Saltar al contenido
Merck

Pharmacological disruption of hepatitis C NS5A protein intra- and intermolecular conformations.

The Journal of general virology (2013-09-03)
Dipankar Bhattacharya, Israrul H Ansari, Robert Hamatake, Jill Walker, Wieslaw M Kazmierski, Rob Striker
RESUMEN

Non-structural 5A protein (NS5A) has emerged as an important pharmacological target for hepatitis C virus (HCV). However, little is known about the conformation of NS5A intracellularly or how NS5A inhibitors achieve the picomolar (pM) inhibition of virus replication. Here, we have presented two structurally related small molecules, one that potently inhibits HCV replication and selects for resistance in NS5A, and another that is inactive. Resistance to this antiviral was greater in genotype 1a than in genotype 1b replicons and mapped to domain 1 of NS5A. Using a novel cell-based assay that measures the intracellular proximity of fluorescent tags covalently attached to NS5A, we showed that only the active antiviral specifically disrupted the close proximity of inter- and intramolecular positions of NS5A. The active antiviral, termed compound 1, caused a repositioning of both the N and C termini of NS5A, including disruption of the close approximation of the N termini of two different NS5A molecules in a multimolecular complex. These data provide the first study of how antivirals that select resistance in domain 1 of NS5A alter the cellular conformation of NS5A. This class of antiviral disrupts the close proximity of the N termini of domain 1 in a NS5A complex but also alters the conformation of domain 3, and leads to large aggregates of NS5A. Current models predict that a multicomponent cocktail of antivirals is needed to treat HCV infection, so a mechanistic understanding of what each component does to the viral machinery will be important.

MATERIALES
Referencia del producto
Marca
Descripción del producto

Sigma-Aldrich
1-Propanol, suitable for HPLC, ≥99.9%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Sodium deoxycholate, BioXtra, ≥98.0% (dry matter, NT)
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1-Propanol, ACS reagent, ≥99.5%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid solution, 0.02% in DPBS (0.5 mM), sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, anhydrous, crystalline, BioReagent, suitable for cell culture
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, 99.995% trace metals basis
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
SAFC
Sodium deoxycholate
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, ACS reagent, 99.4-100.6%, powder
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Sodium deoxycholate, ≥97% (titration)
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1-Propanol, ≥99%, FG
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
2,3-Dimercapto-1-propanol, ≥98% (iodometric)
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1-Propanol, ≥99% (GC), purum
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1-Propanol, anhydrous, 99.7%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, anhydrous, BioUltra, ≥99% (titration)
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
USP
1-Propanol, United States Pharmacopeia (USP) Reference Standard
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt solution, BioUltra, for molecular biology, pH 8.0, ~0.5 M in H2O
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1,2-etanoditiol, technical grade, ≥90%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1-Propanol, natural, ≥98%, FG
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1,2-etanoditiol, ≥98.0% (GC)
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Supelco
1-Propanol, Pharmaceutical Secondary Standard; Certified Reference Material
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, purified grade, ≥98.5%, powder
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Supelco
1-Propanol, analytical standard
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, ≥98.0% (KT)
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, BioUltra, ≥99.0% (KT)
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1-Propanol, JIS special grade
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, SAJ special grade, ≥99.0%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad
Sigma-Aldrich
1-Propanol, SAJ first grade, ≥99.0%
Número de referencia del producto (SKU)
Tamaño de envase
Disponibilidad
Precio
Cantidad