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臭化エチジウム

for fluorescence, ≥95.0% (HPLC)

• 別名: 3,8-ジアミノ-5-エチル-6-フェニルフェナントリジニウムブロミド, EtBr, 臭化ホミジウム
• 実験式（ヒル表記法）: C₂₁H₂₀BrN₃
• CAS番号: 1239-45-8
• 分子量: 394.31
• Beilstein: 3642536
• EC Number: 214-984-6
• MDL番号: MFCD00011724
• UNSPSCコード: 12352200
• PubChem Substance ID: 57650683

特性

• グレード: for fluorescence
• アッセイ: ≥95.0% (HPLC)
• mp: 260-262 °C (dec.) (lit.)
• 溶解性: H₂O: 10 mg/mL, opaque, very dark red
• 蛍光検出: λ_ex 480 nm; λ_em 620 nm in H₂O; λ_ex 530 nm; λ_em 600 nm in 50 mM phosphate buffer pH 7.0 (upon binding to DNA)
• SMILES記法: [Br-].CC[n+]1c(-c2ccccc2)c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc14
• InChI: 1S/C21H19N3.BrH/c1-2-24-20-13-16(23)9-11-18(20)17-10-8-15(22)12-19(17)21(24)14-6-4-3-5-7-14;/h3-13,23H,2,22H2,1H3;1H
• InChI Key: ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N

詳細

詳細

Ethidium bromide (EtBr) undergoes complexation with nucleic acids (DNA and RNA) specifically to the saturated sites. These complexes decomposes by employing a cation-exchange resin. It has been reported to inhibit the production of mitochondrial RNA in HeLa cells. On interaction with helical polynucleotides under high salt medium, it forms fluorescent complex (having high fluorescence quantum yield).

アプリケーション

臭化エチジウム（EtBr）は、PAGEまたはアガロースゲル電気泳動に最もよく使用される核酸染色です。EtBrの蛍光は、二本鎖RNAに結合すると21倍に、二本鎖DNAに結合すると25倍に増加するため、バックグラウンドの脱色は不要であり、染色濃度を抑えることができます（10 μg/mL）。EtBrは、多数の核酸蛍光アッセイで使用されています。一本鎖DNA（それほど強くはありませんが）および三本鎖DNAに結合することが示されています。DNAに結合できるため、EtBrはDNAポリメラーゼの阻害剤です。

二本鎖DNAおよびRNAをインターカレーションするフレームシフト変異誘発物質です。

Ethidium bromide has been used to prepare fluorescent stock solution for the evaluation of cell viability during the live/dead assay of adipose-derived stem cells (ADSCs) seeded on irradiated hydrogels.

生物化学的／生理学的作用

エチジウムブロミドは、二本鎖のDNAとRNAにインターカレーションし、フレームシフト変異誘発物質として働きます。アクリジンオレンジとともに使用することによって、生細胞、アポトーシス細胞、壊死細胞を識別することもできます。

再構成

電気泳動後のゲルの染色に用いる場合は、ストック溶液を水で0.5 μg/mLに希釈し、ゲルを15～30分間浸漬します。通常は脱染は不要ですが、バックグラウンドを低下させる必要がある場合は、水で15分間脱染できます。 UVライトボックス(波長254 nm)でDNAバンドを検出できます。ゲルおよび泳動用バッファーに臭化エチジウムを0.5 μg/mLとなるよう添加しておくと、泳動終了後すぐにバンド検出を行なうことができます。

その他情報

DNAのインタ-カレ-タ-剤で、蛍光標識物質です。Destruction and decontamination of solutionsを参照してください。

安全性情報

• ピクトグラム: GHS06,GHS08
• シグナルワード: Danger
• 危険有害性情報: H302,H330,H341
• 注意書き: P202 - P260 - P264 - P270 - P301 + P312 - P304 + P340 + P310
• 危険有害性の分類: Acute Tox. 1 Inhalation - Acute Tox. 4 Oral - Muta. 2
• 保管分類コード: 6.1A - Combustible acute toxic Cat. 1 and 2 / very toxic hazardous materials
• WGK: WGK 1
• 引火点(°F): Not applicable
• 引火点(℃): Not applicable
• 個人用保護具 (PPE): Eyeshields, Faceshields, Gloves, type P3 (EN 143) respirator cartridges