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  • Comprehensive quantitative analysis of purines and pyrimidines in the human malaria parasite using ion-pairing ultra-performance liquid chromatography-mass spectrometry.

Comprehensive quantitative analysis of purines and pyrimidines in the human malaria parasite using ion-pairing ultra-performance liquid chromatography-mass spectrometry.

Journal of chromatography. B, Analytical technologies in the biomedical and life sciences (2014-08-05)
Christian D Laourdakis, Emilio F Merino, Andrew P Neilson, Maria B Cassera
ZUSAMMENFASSUNG

Targeted metabolite profiling has aided in the understanding of a variety of biological processes in the malaria parasite as well as in drug discovery. A fast and sensitive analytical method, based on ion-pairing reversed phase ultra-high performance liquid chromatography tandem mass spectrometry (IP-RP-UPLC-MS/MS), was optimized for the simultaneous analysis of intracellular levels of 35 purine and pyrimidine nucleobases, nucleosides, and nucleotides. This analytical method allows for chromatographic separation of highly polar metabolites using reverse phase chemistry within 15 min. The analytical performance of the method was evaluated and successfully applied to the quantification of purines and pyrimidines in Plasmodium falciparum and its host cell, the human erythrocyte. In addition, this method can be customized to include other related metabolites such as NADPH and NADP, among others.

MATERIALIEN
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Produktbeschreibung

Sigma-Aldrich
Acetonitril, suitable for HPLC, gradient grade, ≥99.9%
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Sigma-Aldrich
Acetonitril, HPLC Plus, ≥99.9%
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Ameisensäure, reagent grade, ≥95%
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Natriumbicarbonat, ACS reagent, ≥99.7%
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Ameisensäure, ACS reagent, ≥96%
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Natriumbicarbonat, powder, BioReagent, for molecular biology, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture
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Acetonitril, ACS reagent, ≥99.5%
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Ammoniumformat, reagent grade, 97%
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Natriumbicarbonat, ReagentPlus®, ≥99.5%, powder
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Acetonitril, suitable for HPLC, gradient grade, ≥99.9%
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Ammoniumformat, ≥99.995% trace metals basis
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Natriumbicarbonat, anhydrous, free-flowing, Redi-Dri, ACS reagent, ≥99.7%
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Ameisensäure, ACS reagent, ≥88%
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Thymidin, powder, BioReagent, suitable for cell culture
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Adenin, ≥99%
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Adenosin, ≥99%
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Ammoniumformiat -Lösung, BioUltra, 10 M in H2O
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Thymidin, ≥99%
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Uridin, ≥99%
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Hypoxanthin, ≥99.0%
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Inosin, ≥99% (HPLC)
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Uridin, powder, BioReagent, suitable for cell culture
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Natriumbicarbonat, puriss., meets analytical specification of Ph. Eur., BP, USP, FCC, E500, 99.0-100.5%, powder
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Guanin, 98%
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Acetonitril, biotech. grade, ≥99.93%
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Adenin, BioReagent, suitable for cell culture
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Guanosin, ≥98%
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Xanthin, ≥99%
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Hypoxanthin, powder, BioReagent, suitable for cell culture
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Zyklisches Adenosin-3′,5′-Monophosphat, ≥98.5% (HPLC), powder
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