Saltar al contenido
MilliporeSigma

Urinary Volatile Organic Compounds for the Detection of Prostate Cancer.

PloS one (2015-11-26)
Tanzeela Khalid, Raphael Aggio, Paul White, Ben De Lacy Costello, Raj Persad, Huda Al-Kateb, Peter Jones, Chris S Probert, Norman Ratcliffe
RESUMEN

The aim of this work was to investigate volatile organic compounds (VOCs) emanating from urine samples to determine whether they can be used to classify samples into those from prostate cancer and non-cancer groups. Participants were men referred for a trans-rectal ultrasound-guided prostate biopsy because of an elevated prostate specific antigen (PSA) level or abnormal findings on digital rectal examination. Urine samples were collected from patients with prostate cancer (n = 59) and cancer-free controls (n = 43), on the day of their biopsy, prior to their procedure. VOCs from the headspace of basified urine samples were extracted using solid-phase micro-extraction and analysed by gas chromatography/mass spectrometry. Classifiers were developed using Random Forest (RF) and Linear Discriminant Analysis (LDA) classification techniques. PSA alone had an accuracy of 62-64% in these samples. A model based on 4 VOCs, 2,6-dimethyl-7-octen-2-ol, pentanal, 3-octanone, and 2-octanone, was marginally more accurate 63-65%. When combined, PSA level and these four VOCs had mean accuracies of 74% and 65%, using RF and LDA, respectively. With repeated double cross-validation, the mean accuracies fell to 71% and 65%, using RF and LDA, respectively. Results from VOC profiling of urine headspace are encouraging and suggest that there are other metabolomic avenues worth exploring which could help improve the stratification of men at risk of prostate cancer. This study also adds to our knowledge on the profile of compounds found in basified urine, from controls and cancer patients, which is useful information for future studies comparing the urine from patients with other disease states.

MATERIALES
Referencia del producto
Marca
Descripción del producto

Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, ACS reagent, ≥97.0%, pellets
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, reagent grade, ≥98%, pellets (anhydrous)
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio solution, 50% in H2O
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio solution, BioUltra, for molecular biology, 10 M in H2O
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, BioXtra, ≥98% (acidimetric), pellets (anhydrous)
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio solution, 1.0 N, BioReagent, suitable for cell culture
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, puriss., meets analytical specification of Ph. Eur., BP, NF, E524, 98-100.5%, pellets
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, reagent grade, 97%, powder
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, pellets, semiconductor grade, 99.99% trace metals basis
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, puriss. p.a., ACS reagent, reag. Ph. Eur., K ≤0.02%, ≥98%, pellets
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Fibra de divinilbenceno/carboxeno/polidimetilsiloxano (DVB/CAR/PDMS) de SPME, needle size 24 ga, StableFlex
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio solution, 0.1 M
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Fibra de divinilbenceno/carboxeno/polidimetilsiloxano (DVB/CAR/PDMS) de SPME, needle size 23 ga, StableFlex, for use with autosampler
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio solution, 5.0 M
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Fibra de divinilbenceno/carboxeno/polidimetilsiloxano (DVB/CAR/PDMS) de SPME, needle size 24 ga, for use with manual holder
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Fibra de divinilbenceno/carboxeno/polidimetilsiloxano (DVB/CAR/PDMS) de SPME, needle size 23 ga, StableFlex, for use with manual holder or autosampler, fiber L 2 cm
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, beads, 16-60 mesh, reagent grade, 97%
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, puriss. p.a., ACS reagent, K ≤0.02%, ≥98.0% (T), pellets
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Fibra de divinilbenceno/carboxeno/polidimetilsiloxano (DVB/CAR/PDMS) de SPME, needle size 24 ga, StableFlex, for use with autosampler
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio solution, 1 M
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Filtro SPME Polidimetilsiloxano (PDMS), df 100 μm(PDMS, for use with autosampler, needle size 23 ga
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, reagent grade, 97%, flakes
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Filtro SPME Polidimetilsiloxano (PDMS), df 100 μm(PDMS, needle size 24 ga, for use with manual holder
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, BioUltra, for luminescence, ≥98.0% (T), pellets
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Filtro SPME Polidimetilsiloxano (PDMS), df 100 μm(PDMS, for use with autosampler, needle size 24 ga
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Supelco
Fibra de carboxeno/polidimetilsiloxano (DVB/CAR/PDMS) de SPME, df 75 μm(CAR/PDMS, for use with manual holder, needle size 24 ga
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, JIS special grade, ≥96.0%
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, SAJ first grade, ≥95.0%
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Poly(dimethylsiloxane), viscosity 1.0 cSt (25 °C)
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad
Sigma-Aldrich
Hidróxido de sodio, ultra dry, powder or crystals, 99.99% trace metals basis
En este momento no podemos mostrarle ni los precios ni la disponibilidad