A6013

Agarose

Type I, low EEO

• Synonyme(s) : 3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan, Agarose LE
• Numéro CAS: 9012-36-6
• Numéro CE : 232-731-8
• Numéro MDL: MFCD00081294
• Code UNSPSC : 41105317
• ID de substance PubChem : 24891047
• Nomenclature NACRES : NA.25

Propriétés

• Source biologique: algae (Gelidium & Gracilaria)
• Niveau de qualité: 200
• Type: Type I
• Forme: powder
• Technique(s): electrophoresis: suitable
• Impuretés: ≤10% water
• EEO: 0.09-0.13
• Température de transition: gel point 36 °C ±1.5 °C (1.5% gel)
• Résistance du gel: ≥1200 g/cm² (1% gel)
• Traces d'anions: sulfate (SO₄^2-): ≤0.15%
• Adéquation: suitable for electrophoresis
• InChI: 1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
• Clé InChI: MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Description

Description générale

Agarose is a polymer isolated from red seaweed, from the species Gelidium and Gracilaria, and it is commonly used for the separation of nucleic acids. Type I agarose is often utilized in molecular biology to make agarose gels for electrophoresis, a technique used to separate and analyze DNA or RNA fragments or proteins based on their size. Agarose may also be used in plant cell culture to create hydrogels, which are gel-like materials that provide a three-dimensional matrix. This provides a supportive and biocompatible environment for plant cells, this mimics physiological conditions and conducts experiments in vivo. They are versatile for various applications in plant biology, such as studying cell growth, tissue culture, and analyzing plant responses to different stimuli.

Application

Type 1 Agarose is commonly utilized for molecular biology:

• for gel electrophoresis of DNA and RNA molecules
• for agarose overlay in cell culture, to measure antibacterial activity by radial diffusion
• for agarose overlay in cell culture for radio immunodiffusion assays to quantify antigens
• for agarose overlay in plaque assays to determine viral titer
• to prepare agarose hydrogel that encapsulates a viscous media for 3D cell culture
• as an ingredient of human-tissue-like MRI phantoms
• for diagnostic to analyze patient samples for MRSA genome using pulsed-field gel electrophoresis

Caractéristiques et avantages

• Low EEO agarose is useful for routine analysis of nucleic acids
• Suitable for electrophoresis: DNase & RNase free
• Suitable for plant cell culture
• Suitable for mammalian cell culture

Remarque sur l'analyse

Nos agaroses ont les propriétés suivantes :
Teneur en sulfates : sert d'indicateur de pureté, le sulfate étant le principal groupement ionique présent.
Force du gel : équivaut à la force qu'il faut appliquer sur le gel pour le rompre.
Point de gélification : correspond à la température à laquelle une solution aqueuse d'agarose forme un gel en refroidissant. Les solutions d'agarose présentent une hystérésis lorsqu'elles passent de la forme liquide à la forme gélifiée, ce qui signifie que leur point de gélification n'est pas égal à leur température de fusion.
Électro-endosmose (EEO) : définit un mouvement de liquide à travers le gel. Les groupements anioniques d'un gel d'agarose sont fixés à la matrice et ne peuvent pas bouger, mais les contre-ions positifs dissociables peuvent migrer dans la matrice en direction de la cathode, créant ainsi une EEO. Comme le déplacement électrophorétique des biopolymères se fait généralement vers l'anode, l'EEO peut perturber les séparations en raison d'une convection interne.

Autres remarques

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Informations sur la sécurité

• Code de la classe de stockage: 11 - Combustible Solids
• Classe de danger pour l'eau (WGK): WGK 1
• Point d'éclair (°F): Not applicable
• Point d'éclair (°C): Not applicable
• Équipement de protection individuelle: Eyeshields, Gloves, type N95 (US)