タンパク質パスウェイの解析
生体内での生化学的シグナルや環境シグナルは、細胞内プロセスの他、細胞、組織、臓器の間の相互作用もコントロールします。これらのシグナルは、タンパク質、酵素、受容体の複雑なネットワークやパスウェイによって伝達されます。タンパク質パスウェイの解析は、細胞プロセスや生物学的プロセスを理解し、こうしたプロセスが生理機能、機能不全、疾患に及ぼす影響を知るための鍵となります。インヒビター、アクチベーター、その他のパスウェイ調節因子をはじめとする低分子化合物は、細胞シグナリングや細胞の運命、機能、表現型を制御するメカニズムを調べる研究者に不可欠なツールです。
タンパク質パスウェイの解析についての詳細は、以下をご覧ください。
関連技術資料
- Discover Bioactive Small Molecules for ADME/Tox
- 化合物ライブラリースクリーニングに関する理解を深めて、Library of Pharmacologically Active Compounds(LOPAC®1280)を含む化合物ライブラリーをご覧いただき、生物学的注釈付きのすぐにスクリーニング可能な化合物のゴールドスタンダードコレクションを体験してください。
- The C-terminal c-Src kinase (Csk) is a 50-kDa cytosolic tyrosine kinase expressed in all examined cell types
- The focal adhesion kinase (FAK) is a cytoplasmic protein tyrosine kinase. FAK has been implicated as a downstream signaling molecule that functions in the control of several integrin-regulated biological processes.
- G protein-coupled receptor kinases (GRKs) are a family of protein kinases. Learn about GRKs and why the seven GRKs can be divided into three subfamilies based on overall structural organization and homology.
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関連プロトコル
- The appearance of uric acid is measured at 293nm by spectrophotometry.
- To measure 5′-nucleotidase activity, this procedure uses adenosine 5’-monophosphate and a color reagent to create a standard curve for determining the micromoles of phosphorus liberated.
- This procedure may be used for the determination of Amyloglucosidase activity using starch as the substrate.
- To measure luciferase activity, an assay that measures light emission with a luminometer is used. Firefly luciferase is used for detection and quantitation of ATP and as a reporter for genetic function.
- This technical article described the Enzymatic Assay of Trypsin Inhibitor.
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技術資料・プロトコルの検索
化合物のスクリーニングと化学的処理
化合物のスクリーニングは創薬に不可欠で、プローブ化合物の特定を行います。ハイスループットスクリーニングから治療に使えそうな標的の酵素やタンパク質のアッセイまで、さまざまな技法を用います。スクリーニングでは、バイオマーカーの発現、タンパク質の活性、および細胞の挙動に期待する変化をもたらしてくれる化合物を特定するための表現型アッセイの利用が増える傾向にあります。ケミカルライブラリースクリーニングは、創薬のスタート地点に立てそうなヒット化合物の特定に役立ちます。スタート地点に立った研究者は、ターゲットベーススクリーニングまたは表現型スクリーニングで見つけたヒットを絞り込んでリード化合物を決め、検討・開発を重ねて医薬品誕生に繋げることができます。
タンパク質・酵素の活性
タンパク質は、生体分子であり、アミノ酸から成る高分子です。タンパク質は、細胞内や生体内で以下のようなさまざまな機能を発揮します。
- 反応の触媒
- DNA複製のアシスト
- 分子の輸送
- 細胞の構造を形作る
- 細胞シグナリングのための受容体として働く
- チャネルとなって、荷電分子が細胞膜を通過できるようにする
タンパク質活性の失活は多くの疾患に結びついており、細胞や生体がどのように機能するかを知るためには、タンパク質や酵素の活性の解明が欠かせません。タンパク質や酵素の活性は、低分子を用いて機能を阻害/調節し、タンパク質/酵素の濃度変化を観察することで調べられます。あるいは、酵素活性アッセイを用いて、化合物が酵素活性にどのように影響するかを明らかにすることによっても、タンパク質・酵素活性の解明は可能です。
タンパク質パスウェイの調節
タンパク質パスウェイの相互作用は、細胞の増殖、分化、シグナル伝達、アポトーシスなど、生物学的プロセスに重要な役割を果たします。生物学的プロセスを根底から支えるメカニズムや、複数の生物学的プロセスがどのように連関して疾患に繋がっていくのかを探るには、低分子は重要なツールです。低分子を使って、あるパスウェイに関与するタンパク質を調節することもでき、こうしたタンパク質の役割を突き止めたり、パスウェイ中で他のタンパク質とどのように相互作用するかを特定したりできます。相互作用を阻害/妨害することでタンパク質パスウェイを調節できます。また、タンパク質や受容体を活性化し、アクチベーターやアゴニストと生物学的反応を起こすことでも調節が可能です。
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