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Metabolomic analysis of avocado fruits by GC-APCI-TOF MS: effects of ripening degrees and fruit varieties.

Analytical and bioanalytical chemistry (2014-11-10)
E Hurtado-Fernández, T Pacchiarotta, O A Mayboroda, A Fernández-Gutiérrez, A Carrasco-Pancorbo
RÉSUMÉ

In order to investigate avocado fruit ripening, nontargeted GC-APCI-TOF MS metabolic profiling analyses were carried out. Principal component analysis (PCA) and partial least squares discriminant analysis (PLS-DA) were used to explore the metabolic profiles from fruit samples of 13 varieties at two different ripening degrees. Mannoheptulose; pentadecylfuran; aspartic, malic, stearic, citric and pantothenic acids; mannitol; and β-sitosterol were some of the metabolites found as more influential for the PLS-DA model. The similarities among genetically related samples (putative mutants of "Hass") and their metabolic differences from the rest of the varieties under study have also been evaluated. The achieved results reveal new insights into avocado fruit composition and metabolite changes, demonstrating therefore the value of metabolomics as a functional genomics tool in characterizing the mechanism of fruit ripening development, a key developmental stage in most economically important fruit crops.

MATÉRIAUX
Référence du produit
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Description du produit

Sigma-Aldrich
Pyridine, ACS reagent, ≥99.0%
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Sigma-Aldrich
Pyridine, suitable for HPLC, ≥99.9%
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Supelco
N,O-Bis(triméthylsilyl)trifluoroacétamide avec triméthylchlorosilane, with 1% trimethylchlorosilane, for GC derivatization, LiChropur
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Quantité
Sigma-Aldrich
Chlorotrimethylsilane, ≥98.0% (GC)
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Quantité
Sigma-Aldrich
Chlorotrimethylsilane, purified by redistillation, ≥99%
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Quantité
Sigma-Aldrich
N,O-Bis(triméthylsilyl)trifluoroacétamide, ≥99%
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Quantité
Sigma-Aldrich
Pyridine, ≥99%
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Quantité
Sigma-Aldrich
Pyridine, biotech. grade, ≥99.9%
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Quantité
Sigma-Aldrich
Chlorotrimethylsilane, produced by Wacker Chemie AG, Burghausen, Germany, ≥99.0% (GC)
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Quantité
Supelco
Pyridine, Pharmaceutical Secondary Standard; Certified Reference Material
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Quantité
Supelco
N,O-Bis(triméthylsilyl)trifluoroacétamide avec triméthylchlorosilane, for GC derivatization, LiChropur, contains 1% TMCS, 99% (excluding TMCS)
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Prix
Quantité
Supelco
N,O-Bis(triméthylsilyl)trifluoroacétamide, for GC derivatization, LiChropur, ≥99.0%
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Quantité
Sigma-Aldrich
Chlorotrimethylsilane, puriss., ≥99.0% (GC)
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Quantité
Sigma-Aldrich
Chlorotrimethylsilane solution, 1.0 M in THF
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Disponibilité
Prix
Quantité
Supelco
Chlorotrimethylsilane, for GC derivatization, LiChropur, ≥99.0% (GC)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Supelco
Pyridine, analytical standard
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Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Supelco
N,O-Bis(triméthylsilyl)trifluoroacétamide avec triméthylchlorosilane, for GC derivatization, LiChropur, contains 10% TMCS, 98% (excluding TMCS)
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Quantité
Supelco
Metolachlor OA, PESTANAL®, analytical standard
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