分子信标

• 分子信标的结构和功能
• 分子信标设计和功能
• 使用分子信标的优势
• 相关产品类别

分子信标是一种寡核苷酸探针（30-50 个碱基的短单链核酸序列），用于分子生物学和遗传学研究。它们设计为侧接间接重复序列的独特序列，从而形成茎环结构，使 5' 和 3' 末端保持接近。分子信标探针与靶标杂交后会发出荧光。这些结构化探针具有高度敏感性和序列特异性，用于qPCR和体外研究中的序列检测。

分子信标的结构和功能

分子信标是一种单链双标记荧光探针，通过探针两端的互补干细胞序列（约 4～6nt）保持发夹环构象（20～25nt最常见）。探针的 5’ 端和 3’ 端分别含有一个报告分子和一个淬灭分子。环是与靶序列互补的单链 DNA 序列。报告分子（荧光团或荧光染料）和淬灭分子的接近，导致报告分子的天然荧光发射因周围的能量转移而被淬灭。分子信标的结构和机制如下所示（图1）。

分子信标的设计和功能

• 分子信标探针设计有四个基本部分：环、茎、淬灭分子和报告分子。
• 分子信标的茎和环区域形成稳定的发夹结构，使荧光团和淬灭分子非常接近。这种紧密的接近导致淬灭分子吸收荧光团发射的荧光，从而有效地抑制信号。
• 当分子信标遇到互补的靶序列时，导致发夹环结构打开并将5' 端报告分子与 3' 端淬灭分子分开。由于淬灭分子不再靠近报告分子，报道分子的荧光不再被淬灭，荧光发射发生。 
• 荧光信号的强度与样品中的靶核酸量成正比。
• 在实时 PCR 中，如果在扩增之前添加分子信标，会破坏茎中的碱基配对。这使得探针在变性时与互补靶标杂交，从而分离报告分子和淬灭分子，诱发报告分子染料发出荧光。

图 1. 分子信标工作原理

使用分子信标的优势

• 提高特异性和灵敏度
• 实时检测能力
• 非常适合单核苷酸多态性 (SNP) 分析

将锁核酸加入信标探针

• 增加热稳定性和杂交特异性
• 在SNP检测、等位基因鉴别和体外定量或检测方面具有更高的准确性
  
• 针对有问题的靶序列设计更简单灵敏的探针

产品特性

• 规格：1、3、5和10 OD
• 纯化方法：HPLC
• 序列长度：15 – 40 bp
• 质量控制：100%质谱分析
• 形式：干粉，棕色管包装
• 可选的自定义形式（标准化、专用板等）

我们可根据具体应用提供相应形式的探针，以简化您的实验计划。

分子信标应用

• SNP检测
• 等位基因鉴别
• 病原体检测
• 多重测定（Multiplexing）
• 病毒含量定量
• 基因表达分析
• 基因拷贝测定
• 终点基因分型
• 体外定量或检测

保证产量

保证 OD 产量	近似 nmol	近似 µg	大约的 反应数
1	3	32	600
3	9	96	1,800
5	15	160	3,000
10	30	320	6,000

*估计值基于1OD 3nmol或 32μg和25μl反应200nM（5.0 pmol/反应）。估计值基于30个碱基的平均序列长度。

下面列出了最常见的荧光团和淬灭分子组合：

光谱性质表

染料	最大 EX（nm）	最大 EM（nm）	相容的 淬灭剂
6-FAM™	495	520	BHQ™-1, DABCYL
JOE™	529	555	BHQ™-1, DABCYL
TET™	521	536	BHQ™-1, DABCYL
HEX™	535	556	BHQ™-1, DABCYL
Cyanine 3	549	566	BHQ™-2, DABCYL
ROX™	586	610	BHQ™-2, DABCYL
TxRd (Sulforhodamine 101-X)	597	616	BHQ™-2, DABCYL
Cyanine 5	646	669	BHQ™-3, DABCYL
Cyanine 5.5	675	694	BHQ™-3, DABCYL

发货计划

含量(OD)	1	3	5	10
标准染料分子信标	5 天	5 天	5 天	5 天
带标准染料的锁核酸分子信标	7 天	7 天	7 天	7 天
带后合成染料的分子信标，带有/不带锁核酸	7-10 天	7-10 天	7-10 天	7-10 天

*由于国际过境、通关延误等原因，交货时间可能较长。大型项目将根据客户的项目需要安排在交货时间表中。

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