Technologie de la chimiothèque codée par ADN dans la découverte de médicaments
La technologie de la chimiothèque codée par ADN (DEL, pour DNA-encoded library) a révolutionné la découverte de médicaments ("drug discovery") en permettant de cribler et d'identifier efficacement de potentiels médicaments candidats. Les DEL offrent plusieurs avantages par rapport aux chimiothèques de petites molécules traditionnelles, comme la possibilité de cribler un grand nombre de composés en une seule expérience, une grande diversité chimique et des données de criblage riches en informations.
Avec DyNAbind®, il est maintenant possible d'accéder à une technologie DEL innovante pour identifier les "hits" (composés actifs ou touches), optimiser les "leads" (têtes de série) et déconvoluer les cibles. Les kits de DEL réduisent au maximum les coûts de démarrage et les délais d'exécution en fournissant des chimiothèques de composés pré-assemblées, ainsi que le matériel, les produits, les protocoles et les réactifs nécessaires à la réalisation d'un criblage à haut débit.
Nos offres de DEL :
DYNA001 La chimiothèque de fragments codée par ADN améliore la précision du criblage des cibles. La découverte de médicaments basée sur les fragments emploie de petits composés de faible poids moléculaire, ou fragments, qui servent de point de départ à la conception des médicaments. Les DEL peuvent être criblées par rapport à une cible afin d'identifier les fragments actifs (hits) qui peuvent être utilisés pour former de plus gros composés.
DYNA002 Les kits de chimiothèque codée par ADN avec 10 millions de composés contiennent au moins 10 millions de petites molécules qui se lient à des cibles spécifiques. Disponibles en kits de 2 ou 5 flacons, la concentration est optimisée de façon à ce que chaque flacon permette de tester une seule condition. Le coût de la chimiothèque comprend la génération d'une liste de 50 hits, ou jusqu'à 60 hits en cas de liens. La structure de tous les hits est révélée sans frais supplémentaire et aucun autre frais de licence n'est facturé pour l'utilisation des hits en recherche et développement ou en production.
DELDATA fournit des informations complètes et détaillées sur tous les hits obtenus à partir du criblage de DYNA002. Cet ensemble de données sert de catalyseur pour le développement de modèles prédictifs avancés, d'algorithmes d'optimisation et de stratégies d'apprentissage machine pour la découverte de leads grâce à l'intelligence artificielle (IA).
Comment fonctionnent les DEL ?
Dans une chimiothèque codée par ADN, chaque structure chimique est associée à une séquence d'ADN unique qui sert de code-barres. Cette étiquette d'ADN code des informations sur la structure chimique associée ; chaque structure peut donc être identifiée de façon unique. Cette technique permet de créer de vastes chimiothèques de structures différentes. Au cours du processus de criblage, la chimiothèque est exposée à une protéine cible, telle qu'une enzyme ou un récepteur impliqué(e) dans une maladie. Les structures chimiques qui se lient à la cible s'y fixent avec leurs étiquettes d'ADN. Après l'étape de liaison, les structures qui ne se sont pas liées sont éliminées par lavage, ne laissant que les structures qui ont réussi à se lier à la cible. Un séquençage de nouvelle génération est ensuite réalisé sur les étiquettes d'ADN des structures qui ont réussi à se lier à la cible, permettant ainsi d'identifier celles qui ont interagi avec la cible et de révéler de potentiels médicaments candidats.
Principaux avantages
- Accroissement de la diversité chimique : Les DEL donnent accès à une vaste diversité chimique en raison du grand nombre de composés qui peuvent être codés et criblés simultanément. Cette diversité permet d'explorer une large proportion de l'espace chimique, augmentant les chances d'identifier de nouveaux composés puissants.
- Criblage à haut débit : Les DEL permettent de cribler en une seule expérience des millions et mêmes des milliards de composés, ce qui permet d'identifier rapidement des hits. Cette capacité de criblage à haut débit accélère le processus de découverte de leads et réduit le temps nécessaire pour identifier de potentiels médicaments candidats.
- Efficacité en termes de coûts et de délais : Recourir aux chimiothèques codées par ADN réduit la quantité de matière nécessaire au criblage et permet de ne plus avoir à purifier et manipuler chacun des composés, ce qui simplifie le workflow et réduit au maximum les coûts.
Applications des DEL
Les DEL sont précieuses pour les études de validation de cible, car elles permettent aux chercheurs d'identifier et de valider les cibles thérapeutiques potentielles. De plus, les DEL peuvent être utilisées pour produire des leads à partir de fragments, situation dans laquelle des fragments de petites molécules sont criblés par rapport à une cible d'intérêt afin d'identifier des leads en vue d'une optimisation ultérieure. En outre, les chimiothèques codées par ADN se sont révélées utiles dans la recherche en biologie chimique pour comprendre les interactions des cibles, identifier les interactions protéine-protéine et explorer un nouvel espace chimique.
Ressources apparentées
- Fragment-Based DNA-Encoded Library
Dynamic Library technology in drug discovery delivers reliable results with high chemical diversity, suitable for various targets.
- Future of Drug Discovery with DNA Encoded Libraries
DNA encoded libraries (DELs) offer a paradigm shift in drug discovery by leveraging molecular biology and high-throughput screening. DELs offer a full high-throughput screening library in one vial. Along with our DEL data package, machine learning and AI can be utilized to determine even more information on targets.
- /deepweb/assets/sigmaaldrich/marketing/global/documents/102/108/acta-52-3-ms.pdf
Aldrichimica Acta issue focused on DNA-Encoded Libraries
- Shaping the Future of Drug Discovery with DNA-Encoded Libraries
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