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  • Chromatin status of apoptosis genes correlates with sensitivity to chemo-, immune- and radiation therapy in colorectal cancer cell lines.

Chromatin status of apoptosis genes correlates with sensitivity to chemo-, immune- and radiation therapy in colorectal cancer cell lines.

Apoptosis : an international journal on programmed cell death (2014-10-09)
Anne Benard, Connie M Janssen, Peter J van den Elsen, Marja C J A van Eggermond, Dave S B Hoon, Cornelis J H van de Velde, Peter J K Kuppen
RESUMEN

The apoptosis pathway of programmed cell death is frequently deregulated in cancer. An intact apoptosis pathway is required for proper response to anti-cancer treatment. We investigated the chromatin status of key apoptosis genes in the apoptosis pathway in colorectal cancer cell lines in relation to apoptosis induced by chemo-, immune- or radiation therapy. Using chromatin immunoprecipitation (ChIP), we measured the presence of transcription-activating histone modifications H3Ac and H3K4me3 and silencing modifications H3K9me3 and H3K27me3 at the gene promoter regions of key apoptosis genes Bax, Bcl2, Caspase-9, Fas (CD95) and p53. Cell lines DLD1, SW620, Colo320, Caco2, Lovo and HT29 were treated with cisplatin, anti-Fas or radiation. The apoptotic response was measured by flow cytometry using propidium iodide and annexin V-FITC. The chromatin status of the apoptosis genes reflected the activation status of the intrinsic (Bax, Bcl2, Caspase-9 and p53) and extrinsic (Fas) pathways. An active intrinsic apoptotic pathway corresponded to sensitivity to cisplatin and radiation treatment of cell lines DLD1, SW620 and Colo320. An active Fas promoter corresponded to an active extrinsic apoptotic pathway in cell line DLD1. mRNA expression data correlated with the chromatin status of the apoptosis genes as measured by ChIP. In conclusion, the results presented in this study indicate that the balance between activating and silencing histone modifications, reflecting the chromatin status of apoptosis genes, can be used to predict the response of tumor cells to different anti-cancer therapies and could provide a novel target to sensitize tumors to obtain adequate treatment responses.

MATERIALES
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Sigma-Aldrich
Sodium acetate, anhydrous, ReagentPlus®, ≥99.0%
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Sigma-Aldrich
Cloruro de sodio, for molecular biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
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Sigma-Aldrich
Sodium acetate, ACS reagent, ≥99.0%
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Sigma-Aldrich
Sodium acetate, puriss. p.a., ACS reagent, reag. Ph. Eur., anhydrous
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Sigma-Aldrich
Sodium chloride solution, 0.9% in water, BioXtra, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Fluoruro de fenilmetansulfonilo, ≥98.5% (GC)
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Cloruro de sodio, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99%
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Sigma-Aldrich
Sodium chloride solution, 5 M in H2O, BioReagent, for molecular biology, suitable for cell culture
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1 L
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SAFC
Sodium chloride solution, 5 M
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Sigma-Aldrich
Sodium butyrate, 98%
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Número de referencia del producto (SKU)Tamaño de envaseDisponibilidadPrecioCantidad
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Sigma-Aldrich
cis-Diammineplatinum(II) dichloride, crystalline
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25 mg
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250 mg
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Sigma-Aldrich
Sodium chloride solution, BioUltra, for molecular biology, ~5 M in H2O
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1 L
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Sigma-Aldrich
Fluoruro de fenilmetansulfonilo, ≥99.0% (T)
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Disponibilidad
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Sigma-Aldrich
Cloruro de sodio, 99.999% trace metals basis
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Sigma-Aldrich
Isoamyl alcohol, ≥98%, FG
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Número de referencia del producto (SKU)Tamaño de envaseDisponibilidadPrecioCantidad
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US$ 35,80
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Cloruro de sodio, BioUltra, for molecular biology, ≥99.5% (AT)
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Sigma-Aldrich
3-Methyl-1-butanol, reagent grade, 98%
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Sigma-Aldrich
Sodium acetate, >99%, FG
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Precio
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Sigma-Aldrich
Sodium acetate, 99.995% trace metals basis
Número de referencia del producto (SKU)
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Disponibilidad
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Sigma-Aldrich
3-Methyl-1-butanol, ACS reagent, ≥98.5%
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Disponibilidad
Precio
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Sigma-Aldrich
Sodium acetate solution, BioUltra, for molecular biology, ~3 M in H2O
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Número de referencia del producto (SKU)Tamaño de envaseDisponibilidadPrecioCantidad
100 mL
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US$ 163,00
Sigma-Aldrich
Sodium acetate, anhydrous, free-flowing, Redi-Dri, ACS reagent, ≥99.0%
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Sodium acetate, anhydrous, BioUltra, for luminescence, for molecular biology, ≥99.0% (NT)
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Sigma-Aldrich
Sodium acetate, powder, BioReagent, suitable for electrophoresis, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, ≥99%
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Sigma-Aldrich
Isoamyl alcohol, natural, ≥98%, FG
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Disponibilidad
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Sigma-Aldrich
3-Methylbutanol, for molecular biology, BioReagent, ≥98.5%
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Sigma-Aldrich
cis-Diamineplatinum(II) dichloride, ≥99.9% trace metals basis
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Cantidad
Sigma-Aldrich
Cloruro de sodio, BioXtra, ≥99.5% (AT)
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Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Sodium acetate, anhydrous, for molecular biology, ≥99%
Número de referencia del producto (SKU)
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Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Anticuerpo anti-acetil-histona H3, from rabbit
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