phase HPLC), ≤3 wt. % residual Solvent content
• color: white to off-white
• λ: conforms (UV/VIS Identity)
• suitability: conforms to structure for H-NMR, conforms to structure for LC-MS
• nucleoside profile: base: cytidine; base protecting group: acetyl; 2' protecting group: TBDMS; 5' protecting group: DMT; deprotection: fast/standard
• storage temp.: −20°C
• SMILES string: COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O[Si](C)(C)C(C)(C)C)[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)N3C=CC(NC(C)=O)=NC3=O)(c4ccccc4)c5ccc(OC)cc5
• InChI: 1S/C47H64N5O9PSi/c1-32(2)52(33(3)4)62(58-30-16-28-48)60-42-40(59-44(43(42)61-63(11,12)46(6,7)8)51-29-27-41(49-34(5)53)50-45(51)54)31-57-47(35-17-14-13-15-18-35,36-19-23-38(55-9)24-20-36)37-21-25-39(56-10)26-22-37/h13-15,17-27,29,32-33,40,42-44H,16,30-31H2,1-12H3,(H,49,50,53,54)/t40-,42-,43-,44-,62?/m1/s1
• InChI key: QKWKXYVKGFKODW-YOEDQOPESA-N

Beschreibung

General description

DMT-2′O-TBDMS-rC(ac)-Phosphoramidit gehört zur Gruppe der 2′O-TBDMS-RNA-Phosphoramidite.

Application

RNA-Interferenz (RNAi) ist ein beliebtes Tool für die sequenzspezifische Hemmung der Genexpression und kann für die Zielvalidierung und andere Arzneimitteltechniken eingesetzt werden. Die praktischste Methode zum Bereitstellen von sequenzspezifischen RNA-Oligonukleotiden ist eine chemische Synthese auf einem festen Träger mit RNA-Phosphoramiditen und RNA-CPG, analog zur DNA-Synthese.

Features and Benefits

Zu seinen Hauptmerkmalen zählen:

• Industriestandard 2′O-TBDMS-Schutzgruppe
• Gleichbleibende Reinheit und Leistung über alle Chargen
• Mit Entschützungsverfahren auf Basis von Methylamin oder AMA kompatibel
• Standard-RNA-Phosphoramidite liefern ausgezeichnete Kupplungsergebnisse, wenn sie mit ETT oder BTT als Aktivator verwendet werden; die besten Ergebnisse werden mit Aktivator 42 erzielt
• Verkappung mit gängigem Essigsäureanhydrid-Verkappungsreagens statt mit Fast Deprotection Cap A
• Hergestellt nach einem durch ISO 9001 zertifizierten Qualitätssystem

Other Notes

Die einzigartigen Eigenschaften von RNA regten die Entwicklung einer Reihe von Diagnose- und Therapieanwendungen sowie Anwendungen in der grundlegenden molekularbiologischen Forschung an, in denen RNA als Folgendes verwendet werden kann:

• Katalysatoren (Ribozyme)
• Affinitätsliganden (Aptamere)
• Mittel zum Einleiten von Gen-Silencing (RNA-Interferenz)

Sicherheitshinweise

• Lagerklasse: 11 - Combustible Solids
• wgk: WGK 3
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable