07-360

Anticorpo anti-acetil-istone H3 (Lys27)

serum, Upstate^®

• Sinonimo/i: H3K27Ac, Histone H3 (acetyl K27)
• UNSPSC Code: 12352203
• NACRES: NA.41
• eCl@ss: 32160702
• Clone: polyclonal
• Species reactivity: human, vertebrates, Saccharomyces cerevisiae
• Application: ChIP, DB, WB
• Citations: 178

Proprietà

• biological source: rabbit
• Quality Segment: 100
• antibody form: serum
• antibody product type: primary antibodies
• clone: polyclonal
• species reactivity: human, vertebrates, Saccharomyces cerevisiae
• species reactivity (predicted by homology): yeast (based on 100% sequence homology)
• manufacturer/tradename: Upstate^®
• technique(s): ChIP: suitable (ChIP-seq), dot blot: suitable, western blot: suitable
• isotype: IgG
• NCBI accession no.: NM_003493
• UniProt accession no.: P61830
• shipped in: dry ice
• target post-translational modification: acetylation (Lys27)
• Gene Information: human ... HIST1H3F(8968)

Descrizione

General description

17 kDa

L′istone H3 (UniProt: P61830) nei lieviti è codificato dal gene HHT1 (conosciuto anche come YBR010W, YBR0201, HHT2, SIN2, YNL031C, N2749) (Gene ID: 852295). L'istone H3 è un componente fondamentale del nucleosoma. I nucleosomi avvolgono e compattano il DNA in cromatina, limitandone l'accessibilità agli apparati cellulari che richiedono il DNA come stampo. L'istone H3 può subire diverse modificazioni post-traduzionali che attivano o reprimono l'espressione genica. Può essere mono-, di- o trimetilato. È stato dimostrato che l'istone H3 (H3K27) trimetilato è strettamente associato ai promotori genici inattivi, mentre l'H3K27 monometilato ai promotori attivi. L'H3K27 dimetilato ha un pattern di distribuzione simile all'H3K27. L'istone H3 può anche subire l'acetilazione a livello delle Lys9, 14, 18, 23, 27 e 56. La sua acetilazione porta all′attivazione della trascrizione. L'acetilazione dell'istone determina l'apertura della cromatina, poiché gli istoni acetilati non possono impacchettarsi bene tra loro come gli istoni deacetilati. L′istone H3 acetilato (H3K27ac) è un importante segno di amplificazione che consente di distinguere tra enhancer attivi e poised; i geni enhancer prossimali che non presentano un arricchimento di H3K27ac mostrano livelli di espressione inferiori rispetto alla media dei geni enhancer prossimali. È stato dimostrato che la quantità di H3K27ac diminuisce gradualmente dal primissimo stadio pronucleare fino allo stadio a 8 cellule, corrispondente alla maggiore attivazione del genoma embrionale (EGA). La successiva riacetilazione di H3K27, che avviene a partire dallo stadio di morula, accompagna la prima specificazione del lignaggio cellulare negli embrioni FIV. Nella Drosophila, H3K27ac è presente ad alti livelli nei primi stadi embrionali e diminuisce dopo 4 ore, mentre aumenta il livello di H3K27 trimetilato. (Rif.: Creyghton, MP et al. ( ). Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107(50); 21931-21936; Tie, F et al (2009). Dvelopment 136 (18); 3131-3141).

Immunogen

Epitopo: Lys27

Peptide lineare, coniugato con KLH, corrispondente a 11 amminoacidi della regione N-terminale dell′istone H3 umano acetilato sulla Lisina 27.

Application

Saggio di ChIP-seq: L′immunoprecipitazione della cromatina è stata ottenuta con il kit Magna ChIP HiSens (N° Cat. 17-10460), 2 µL di anticorpo anti-acetil-istone H3 (Lys27) (N° Cat. 07-360), 20 µL di sferette con Proteina A/G e cromatina trattata con formaldeide (crosslinked) ottenuta da 1e6 cellule HeLa, seguita da purificazione del DNA su sferette magnetiche. Le librerie sono state preparate da campioni di DNA input e ChIP usando protocolli standard con adattatori Illumina contrassegnati da codici a barre e analizzati nello strumento Illumina HiSeq. Gli oltre 14 milioni di letture contenute nei file FastQ del sequenziatore sono state mappate usando il sistema di allineamento Bowtie (http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml) dopo rimozione dei tag con TagDust (http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource/). I picchi sono stati identificati con il software MACS (http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/), con picchi e letture visualizzati come track personalizzato nel Genome Browser dell′UCSC (http://genome.ucsc.edu) da file nei formati BigWig e BED. I picchi più alti identificati nel set di dati 07-360, corrispondenti al 25% dei campioni, erano sovrapponibili al 96% ai picchi identificati nel track H3K27Ac BROAD Histone di ENCODE per la linea cellulare HeLa S3.

Categoria di ricerca
Epigenetica & funzione nucleare

L'anticorpo anti-acetil-istone H3 (Lys27), è un anticorpo policlonale di coniglio che permette la rivelazione dell'istone H3 acetilato sulla Lisina 27. Conosciuto anche come anti-H3K27ac, questo anticorpo è oggetto di pubblicazioni su riviste soggette a "peer review”; è convalidato per scopi di ChIP, ChIP-seq, WB, DB, Mplex e la sua specificità è stata verificata mediante dot blot (DB).

Sotto categoria di ricerca
Istoni

Biochem/physiol Actions

Riconosce l′istone H3 acetilato sulla lisina 27.

Physical form

Antisiero policlonale di coniglio con azoturo di sodio allo 0,05% e glicerolo al 30%.

Non purificato

Preparation Note

A -20°C si conserva per 2 anni dalla data di spedizione. Suddividere in aliquote per evitare di scongelare/ricongelare ripetutamente. Per ottimizzare il recupero del prodotto, centrifugare il flaconcino originale dopo lo scongelamento e prima di togliere il tappo.

Analysis Note

Controllo
Proteine ​estratte in acido da cellule HeLa trattate con butirrato di sodio

Valutata mediante Western blotting su estratto acido di cellule HeLa trattate con butirrato di sodio 5 mM.
Saggio di Western blotting: questo anticorpo diluito 1:5.000 ha permesso di rivelare l′acetil-istone H3 (Lys27) in estratto acido di cellule HeLa trattate con butirrato di sodio 5 mM.

Other Notes

Concentrazione: per la concentrazione specifica del lotto, fare riferimento al Certificato di Analisi.

Legal Information

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

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• Classe di stoccaggio: 12 - Non Combustible Liquids
• wgk: WGK 1
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