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Ethidiumbromid

for fluorescence, ≥95.0% (HPLC)

• Synonym(e): 3,8-Diamino-5-ethyl-6-phenyl-phenanthridiniumbromid, EtBr, Homidiumbromid
• Empirische Formel (Hill-System): C₂₁H₂₀BrN₃
• CAS-Nummer: 1239-45-8
• Molekulargewicht: 394.31
• Beilstein: 3642536
• EG-Nummer: 214-984-6
• MDL-Nummer: MFCD00011724
• UNSPSC-Code: 12352200
• PubChem Substanz-ID: 57650683

Eigenschaften

• Qualität: for fluorescence
• Assay: ≥95.0% (HPLC)
• mp (Schmelzpunkt): 260-262 °C (dec.) (lit.)
• Löslichkeit: H₂O: 10 mg/mL, opaque, very dark red
• Fluoreszenz: λ_ex 480 nm; λ_em 620 nm in H₂O; λ_ex 530 nm; λ_em 600 nm in 50 mM phosphate buffer pH 7.0 (upon binding to DNA)
• SMILES String: [Br-].CC[n+]1c(-c2ccccc2)c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc14
• InChI: 1S/C21H19N3.BrH/c1-2-24-20-13-16(23)9-11-18(20)17-10-8-15(22)12-19(17)21(24)14-6-4-3-5-7-14;/h3-13,23H,2,22H2,1H3;1H
• InChIKey: ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N

Beschreibung

Allgemeine Beschreibung

Ethidium bromide (EtBr) undergoes complexation with nucleic acids (DNA and RNA) specifically to the saturated sites. These complexes decomposes by employing a cation-exchange resin. It has been reported to inhibit the production of mitochondrial RNA in HeLa cells. On interaction with helical polynucleotides under high salt medium, it forms fluorescent complex (having high fluorescence quantum yield).

Anwendung

Ethidiumbromid (EtBr) ist der am häufigsten verwendete Nukleinsäurefarbstoff für PAGE oder Agarose-Gel-Elektrophorese. Es ist in verschiedenen Formen, wie einer 10mg/ml Lösung, als 10 oder 100 mg Tabletten oder als Pulver erhältlich. Die Tabletten und die Lösung helfen, die Exposition einer potentiell toxischen Chemikalie zu verringern. Ethidiumbromid interkaliert doppelsträngige DNA und RNA. Die Fluorszenz des Ethidiumbromid steigert sich um das 21-fache bei der Bindung an doppelsträngige RNA und um das 25-fache bei der Bindung an doppelsträngige DNA, so dass eine Entfärbung des Hintergrunds bei einer geringen Farbstoffkonzentration (10 μg/ml) nicht notwendig ist. Ethidiumbromid wurde für eine Reihe von fluorimetrischen Analysen von Nukleinsäuren verwendet. Es hat sich gezeigt, dass es auch an einsträngige DNA (wenn auch nicht so stark) und an dreisträngige DNA bindet.

Ethidium bromide has been used to prepare fluorescent stock solution for the evaluation of cell viability during the live/dead assay of adipose-derived stem cells (ADSCs) seeded on irradiated hydrogels.

Biochem./physiol. Wirkung

Ethidiumbromid ist eine Nukleinsäure-interkalierendes Agens und frameshift-mutagen. Es kann auch in Verbindung mit Acridin-Orange zur Unterscheidung zwischen wachstumsfähigen, apoptotischen und nekrotischen Zellen verwendet werden.

Rekonstituierung

Um ein Gel nach der Elektrophorese anzufärben, verdünnt man eine Probe der Stammlösung auf 0,5 μg/ml Wasser und erwärmt 15-30 min lang. Eine Entfärbung ist normalerweise nicht notwendig, kann jedoch in Wasser 15min lang durchgeführt werden, falls der Hintergrund zu stark gefärbt ist. Die DNA-Banden können in einer UV-Licht-Box (254 nm Wellenlänge) detektiert werden. Ethidiumbromid kann auch zu Gel und Laufpuffer zugegeben (0,5 μg/ml) und direkt nach der Elektrophorese sichtbar gemacht werden.

Sonstige Hinweise

Intercalating agent and fluorescent label for DNA. Review; Destruction and decontamination of solutions

Sicherheitshinweise

• Piktogramme: GHS06,GHS08
• Signalwort: Danger
• H-Sätze: H302,H330,H341
• P-Sätze: P202 - P260 - P264 - P270 - P301 + P312 - P304 + P340 + P310
• Gefahreneinstufungen: Acute Tox. 1 Inhalation - Acute Tox. 4 Oral - Muta. 2
• Lagerklassenschlüssel: 6.1A - Combustible acute toxic Cat. 1 and 2 / very toxic hazardous materials
• WGK: WGK 1
• Flammpunkt (°F): Not applicable
• Flammpunkt (°C): Not applicable
• Persönliche Schutzausrüstung: Eyeshields, Faceshields, Gloves, type P3 (EN 143) respirator cartridges